More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2778 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2778  chaperonin Cpn10  100 
 
 		 98 aa  194  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1076  chaperonin Cpn10  93.81 
 
 		 98 aa  184  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.12184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0489  chaperonin Cpn10  71.13 
 
 		 100 aa  145  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000458511  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1056  chaperonin Cpn10  81.44 
 
 		 97 aa  143  9e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.900711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1212  chaperonin Cpn10  69.07 
 
 		 101 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.694559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4130  chaperonin Cpn10  68.04 
 
 		 101 aa  136  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3678  chaperonin Cpn10  60.42 
 
 		 100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00275768  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 		 94 aa  122  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 		 94 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  60.82 
 
 		 96 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  57.73 
 
 		 96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3373  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 		 94 aa  117  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  58.76 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  58.76 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 94 aa  114  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  61.96 
 
 		 98 aa  114  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  54.64 
 
 		 104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  56.25 
 
 		 95 aa  114  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  57.73 
 
 		 105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  57.73 
 
 		 105 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  57.29 
 
 		 104 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0497  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 		 95 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000741059  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 95 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 		 104 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3033  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0541  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160733  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1789  co-chaperonin GroES  58.89 
 
 		 103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  56.12 
 
 		 104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1937  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 		 95 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000542677  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2573  co-chaperonin GroES  59.78 
 
 		 98 aa  111  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.320362  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  60.22 
 
 		 98 aa  111  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0564  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 		 95 aa  111  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  52.58 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3195  co-chaperonin GroES  58.7 
 
 		 98 aa  110  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2191  co-chaperonin GroES  56.7 
 
 		 105 aa  110  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  55.21 
 
 		 95 aa  110  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 		 95 aa  110  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 		 95 aa  110  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 		 95 aa  110  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2593  co-chaperonin GroES  55.67 
 
 		 105 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.458654  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  53.61 
 
 		 96 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  53.12 
 
 		 95 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0782  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 95 aa  110  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000134232  normal  0.229637 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3171  co-chaperonin GroES  54.64 
 
 		 105 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50399  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  60.22 
 
 		 98 aa  110  8.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 		 98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  56.25 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 		 98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  57.29 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5829  10 KD chaperonin (protein CPN10)  57.45 
 
 		 98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0158717  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  54.74 
 
 		 95 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0161  chaperonin Cpn10  57.29 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327073  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 		 98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 97 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 		 98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1919  chaperonin Cpn10  57.73 
 
 		 100 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0833  co-chaperonin GroES  52.63 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406281  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  53.12 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  54.74 
 
 		 95 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 98 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4126  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 		 98 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal  0.752904 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 98 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0679  co-chaperonin GroES  50.53 
 
 		 95 aa  108  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0272  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 96 aa  107  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  54.17 
 
 		 95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 97 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  54.74 
 
 		 95 aa  107  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5138  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 		 103 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 97 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 97 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0512  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 94 aa  107  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1177  co-chaperonin GroES  52.58 
 
 		 105 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.510717  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  54.17 
 
 		 104 aa  107  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 		 94 aa  106  8.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  51.55 
 
 		 96 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0145  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 		 103 aa  106  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  53.12 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  54.17 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2190  co-chaperonin GroES  55.21 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  54.64 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2310  co-chaperonin GroES  54.17 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0984  co-chaperonin GroES  54.17 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  52.04 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  52.63 
 
 		 95 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  52.63 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  52.63 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5039  chaperonin Cpn10  54.17 
 
 		 104 aa  104  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0471  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 98 aa  104  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1856  groes  54.64 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.70749  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0516  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 98 aa  104  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 95 aa  105  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>