More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0309 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0309  co-chaperonin GroES  100 
 
 
86 aa  168  2e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0556646  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0668  co-chaperonin GroES  91.86 
 
 
86 aa  159  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000199289  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1035  co-chaperonin GroES  77.91 
 
 
86 aa  137  3e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.281335  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1355  co-chaperonin GroES  76.74 
 
 
86 aa  136  8.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00428249  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1233  co-chaperonin GroES  76.74 
 
 
86 aa  136  8.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000000377642  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0510  co-chaperonin GroES  75.58 
 
 
86 aa  135  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0756  chaperonin Cpn10  70.45 
 
 
88 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.544888  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0700  co-chaperonin GroES  72.41 
 
 
87 aa  122  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0190508  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0567  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 
87 aa  117  4.9999999999999996e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000722404  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0632  co-chaperonin GroES  61.63 
 
 
86 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000449182  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2295  chaperonin Cpn10  57.47 
 
 
88 aa  95.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  52.63 
 
 
96 aa  93.6  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  50.53 
 
 
95 aa  93.2  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  51.58 
 
 
96 aa  91.7  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0925  chaperonin Cpn10  50.53 
 
 
97 aa  89.4  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000344509  hitchhiker  7.97374e-18 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  50.53 
 
 
96 aa  89.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  48.96 
 
 
95 aa  89.4  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 
96 aa  89  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 
96 aa  89  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2494  chaperonin Cpn10  47.13 
 
 
87 aa  88.2  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000670366  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  48.42 
 
 
96 aa  88.6  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  45.74 
 
 
95 aa  88.2  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2771  10 Kd chaperone GroES  48.42 
 
 
95 aa  87.4  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.05146e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  48.42 
 
 
96 aa  87.4  6e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0161  chaperonin Cpn10  48.42 
 
 
104 aa  87.4  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327073  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  48.42 
 
 
127 aa  87.4  6e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0296  chaperonin Cpn10  48.94 
 
 
97 aa  87.4  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018883  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  46.81 
 
 
95 aa  87  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  50.53 
 
 
95 aa  87  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3096  chaperonin Cpn10  47.87 
 
 
104 aa  87  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  46.81 
 
 
105 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  47.37 
 
 
96 aa  86.7  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  47.37 
 
 
96 aa  86.7  9e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6590  chaperonin Cpn10  49.47 
 
 
96 aa  87  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.870394  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  46.81 
 
 
105 aa  87  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  49.47 
 
 
95 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  46.81 
 
 
104 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1501  chaperonin Cpn10  38.71 
 
 
93 aa  86.3  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00381683  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  47.37 
 
 
96 aa  86.3  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  45.26 
 
 
104 aa  86.7  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  48.39 
 
 
98 aa  86.7  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  47.37 
 
 
96 aa  86.3  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  47.37 
 
 
95 aa  85.5  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  46.32 
 
 
96 aa  85.5  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  44.21 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  45.74 
 
 
95 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  46.32 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  46.32 
 
 
96 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  46.81 
 
 
95 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  47.87 
 
 
96 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1705  chaperonin, 10 kDa subunit  50.53 
 
 
96 aa  85.1  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  46.32 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 
96 aa  85.1  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0291  Chaperonin Cpn10  48.42 
 
 
96 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0587447  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  45.74 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3033  co-chaperonin GroES  45.74 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960902  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 
96 aa  84.3  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  45.74 
 
 
96 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  46.81 
 
 
95 aa  84.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  44.68 
 
 
95 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5039  chaperonin Cpn10  45.26 
 
 
104 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747065  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  46.88 
 
 
94 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  44.68 
 
 
104 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  48.42 
 
 
96 aa  84  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  44.68 
 
 
96 aa  84  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  44.68 
 
 
96 aa  84  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  46.81 
 
 
98 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  44.68 
 
 
95 aa  84.3  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  44.68 
 
 
96 aa  84  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  48.42 
 
 
95 aa  84  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2891  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 
94 aa  84  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0619  chaperonin Cpn10  48.42 
 
 
96 aa  84  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  46.81 
 
 
95 aa  84  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  46.81 
 
 
95 aa  84  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  48.39 
 
 
94 aa  84  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  46.81 
 
 
97 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3429  chaperonin, 10 kDa  44.21 
 
 
105 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000999948  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 
95 aa  83.6  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5829  10 KD chaperonin (protein CPN10)  48.39 
 
 
98 aa  83.6  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0158717  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3391  chaperonin, 10 kDa  44.21 
 
 
105 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3425  chaperonin, 10 kDa  44.21 
 
 
105 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1177  co-chaperonin GroES  44.68 
 
 
105 aa  83.6  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.510717  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4026  Chaperonin Cpn10  50 
 
 
103 aa  83.6  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  45.83 
 
 
95 aa  82.8  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  46.81 
 
 
95 aa  82.8  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  46.24 
 
 
98 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07560  Co-chaperonin GroES  47.37 
 
 
98 aa  82.8  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371401  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  47.37 
 
 
94 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0605  chaperonin Cpn10  48.94 
 
 
95 aa  83.6  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.131818 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  48.42 
 
 
96 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0362  chaperonin Cpn10  51.09 
 
 
102 aa  82.8  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.686615  normal  0.421985 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2053  chaperonin Cpn10  46.81 
 
 
98 aa  83.2  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_002950  PG0521  co-chaperonin GroES  50.56 
 
 
89 aa  82.8  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.125145 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2566  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 
96 aa  82.4  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000246528  normal  0.0576287 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2922  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 
96 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000127335  n/a   
 
 
 
NC_011992  Dtpsy_0678  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 
96 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1407  chaperonin Cpn10  48.39 
 
 
96 aa  82.4  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.780371 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  47.37 
 
 
96 aa  82  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4126  co-chaperonin GroES  45.74 
 
 
98 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal  0.752904 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4586  co-chaperonin GroES  44.68 
 
 
95 aa  82.8  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.480478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>