More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1035 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1035  co-chaperonin GroES  100 
 
 		 86 aa  169  1e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.281335  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0510  co-chaperonin GroES  81.4 
 
 		 86 aa  144  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1355  co-chaperonin GroES  80.23 
 
 		 86 aa  142  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00428249  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1233  co-chaperonin GroES  80.23 
 
 		 86 aa  142  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000000377642  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0309  co-chaperonin GroES  77.91 
 
 		 86 aa  137  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0556646  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0668  co-chaperonin GroES  74.42 
 
 		 86 aa  133  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000199289  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0632  co-chaperonin GroES  62.79 
 
 		 86 aa  120  9e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000449182  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0700  co-chaperonin GroES  67.82 
 
 		 87 aa  117  4.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0190508  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0756  chaperonin Cpn10  59.09 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.544888  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0567  co-chaperonin GroES  62.07 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000722404  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 96 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 		 96 aa  94  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 95 aa  94  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0296  chaperonin Cpn10  50 
 
 		 97 aa  94  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018883  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 		 95 aa  94  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 		 95 aa  92  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  46.81 
 
 		 95 aa  92.8  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  51.58 
 
 		 96 aa  92.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2295  chaperonin Cpn10  52.27 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3428  chaperonin Cpn10  47.92 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08630  Co-chaperonin GroES  51.06 
 
 		 98 aa  91.3  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3082  chaperonin Cpn10  47.92 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5254  chaperonin Cpn10  47.37 
 
 		 105 aa  90.9  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.321205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3429  chaperonin, 10 kDa  46.32 
 
 		 105 aa  90.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000999948  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3425  chaperonin, 10 kDa  46.32 
 
 		 105 aa  90.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3391  chaperonin, 10 kDa  46.32 
 
 		 105 aa  90.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  46.81 
 
 		 95 aa  90.5  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0291  Chaperonin Cpn10  47.37 
 
 		 96 aa  90.5  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0587447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 		 96 aa  90.5  8e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0034  chaperonin Cpn10  47.87 
 
 		 95 aa  90.5  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0295415  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 96 aa  90.5  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 		 96 aa  90.1  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2922  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 		 96 aa  90.1  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000127335  n/a   
 
 
 
NC_008254  Meso_3096  chaperonin Cpn10  47.87 
 
 		 104 aa  90.1  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  46.81 
 
 		 96 aa  90.1  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  47.87 
 
 		 95 aa  89.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6097  chaperonin Cpn10  47.37 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  45.74 
 
 		 105 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  46.81 
 
 		 104 aa  90.1  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  45.74 
 
 		 105 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 		 95 aa  89.4  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6393  chaperonin Cpn10  47.37 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673453  normal  0.108093 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4026  Chaperonin Cpn10  51.06 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0362  chaperonin Cpn10  54.35 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.686615  normal  0.421985 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6590  chaperonin Cpn10  48.42 
 
 		 96 aa  89.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.870394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2771  10 Kd chaperone GroES  49.47 
 
 		 95 aa  89.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.05146e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1501  chaperonin Cpn10  40.86 
 
 		 93 aa  89  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00381683  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  46.32 
 
 		 96 aa  89  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 96 aa  89.4  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5848  chaperonin Cpn10  46.32 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  46.81 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  45.74 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  48.42 
 
 		 96 aa  89.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 		 96 aa  88.2  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 		 96 aa  88.2  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  51.61 
 
 		 102 aa  88.6  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2345  co-chaperonin GroES  48.42 
 
 		 96 aa  88.2  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000286758  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 		 96 aa  88.6  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2610  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  47.37 
 
 		 105 aa  88.6  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000523216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4543  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  47.37 
 
 		 105 aa  88.6  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000123576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  48.39 
 
 		 94 aa  88.2  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1098  chaperonin Cpn10/GroES  49.45 
 
 		 101 aa  88.2  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000000347589  hitchhiker  0.000183313 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  43.16 
 
 		 104 aa  88.6  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0684  chaperonin Cpn10  51.09 
 
 		 98 aa  88.2  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0619  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 		 104 aa  88.2  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143984  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  49.47 
 
 		 97 aa  88.6  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  45.26 
 
 		 96 aa  87.8  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1407  chaperonin Cpn10  49.46 
 
 		 96 aa  87.8  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.780371 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28700  Co-chaperonin GroES  52.13 
 
 		 97 aa  87.8  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 95 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 95 aa  87.8  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  44.68 
 
 		 104 aa  87.8  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  46.81 
 
 		 96 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  48.39 
 
 		 97 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1154  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 		 103 aa  87.8  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  48.39 
 
 		 97 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  46.81 
 
 		 96 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0512  co-chaperonin GroES  49.46 
 
 		 94 aa  87.8  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  48.39 
 
 		 97 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  47.83 
 
 		 97 aa  87.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2431  chaperonin, 10 kDa  44.21 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.564469  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  45.74 
 
 		 96 aa  87.4  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1205  chaperonin, 10 kDa  44.21 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0344  chaperonin, 10 kDa  44.21 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272822  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2616  chaperonin, 10 kDa  44.21 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804052  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2494  chaperonin Cpn10  45.35 
 
 		 87 aa  87.4  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000670366  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  46.81 
 
 		 98 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0605  chaperonin Cpn10  46.81 
 
 		 95 aa  87.4  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.131818 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  45.26 
 
 		 95 aa  87  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  45.74 
 
 		 98 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6726  chaperonin Cpn10  44.21 
 
 		 105 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2599  10 kD chaperone  50 
 
 		 103 aa  86.7  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4126  co-chaperonin GroES  45.74 
 
 		 98 aa  87  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal  0.752904 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  46.24 
 
 		 98 aa  86.7  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  47.37 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1177  co-chaperonin GroES  43.62 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.510717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>