46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5714 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4525  acetoacetate decarboxylase  100 
 
 
246 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.39507  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5145  acetoacetate decarboxylase  100 
 
 
246 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5714  acetoacetate decarboxylase  100 
 
 
246 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176105  normal  0.138686 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3166  acetoacetate decarboxylase  99.59 
 
 
246 aa  499  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3126  acetoacetate decarboxylase  96.75 
 
 
246 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898077  normal  0.894092 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5311  acetoacetate decarboxylase  97.15 
 
 
246 aa  487  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4983  acetoacetate decarboxylase  96.75 
 
 
246 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0022  acetoacetate decarboxylase  89.43 
 
 
313 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1168  acetoacetate decarboxylase  89.43 
 
 
313 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0018  acetoacetate decarboxylase  89.43 
 
 
246 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0022  acetoacetate decarboxylase  89.43 
 
 
246 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0024  acetoacetate decarboxylase  89.43 
 
 
313 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0919679  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1448  acetoacetate decarboxylase  89.43 
 
 
246 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0020  acetoacetate decarboxylase  89.84 
 
 
246 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1525  acetoacetate decarboxylase  89.43 
 
 
246 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2916  acetoacetate decarboxylase  80.08 
 
 
252 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1567  acetoacetate decarboxylase  80.08 
 
 
252 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984324  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1058  acetoacetate decarboxylase  79.76 
 
 
247 aa  403  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.595144  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4271  acetoacetate decarboxylase  78.95 
 
 
247 aa  397  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.13698  normal  0.618993 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4381  acetoacetate decarboxylase  78.95 
 
 
247 aa  397  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.602468  normal  0.211813 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0495  acetoacetate decarboxylase  69.39 
 
 
245 aa  357  8e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6203  acetoacetate decarboxylase  69.11 
 
 
246 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.560172 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2695  acetoacetate decarboxylase  65.85 
 
 
246 aa  351  7e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.537071  normal  0.885884 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2114  acetoacetate decarboxylase  64 
 
 
250 aa  333  1e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1411  acetoacetate decarboxylase  68.55 
 
 
263 aa  332  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305787  normal  0.188243 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2132  acetoacetate decarboxylase  62.7 
 
 
249 aa  328  4e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1397  acetoacetate decarboxylase  66.12 
 
 
257 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0671592  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5526  acetoacetate decarboxylase  63.31 
 
 
267 aa  327  8e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.0278315 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5563  acetoacetate decarboxylase  62.5 
 
 
259 aa  323  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2412  acetoacetate decarboxylase  61.29 
 
 
259 aa  319  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.652307 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3919  acetoacetate decarboxylase  63.45 
 
 
251 aa  318  6e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01634  acetoacetate decarboxylase  59.66 
 
 
273 aa  291  6e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0708  acetoacetate decarboxylase  58.59 
 
 
254 aa  286  2e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0728  acetoacetate decarboxylase  56.2 
 
 
254 aa  286  2e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1938  acetoacetate decarboxylase  53.62 
 
 
245 aa  258  5.0000000000000005e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.139691  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4592  acetoacetate decarboxylase  51.67 
 
 
247 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3628  acetoacetate decarboxylase  51.26 
 
 
248 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331441  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7618  Acetoacetate decarboxylase  33.47 
 
 
271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0117  Acetoacetate decarboxylase  36.17 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187521  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2286  Acetoacetate decarboxylase  27.67 
 
 
280 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1128  hypothetical protein  26.27 
 
 
264 aa  53.5  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.219472  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7640  hypothetical protein  26.03 
 
 
256 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.323453 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2366  hypothetical protein  31.25 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.138399 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0744  Acetoacetate decarboxylase  28.04 
 
 
219 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02690  acetoacetate decarboxylase  30.97 
 
 
276 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7498  acetoacetate decarboxylase  25.61 
 
 
269 aa  41.6  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>