15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5319 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5319  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  607  1e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.519767  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5523  Acetoacetate decarboxylase  68.24 
 
 		 297 aa  428  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101923 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5081  hypothetical protein  68.81 
 
 		 298 aa  425  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1679  hypothetical protein  35.06 
 
 		 272 aa  149  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.668619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1128  hypothetical protein  27.04 
 
 		 264 aa  89.7  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.219472  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03392  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17670)  28.92 
 
 		 710 aa  89  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.39217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3019  hypothetical protein  42.24 
 
 		 181 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1994  hypothetical protein  27.17 
 
 		 271 aa  85.9  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58377  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06742  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00590)  24.83 
 
 		 697 aa  82.4  0.000000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00748094 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2366  hypothetical protein  24.24 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.138399 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0728  acetoacetate decarboxylase  28.22 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0708  acetoacetate decarboxylase  28.22 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01634  acetoacetate decarboxylase  28.05 
 
 		 273 aa  43.9  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2916  acetoacetate decarboxylase  26.22 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1567  acetoacetate decarboxylase  26.22 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984324  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>