17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5523 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5523  Acetoacetate decarboxylase  100 
 
 		 297 aa  610  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101923 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5081  hypothetical protein  82.83 
 
 		 298 aa  506  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5319  hypothetical protein  68.24 
 
 		 296 aa  428  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.519767  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1679  hypothetical protein  37.88 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.668619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1128  hypothetical protein  25.65 
 
 		 264 aa  92.4  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.219472  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03392  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17670)  28.75 
 
 		 710 aa  90.9  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.39217 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2366  hypothetical protein  27.56 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.138399 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06742  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00590)  27.27 
 
 		 697 aa  85.1  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00748094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3019  hypothetical protein  40.27 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1994  hypothetical protein  26.34 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4271  acetoacetate decarboxylase  28.26 
 
 		 247 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.13698  normal  0.618993 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1058  acetoacetate decarboxylase  26.49 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.595144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4381  acetoacetate decarboxylase  28.26 
 
 		 247 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.602468  normal  0.211813 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2597  acetoacetate decarboxylase  32.69 
 
 		 266 aa  43.1  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.271869  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2114  acetoacetate decarboxylase  24.32 
 
 		 250 aa  42.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2916  acetoacetate decarboxylase  28.06 
 
 		 252 aa  42.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1567  acetoacetate decarboxylase  28.06 
 
 		 252 aa  42.4  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984324  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>