37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1128 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1128  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  545  1e-154  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.219472  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2366  hypothetical protein  34.35 
 
 
268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.138399 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1679  hypothetical protein  27.78 
 
 
272 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.668619  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5523  Acetoacetate decarboxylase  25.65 
 
 
297 aa  92.4  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101923 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5081  hypothetical protein  24.73 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5319  hypothetical protein  27.04 
 
 
296 aa  89.7  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.519767  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03392  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17670)  25.27 
 
 
710 aa  74.7  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.39217 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06742  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00590)  26.35 
 
 
697 aa  66.6  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00748094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1994  hypothetical protein  24.53 
 
 
271 aa  63.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58377  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3019  hypothetical protein  36.14 
 
 
181 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3126  acetoacetate decarboxylase  26.39 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898077  normal  0.894092 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4983  acetoacetate decarboxylase  26.39 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3166  acetoacetate decarboxylase  26.27 
 
 
246 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5714  acetoacetate decarboxylase  26.27 
 
 
246 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176105  normal  0.138686 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4525  acetoacetate decarboxylase  26.27 
 
 
246 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.39507  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5145  acetoacetate decarboxylase  26.27 
 
 
246 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5311  acetoacetate decarboxylase  25.93 
 
 
246 aa  52.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0728  acetoacetate decarboxylase  34.07 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0708  acetoacetate decarboxylase  34.07 
 
 
254 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2695  acetoacetate decarboxylase  29.28 
 
 
246 aa  50.4  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.537071  normal  0.885884 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0020  acetoacetate decarboxylase  25.68 
 
 
246 aa  50.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0018  acetoacetate decarboxylase  25.68 
 
 
246 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0022  acetoacetate decarboxylase  25.68 
 
 
246 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1525  acetoacetate decarboxylase  25.68 
 
 
246 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1448  acetoacetate decarboxylase  25.68 
 
 
246 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2132  acetoacetate decarboxylase  30.43 
 
 
249 aa  49.3  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0022  acetoacetate decarboxylase  25.68 
 
 
313 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0024  acetoacetate decarboxylase  25.68 
 
 
313 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0919679  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1168  acetoacetate decarboxylase  25.68 
 
 
313 aa  48.9  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01634  acetoacetate decarboxylase  25.4 
 
 
273 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2916  acetoacetate decarboxylase  27.8 
 
 
252 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2114  acetoacetate decarboxylase  23.64 
 
 
250 aa  45.8  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1567  acetoacetate decarboxylase  26.01 
 
 
252 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984324  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0495  acetoacetate decarboxylase  32.22 
 
 
245 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6203  acetoacetate decarboxylase  25.12 
 
 
246 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.560172 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1397  acetoacetate decarboxylase  24.88 
 
 
257 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0671592  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1058  acetoacetate decarboxylase  30.77 
 
 
247 aa  43.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.595144  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>