More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1485 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1485  co-chaperonin GroES  100 
 
 		 94 aa  186  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00014757  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2104  co-chaperonin GroES  82.98 
 
 		 94 aa  161  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00575627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2067  co-chaperonin GroES  82.98 
 
 		 94 aa  161  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000661626  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  62.37 
 
 		 94 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  63.44 
 
 		 94 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  61.29 
 
 		 94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  61.29 
 
 		 94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  61.29 
 
 		 94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  61.29 
 
 		 94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  61.29 
 
 		 94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  61.29 
 
 		 94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  61.29 
 
 		 94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  61.29 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  60.22 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  60.22 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  55.91 
 
 		 98 aa  111  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0245  co-chaperonin GroES  61.29 
 
 		 94 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0545  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 94 aa  110  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000554341  normal  0.812353 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  54.84 
 
 		 98 aa  110  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  54.84 
 
 		 95 aa  110  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 		 96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 		 94 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2230  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3373  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0449  chaperonin Cpn10  50.54 
 
 		 95 aa  100  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00196884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 		 95 aa  100  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16550  Co-chaperonin GroES  47.83 
 
 		 98 aa  100  9e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.639377  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  49.46 
 
 		 96 aa  100  9e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3678  chaperonin Cpn10  50 
 
 		 100 aa  99.4  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00275768  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 		 94 aa  99.4  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  50 
 
 		 94 aa  98.6  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4453  chaperonin Cpn10  47.31 
 
 		 102 aa  98.6  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0353  co-chaperonin GroES  46.81 
 
 		 94 aa  97.8  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000711109  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  48.39 
 
 		 102 aa  97.8  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  48.39 
 
 		 104 aa  97.4  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3058  co-chaperonin GroES  46.24 
 
 		 98 aa  96.7  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.495905 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1719  chaperonin Cpn10  46.74 
 
 		 99 aa  96.3  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  46.81 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08630  Co-chaperonin GroES  50 
 
 		 98 aa  96.3  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1086  chaperonin Cpn10  47.31 
 
 		 98 aa  95.5  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.692359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2599  10 kD chaperone  48.42 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0619  chaperonin Cpn10  48.94 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143984  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1154  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  45.65 
 
 		 97 aa  95.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  46.24 
 
 		 96 aa  94.4  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4130  chaperonin Cpn10  47.87 
 
 		 101 aa  94.4  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  46.24 
 
 		 96 aa  94.4  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0439  co-chaperonin GroES  45.74 
 
 		 94 aa  94.4  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0684  chaperonin Cpn10  46.74 
 
 		 98 aa  94.4  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2523  chaperonin Cpn10  46.74 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0632  co-chaperonin GroES  47.31 
 
 		 101 aa  94  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0146  10 kDa chaperonin GroS  46.74 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1180  chaperonin Cpn10  46.24 
 
 		 127 aa  94  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0241756 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1153  chaperonin Cpn10  46.24 
 
 		 127 aa  94  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1170  chaperonin Cpn10  46.24 
 
 		 127 aa  94  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0489  chaperonin Cpn10  47.87 
 
 		 100 aa  93.6  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000458511  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1212  chaperonin Cpn10  47.87 
 
 		 101 aa  93.6  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.694559  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1705  chaperonin, 10 kDa subunit  48.94 
 
 		 96 aa  93.6  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1207  chaperonin Cpn10  46.67 
 
 		 99 aa  93.6  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.867572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  49.46 
 
 		 96 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28700  Co-chaperonin GroES  47.83 
 
 		 97 aa  93.2  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2314  co-chaperonin GroES  46.67 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  46.24 
 
 		 96 aa  92.8  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1007  chaperonin Cpn10  47.83 
 
 		 98 aa  92.8  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16161  co-chaperonin GroES  46.74 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.5001  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3429  chaperonin, 10 kDa  46.24 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000999948  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2170  co-chaperonin GroES  44.57 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.100099 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  47.31 
 
 		 95 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3391  chaperonin, 10 kDa  46.24 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3425  chaperonin, 10 kDa  46.24 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  44.57 
 
 		 97 aa  92.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2887  co-chaperonin GroES  46.74 
 
 		 97 aa  92  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0300428  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2346  chaperonin Cpn10  45.16 
 
 		 95 aa  92.8  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00216658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0362  chaperonin Cpn10  45.16 
 
 		 102 aa  92  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.686615  normal  0.421985 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2031  co-chaperonin GroES  49.46 
 
 		 95 aa  92.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.133549  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0344  chaperonin, 10 kDa  46.24 
 
 		 105 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272822  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2431  chaperonin, 10 kDa  46.24 
 
 		 105 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.564469  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3082  chaperonin Cpn10  48.39 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3428  chaperonin Cpn10  48.39 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2616  chaperonin, 10 kDa  46.24 
 
 		 105 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1205  chaperonin, 10 kDa  46.24 
 
 		 105 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00143  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 96 aa  92  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002224  heat shock protein 60 family co-chaperone GroES  48.94 
 
 		 96 aa  92  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  48.91 
 
 		 94 aa  91.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  44.09 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6544  chaperonin Cpn10  44.57 
 
 		 97 aa  91.3  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16271  co-chaperonin GroES  45.65 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  45.16 
 
 		 95 aa  91.7  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1530  co-chaperonin GroES  45.65 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13452  co-chaperonin GroES  44.09 
 
 		 100 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000956292  hitchhiker  0.00171205 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0898  chaperonin Cpn10  42.39 
 
 		 99 aa  91.3  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.520012  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  44.09 
 
 		 95 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6002  co-chaperonin GroES  46.24 
 
 		 101 aa  90.9  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0711534 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2595  co-chaperonin GroES  45.65 
 
 		 97 aa  90.9  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000536943 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2589  Chaperonin Cpn10  45.65 
 
 		 97 aa  90.9  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.565547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5254  chaperonin Cpn10  46.24 
 
 		 105 aa  90.5  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.321205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5138  co-chaperonin GroES  45.65 
 
 		 103 aa  90.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4925  co-chaperonin GroES  44.09 
 
 		 100 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6250  chaperonin Cpn10  45.16 
 
 		 105 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.646299 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1494  co-chaperonin GroES  44.09 
 
 		 100 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>