232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0493 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0493  ribosomal protein L35  100 
 
 		 63 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1839  50S ribosomal protein L35  85.25 
 
 		 63 aa  104  5e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0346  50S ribosomal protein L35  85.25 
 
 		 63 aa  103  8e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0114  50S ribosomal protein L35  82.26 
 
 		 63 aa  102  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0294  50S ribosomal protein L35  72.13 
 
 		 63 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0034  50S ribosomal protein L35  72.13 
 
 		 63 aa  85.9  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0269  50S ribosomal protein L35  72.13 
 
 		 63 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0241  50S ribosomal protein L35  70.49 
 
 		 63 aa  84  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0083  ribosomal protein L35  65.08 
 
 		 64 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000192427  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  61.29 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  61.29 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2380  ribosomal protein L35  59.02 
 
 		 64 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2164  50S ribosomal protein L35  59.02 
 
 		 64 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000105441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1933  50S ribosomal protein L35  59.02 
 
 		 64 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000771602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2506  50S ribosomal protein L35  55.74 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28670  50S ribosomal protein L35  55.74 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000017021 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2467  50S ribosomal protein L35  55.74 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3479  50S ribosomal protein L35  55.74 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0370445  normal  0.0138501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3223  50S ribosomal protein L35  55.74 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1978  50S ribosomal protein L35  55.74 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378736  normal  0.0703875 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 68 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20440  50S ribosomal protein L35  54.1 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.836721  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1969  50S ribosomal protein L35  55.74 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00375988  hitchhiker  0.00635162 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  55.56 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1998  50S ribosomal protein L35  60.34 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0506186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  57.14 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2059  ribosomal protein L35  53.33 
 
 		 63 aa  60.1  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.617937  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2301  50S ribosomal protein L35  58.62 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000837102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2318  50S ribosomal protein L35  58.62 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144382  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  54.84 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  57.63 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1277  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147861  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1162  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245099  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1886  50S ribosomal protein L35P  53.23 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101932 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1318  ribosomal protein L35  49.18 
 
 		 64 aa  57  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.35652  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  57  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  57  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  54.1 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3091  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.848097  normal  0.0845178 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  57.63 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1579  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0206  50S ribosomal protein L35  57.38 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  66.67 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1579  50S ribosomal protein L35  50.82 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2016  50S ribosomal protein L35  54.1 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000210298  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2301  50S ribosomal protein L35  54.1 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2104  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365417  normal  0.232505 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1975  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1957  50S ribosomal protein L35  54.1 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  normal  0.347549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2019  50S ribosomal protein L35  54.1 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101706  normal  0.0487659 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1645  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354073  normal  0.121255 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2045  50S ribosomal protein L35  54.1 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000199534  hitchhiker  0.00708309 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1767  50S ribosomal protein L35  54.1 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852967  normal  0.0187188 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2852  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0103934 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  45.16 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2489  50S ribosomal protein L35  52.46 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000637036  hitchhiker  0.0000746157 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2186  50S ribosomal protein L35  52.46 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000722256  normal  0.0355999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2328  50S ribosomal protein L35  52.46 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000825235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4614  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.0110084 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  48.39 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1707  50S ribosomal protein L35  52.46 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0213276  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2220  50S ribosomal protein L35  52.46 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2026  50S ribosomal protein L35  52.46 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0783263  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2150  50S ribosomal protein L35  52.46 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000191739  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2637  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.163287  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1872  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742216  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1747  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 67 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635626 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1801  50S ribosomal protein L35  47.54 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00132404  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 81 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2122  50S ribosomal protein L35  52.46 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000215801  normal  0.0294636 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  55.93 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1892  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4617  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00520028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0995  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1737  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.713888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>