More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0632 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0632  co-chaperonin GroES  100 
 
 		 86 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000449182  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0510  co-chaperonin GroES  63.95 
 
 		 86 aa  120  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1355  co-chaperonin GroES  63.95 
 
 		 86 aa  120  6e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00428249  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1233  co-chaperonin GroES  63.95 
 
 		 86 aa  120  6e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000000377642  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1035  co-chaperonin GroES  62.79 
 
 		 86 aa  120  9e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.281335  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0309  co-chaperonin GroES  61.63 
 
 		 86 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0556646  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0668  co-chaperonin GroES  61.63 
 
 		 86 aa  112  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000199289  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0567  co-chaperonin GroES  62.07 
 
 		 87 aa  107  5e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000722404  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0756  chaperonin Cpn10  56.82 
 
 		 88 aa  107  5e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.544888  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0700  co-chaperonin GroES  59.77 
 
 		 87 aa  107  7.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0190508  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  50.53 
 
 		 96 aa  97.4  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  50.53 
 
 		 96 aa  97.1  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  50.53 
 
 		 96 aa  97.1  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 95 aa  95.9  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0605  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 		 95 aa  95.5  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.131818 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 105 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 105 aa  94.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 98 aa  94.4  5e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  48.42 
 
 		 95 aa  94.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 		 95 aa  94.4  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 96 aa  94  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 		 95 aa  93.6  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2920  chaperonin 10 Kd subunit  52.13 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.907264  normal  0.269903 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3359  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 95 aa  93.6  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.755845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  48.94 
 
 		 96 aa  93.6  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  48.94 
 
 		 95 aa  93.6  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3082  chaperonin Cpn10  46.32 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5254  chaperonin Cpn10  46.32 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.321205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4586  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 95 aa  93.2  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.480478 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3428  chaperonin Cpn10  46.32 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0471  co-chaperonin GroES  50.54 
 
 		 98 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0291  Chaperonin Cpn10  50.53 
 
 		 96 aa  92.8  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0587447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0516  co-chaperonin GroES  50.54 
 
 		 98 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1177  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 		 105 aa  92  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.510717  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2295  chaperonin Cpn10  49.43 
 
 		 88 aa  92  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0678  co-chaperonin GroES  47.37 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6097  chaperonin Cpn10  46.32 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3429  chaperonin, 10 kDa  43.16 
 
 		 105 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000999948  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3425  chaperonin, 10 kDa  43.16 
 
 		 105 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2610  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  46.32 
 
 		 105 aa  92  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000523216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2520  chaperone Hsp10, part of GroE chaperone system  47.87 
 
 		 95 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691961  normal  0.971453 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4543  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  46.32 
 
 		 105 aa  92  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000123576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3391  chaperonin, 10 kDa  43.16 
 
 		 105 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 95 aa  91.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  50.54 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0700  co-chaperonin GroES  47.37 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.0126966 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  49.46 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  49.46 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0344  chaperonin, 10 kDa  43.16 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272822  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2616  chaperonin, 10 kDa  43.16 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1205  chaperonin, 10 kDa  43.16 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2431  chaperonin, 10 kDa  43.16 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.564469  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0034  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 		 95 aa  91.3  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0295415  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  47.37 
 
 		 104 aa  91.7  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6393  chaperonin Cpn10  46.32 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673453  normal  0.108093 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3027  chaperonin Cpn10  50 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6726  chaperonin Cpn10  44.21 
 
 		 105 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  49.48 
 
 		 95 aa  90.5  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3096  chaperonin Cpn10  46.81 
 
 		 104 aa  90.5  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0658  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 		 96 aa  90.5  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000000933767  decreased coverage  0.00156326 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 		 96 aa  90.5  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3171  co-chaperonin GroES  46.81 
 
 		 105 aa  90.1  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50399  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 		 96 aa  90.1  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 		 104 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1581  chaperonin Cpn10  44.21 
 
 		 105 aa  90.1  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6250  chaperonin Cpn10  44.21 
 
 		 105 aa  90.1  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.646299 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  45.26 
 
 		 96 aa  90.1  9e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  45.26 
 
 		 127 aa  90.1  9e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0296  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 		 97 aa  90.1  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018883  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0521  co-chaperonin GroES  48.31 
 
 		 89 aa  89.4  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.125145 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2191  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  46.81 
 
 		 95 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2345  co-chaperonin GroES  48.42 
 
 		 96 aa  89.4  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000286758  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  49.46 
 
 		 98 aa  89.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4126  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 		 98 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal  0.752904 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  47.37 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  47.37 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0427  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 		 96 aa  89  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874691  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2573  co-chaperonin GroES  48.39 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.320362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5829  10 KD chaperonin (protein CPN10)  49.46 
 
 		 98 aa  89.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0158717  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2190  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  46.81 
 
 		 96 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5848  chaperonin Cpn10  44.21 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  46.81 
 
 		 96 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  46.81 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0482  co-chaperonin GroES  45.74 
 
 		 96 aa  89.4  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  46.81 
 
 		 96 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  49.47 
 
 		 96 aa  89.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  45.26 
 
 		 96 aa  88.6  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3452  co-chaperonin GroES  44.68 
 
 		 96 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  47.31 
 
 		 98 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2566  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 		 96 aa  88.2  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000246528  normal  0.0576287 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3523  co-chaperonin GroES  44.68 
 
 		 96 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.907377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>