242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0083 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0083  ribosomal protein L35  100 
 
 		 64 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000192427  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0114  50S ribosomal protein L35  69.35 
 
 		 63 aa  89.4  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0346  50S ribosomal protein L35  70.49 
 
 		 63 aa  84.3  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1839  50S ribosomal protein L35  68.85 
 
 		 63 aa  84  6e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0241  50S ribosomal protein L35  65.57 
 
 		 63 aa  80.5  0.000000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0294  50S ribosomal protein L35  65.57 
 
 		 63 aa  79.3  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0269  50S ribosomal protein L35  65.57 
 
 		 63 aa  79.3  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0034  50S ribosomal protein L35  63.93 
 
 		 63 aa  78.2  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0493  ribosomal protein L35  65.08 
 
 		 63 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  56.45 
 
 		 65 aa  62  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  56.9 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  55.56 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1998  50S ribosomal protein L35  56.9 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0506186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0206  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 63 aa  57.8  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  58.06 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  56.9 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  53.85 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  55.17 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2301  50S ribosomal protein L35  55.17 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000837102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  56.9 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1801  50S ribosomal protein L35  47.54 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00132404  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  55.56 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2768  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2641  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2380  ribosomal protein L35  52.46 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2164  50S ribosomal protein L35  52.46 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000105441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1933  50S ribosomal protein L35  52.46 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000771602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  53.45 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1318  ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.35652  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2318  50S ribosomal protein L35  53.45 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144382  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 66 aa  52  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1737  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.713888  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1094  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0139822  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1277  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147861  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1892  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4617  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00520028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1556  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1714  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143899  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2593  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1454  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1162  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245099  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0995  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1401  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1477  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567723  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1537  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689804  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2467  50S ribosomal protein L35  50.82 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3223  50S ribosomal protein L35  50.82 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3479  50S ribosomal protein L35  50.82 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0370445  normal  0.0138501 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2506  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 64 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684912  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28670  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 64 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000017021 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  50.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>