More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0700 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0700  co-chaperonin GroES  100 
 
 
87 aa  167  5e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0190508  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0567  co-chaperonin GroES  71.26 
 
 
87 aa  129  1.0000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000722404  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0668  co-chaperonin GroES  74.71 
 
 
86 aa  124  3e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000199289  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0309  co-chaperonin GroES  72.41 
 
 
86 aa  122  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0556646  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1035  co-chaperonin GroES  67.82 
 
 
86 aa  117  4.9999999999999996e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.281335  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1355  co-chaperonin GroES  67.82 
 
 
86 aa  117  7e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00428249  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1233  co-chaperonin GroES  67.82 
 
 
86 aa  117  7e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000000377642  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0510  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 
86 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0632  co-chaperonin GroES  59.77 
 
 
86 aa  107  7.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000449182  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0756  chaperonin Cpn10  62.92 
 
 
88 aa  102  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.544888  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2295  chaperonin Cpn10  51.69 
 
 
88 aa  85.1  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2494  chaperonin Cpn10  44.19 
 
 
87 aa  81.3  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000670366  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02000  Chaperonin GroES (HSP10)  44.09 
 
 
94 aa  80.9  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0662925  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  43.75 
 
 
96 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  43.75 
 
 
96 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0161  chaperonin Cpn10  45.83 
 
 
104 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327073  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2346  chaperonin Cpn10  43.75 
 
 
95 aa  78.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00216658  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  48.42 
 
 
96 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  47.37 
 
 
96 aa  78.6  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  48.42 
 
 
96 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  44.79 
 
 
96 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  47.37 
 
 
95 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  43.75 
 
 
96 aa  77.8  0.00000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0489  chaperonin Cpn10  45.45 
 
 
100 aa  77.8  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000458511  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  43.75 
 
 
127 aa  77.8  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1485  co-chaperonin GroES  43.62 
 
 
94 aa  77  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00014757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3429  chaperonin, 10 kDa  43.75 
 
 
105 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000999948  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3391  chaperonin, 10 kDa  43.75 
 
 
105 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3425  chaperonin, 10 kDa  43.75 
 
 
105 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  50.53 
 
 
96 aa  77  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  45.26 
 
 
95 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 
95 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1705  chaperonin, 10 kDa subunit  46.32 
 
 
96 aa  76.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1076  chaperonin Cpn10  40.62 
 
 
98 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.12184  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  48.42 
 
 
95 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0316  chaperonin Cpn10  47.78 
 
 
92 aa  75.9  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0011552  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  44.21 
 
 
96 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  44.21 
 
 
96 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3082  chaperonin Cpn10  42.71 
 
 
105 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1501  chaperonin Cpn10  38.3 
 
 
93 aa  75.5  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00381683  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3428  chaperonin Cpn10  42.71 
 
 
105 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2431  chaperonin, 10 kDa  42.71 
 
 
105 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.564469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  47.31 
 
 
94 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  43.16 
 
 
95 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2616  chaperonin, 10 kDa  42.71 
 
 
105 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804052  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  44.68 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00675  co-chaperonin GroES  50 
 
 
91 aa  75.1  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  49.47 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0344  chaperonin, 10 kDa  42.71 
 
 
105 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272822  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1205  chaperonin, 10 kDa  42.71 
 
 
105 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  41.67 
 
 
96 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5254  chaperonin Cpn10  41.67 
 
 
105 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.321205  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6097  chaperonin Cpn10  43.75 
 
 
105 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3678  chaperonin Cpn10  41.67 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00275768  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  43.75 
 
 
95 aa  74.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 
95 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6393  chaperonin Cpn10  43.75 
 
 
105 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673453  normal  0.108093 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  45.16 
 
 
94 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  45.16 
 
 
94 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6726  chaperonin Cpn10  40.62 
 
 
105 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1844  co-chaperonin GroES  46.67 
 
 
91 aa  73.9  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2610  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  40.62 
 
 
105 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000523216  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4543  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  40.62 
 
 
105 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000123576  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2778  chaperonin Cpn10  39.58 
 
 
98 aa  73.9  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2345  co-chaperonin GroES  42.71 
 
 
96 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000286758  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  44.09 
 
 
94 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  44.09 
 
 
94 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  44.09 
 
 
94 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  44.09 
 
 
94 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  44.09 
 
 
94 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2771  10 Kd chaperone GroES  45.83 
 
 
95 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.05146e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  44.79 
 
 
95 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  44.09 
 
 
94 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2031  co-chaperonin GroES  42.71 
 
 
95 aa  73.6  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.133549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  44.09 
 
 
94 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2053  chaperonin Cpn10  45.26 
 
 
98 aa  73.2  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_002950  PG0521  co-chaperonin GroES  47.78 
 
 
89 aa  72.8  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.125145 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  45.26 
 
 
96 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  44.21 
 
 
96 aa  72.8  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2615  co-chaperonin GroES  42.71 
 
 
96 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  42.11 
 
 
96 aa  72.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  47.37 
 
 
96 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  47.31 
 
 
98 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3452  co-chaperonin GroES  42.71 
 
 
96 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225017  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1581  chaperonin Cpn10  40.62 
 
 
105 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5272  co-chaperonin GroES  42.71 
 
 
96 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6250  chaperonin Cpn10  40.62 
 
 
105 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.646299 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6590  chaperonin Cpn10  45.83 
 
 
96 aa  73.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.870394  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2191  co-chaperonin GroES  44.21 
 
 
105 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  44.68 
 
 
97 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2922  co-chaperonin GroES  42.71 
 
 
96 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000127335  n/a   
 
 
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  44.68 
 
 
97 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  45.26 
 
 
96 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6246  chaperonin Cpn10  45.56 
 
 
93 aa  72  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  42.11 
 
 
104 aa  72  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  44.68 
 
 
97 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  42.11 
 
 
104 aa  72  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0146  10 kDa chaperonin GroS  44.21 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735087  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  44.21 
 
 
95 aa  72  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  42.11 
 
 
96 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>