43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01634 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01634  acetoacetate decarboxylase  100 
 
 
273 aa  566  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0708  acetoacetate decarboxylase  61.44 
 
 
254 aa  306  3e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0728  acetoacetate decarboxylase  61.02 
 
 
254 aa  305  4.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0495  acetoacetate decarboxylase  59.17 
 
 
245 aa  300  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2916  acetoacetate decarboxylase  60.17 
 
 
252 aa  295  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1567  acetoacetate decarboxylase  59.24 
 
 
252 aa  293  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984324  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5145  acetoacetate decarboxylase  59.66 
 
 
246 aa  291  7e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5714  acetoacetate decarboxylase  59.66 
 
 
246 aa  291  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176105  normal  0.138686 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4525  acetoacetate decarboxylase  59.66 
 
 
246 aa  291  7e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.39507  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4983  acetoacetate decarboxylase  57.66 
 
 
246 aa  291  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3126  acetoacetate decarboxylase  57.66 
 
 
246 aa  291  8e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898077  normal  0.894092 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3166  acetoacetate decarboxylase  59.24 
 
 
246 aa  289  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1168  acetoacetate decarboxylase  59.24 
 
 
313 aa  288  7e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0022  acetoacetate decarboxylase  59.24 
 
 
313 aa  288  7e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0024  acetoacetate decarboxylase  59.24 
 
 
313 aa  288  8e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0919679  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0018  acetoacetate decarboxylase  59.24 
 
 
246 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5311  acetoacetate decarboxylase  57.26 
 
 
246 aa  287  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1058  acetoacetate decarboxylase  58.63 
 
 
247 aa  287  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.595144  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0022  acetoacetate decarboxylase  59.24 
 
 
246 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1448  acetoacetate decarboxylase  59.24 
 
 
246 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1525  acetoacetate decarboxylase  59.24 
 
 
246 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0020  acetoacetate decarboxylase  59.24 
 
 
246 aa  286  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4271  acetoacetate decarboxylase  59.26 
 
 
247 aa  285  4e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.13698  normal  0.618993 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4381  acetoacetate decarboxylase  59.26 
 
 
247 aa  285  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.602468  normal  0.211813 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5526  acetoacetate decarboxylase  58.57 
 
 
267 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.0278315 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6203  acetoacetate decarboxylase  58.05 
 
 
246 aa  278  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.560172 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2132  acetoacetate decarboxylase  54.03 
 
 
249 aa  275  5e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5563  acetoacetate decarboxylase  55.56 
 
 
259 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2412  acetoacetate decarboxylase  57.2 
 
 
259 aa  272  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.652307 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3919  acetoacetate decarboxylase  55.73 
 
 
251 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2695  acetoacetate decarboxylase  53.36 
 
 
246 aa  270  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.537071  normal  0.885884 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1397  acetoacetate decarboxylase  55.65 
 
 
257 aa  270  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0671592  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2114  acetoacetate decarboxylase  51 
 
 
250 aa  263  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1411  acetoacetate decarboxylase  57.6 
 
 
263 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305787  normal  0.188243 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1938  acetoacetate decarboxylase  49.19 
 
 
245 aa  237  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.139691  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3628  acetoacetate decarboxylase  45.68 
 
 
248 aa  225  6e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331441  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4592  acetoacetate decarboxylase  49.78 
 
 
247 aa  215  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0117  Acetoacetate decarboxylase  33.63 
 
 
243 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187521  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7618  Acetoacetate decarboxylase  29.6 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2286  Acetoacetate decarboxylase  29.47 
 
 
280 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1128  hypothetical protein  25.4 
 
 
264 aa  48.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.219472  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0744  Acetoacetate decarboxylase  41.46 
 
 
219 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5319  hypothetical protein  28.05 
 
 
296 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.519767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>