More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6590 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6590  chaperonin Cpn10  100 
 
 		 96 aa  186  9e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.870394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  70.21 
 
 		 97 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  70.21 
 
 		 97 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  70.21 
 
 		 97 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  70.21 
 
 		 97 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 96 aa  136  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  63.83 
 
 		 95 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 		 95 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  67.02 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  63.16 
 
 		 104 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0161  chaperonin Cpn10  63.16 
 
 		 104 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327073  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5848  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 		 104 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  67.02 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 		 96 aa  128  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 		 95 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1705  chaperonin, 10 kDa subunit  60.42 
 
 		 96 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  62.5 
 
 		 96 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 		 95 aa  127  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 95 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 127 aa  126  8.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0291  Chaperonin Cpn10  63.16 
 
 		 96 aa  126  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0587447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5039  chaperonin Cpn10  62.11 
 
 		 104 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 		 95 aa  126  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 96 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 96 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2771  10 Kd chaperone GroES  62.11 
 
 		 95 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.05146e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  61.46 
 
 		 96 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 		 96 aa  126  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0034  chaperonin Cpn10  64.89 
 
 		 95 aa  126  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0295415  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5829  10 KD chaperonin (protein CPN10)  65.93 
 
 		 98 aa  126  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0158717  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 96 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  63.83 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1098  chaperonin Cpn10/GroES  63.83 
 
 		 101 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000000347589  hitchhiker  0.000183313 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0605  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.131818 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  63.16 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 104 aa  125  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 		 95 aa  124  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  63.16 
 
 		 96 aa  124  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  59.38 
 
 		 104 aa  125  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 		 95 aa  125  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  60 
 
 		 95 aa  124  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  58.33 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  60.64 
 
 		 95 aa  124  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 		 96 aa  124  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 95 aa  123  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 95 aa  123  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 		 95 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0740  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 		 95 aa  122  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  59.38 
 
 		 96 aa  122  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2520  chaperone Hsp10, part of GroE chaperone system  62.77 
 
 		 95 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691961  normal  0.971453 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  61.54 
 
 		 98 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4586  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 95 aa  122  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.480478 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2922  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000127335  n/a   
 
 
 
NC_009485  BBta_3033  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2190  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 95 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  61.54 
 
 		 98 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2346  chaperonin Cpn10  58.95 
 
 		 95 aa  122  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00216658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0471  co-chaperonin GroES  60.44 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0516  co-chaperonin GroES  60.44 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  59.38 
 
 		 104 aa  121  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  63.74 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3096  chaperonin Cpn10  59.38 
 
 		 104 aa  121  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2310  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 		 95 aa  120  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 		 95 aa  120  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0984  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 		 95 aa  120  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3027  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 		 121 aa  120  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0196  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 98 aa  120  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 95 aa  120  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3429  chaperonin, 10 kDa  57.89 
 
 		 105 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000999948  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3391  chaperonin, 10 kDa  57.89 
 
 		 105 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6097  chaperonin Cpn10  56.25 
 
 		 105 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3425  chaperonin, 10 kDa  57.89 
 
 		 105 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6393  chaperonin Cpn10  56.25 
 
 		 105 aa  120  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673453  normal  0.108093 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 104 aa  120  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 95 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 		 95 aa  119  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 		 95 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  57.29 
 
 		 104 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  54.74 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0178  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 98 aa  118  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000749715  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3428  chaperonin Cpn10  55.21 
 
 		 105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3082  chaperonin Cpn10  55.21 
 
 		 105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 96 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2191  co-chaperonin GroES  56.25 
 
 		 105 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  56.25 
 
 		 104 aa  117  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 		 98 aa  117  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2431  chaperonin, 10 kDa  55.79 
 
 		 105 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.564469  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 96 aa  116  9e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0344  chaperonin, 10 kDa  55.79 
 
 		 105 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272822  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1205  chaperonin, 10 kDa  55.79 
 
 		 105 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2616  chaperonin, 10 kDa  55.79 
 
 		 105 aa  116  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>