47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2916 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2916  acetoacetate decarboxylase  100 
 
 		 252 aa  512  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1567  acetoacetate decarboxylase  97.62 
 
 		 252 aa  501  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984324  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0018  acetoacetate decarboxylase  81.3 
 
 		 246 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1525  acetoacetate decarboxylase  81.3 
 
 		 246 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0022  acetoacetate decarboxylase  81.3 
 
 		 246 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0020  acetoacetate decarboxylase  81.71 
 
 		 246 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0022  acetoacetate decarboxylase  81.3 
 
 		 313 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0024  acetoacetate decarboxylase  81.3 
 
 		 313 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0919679  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1448  acetoacetate decarboxylase  81.3 
 
 		 246 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1168  acetoacetate decarboxylase  81.3 
 
 		 313 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3126  acetoacetate decarboxylase  80.49 
 
 		 246 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898077  normal  0.894092 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4983  acetoacetate decarboxylase  80.49 
 
 		 246 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5311  acetoacetate decarboxylase  79.67 
 
 		 246 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4525  acetoacetate decarboxylase  80.08 
 
 		 246 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.39507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5714  acetoacetate decarboxylase  80.08 
 
 		 246 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176105  normal  0.138686 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5145  acetoacetate decarboxylase  80.08 
 
 		 246 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3166  acetoacetate decarboxylase  80.08 
 
 		 246 aa  418  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4271  acetoacetate decarboxylase  79.35 
 
 		 247 aa  407  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.13698  normal  0.618993 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4381  acetoacetate decarboxylase  79.35 
 
 		 247 aa  407  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.602468  normal  0.211813 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1058  acetoacetate decarboxylase  76.92 
 
 		 247 aa  395  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.595144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6203  acetoacetate decarboxylase  70.73 
 
 		 246 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.560172 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2695  acetoacetate decarboxylase  69.92 
 
 		 246 aa  363  2e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.537071  normal  0.885884 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0495  acetoacetate decarboxylase  70.61 
 
 		 245 aa  360  1e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1411  acetoacetate decarboxylase  71.04 
 
 		 263 aa  347  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305787  normal  0.188243 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5526  acetoacetate decarboxylase  67.34 
 
 		 267 aa  341  7e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.0278315 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2132  acetoacetate decarboxylase  66.39 
 
 		 249 aa  338  5e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2114  acetoacetate decarboxylase  64.4 
 
 		 250 aa  335  5e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5563  acetoacetate decarboxylase  64.29 
 
 		 259 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1397  acetoacetate decarboxylase  65.71 
 
 		 257 aa  328  6e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0671592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3919  acetoacetate decarboxylase  64.14 
 
 		 251 aa  325  6e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2412  acetoacetate decarboxylase  63.1 
 
 		 259 aa  322  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.652307 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0728  acetoacetate decarboxylase  59.18 
 
 		 254 aa  301  7.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0708  acetoacetate decarboxylase  59.59 
 
 		 254 aa  301  8.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01634  acetoacetate decarboxylase  60.17 
 
 		 273 aa  295  5e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1938  acetoacetate decarboxylase  54.1 
 
 		 245 aa  261  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.139691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3628  acetoacetate decarboxylase  52.82 
 
 		 248 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331441  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4592  acetoacetate decarboxylase  52.54 
 
 		 247 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7618  Acetoacetate decarboxylase  34.96 
 
 		 271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0117  Acetoacetate decarboxylase  37.45 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187521  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2286  Acetoacetate decarboxylase  28.43 
 
 		 280 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7640  hypothetical protein  26.64 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.323453 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0744  Acetoacetate decarboxylase  30.7 
 
 		 219 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1128  hypothetical protein  27.8 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.219472  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0763  acetoacetate decarboxylase  29.57 
 
 		 288 aa  45.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.325494  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5319  hypothetical protein  26.22 
 
 		 296 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.519767  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2366  hypothetical protein  31.52 
 
 		 268 aa  42.4  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.138399 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5523  Acetoacetate decarboxylase  28.06 
 
 		 297 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101923 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>