40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5563 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5563  acetoacetate decarboxylase  100 
 
 		 259 aa  531  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2412  acetoacetate decarboxylase  91.51 
 
 		 259 aa  498  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.652307 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5526  acetoacetate decarboxylase  81.67 
 
 		 267 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.0278315 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3919  acetoacetate decarboxylase  77.29 
 
 		 251 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2916  acetoacetate decarboxylase  64.29 
 
 		 252 aa  331  8e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0018  acetoacetate decarboxylase  62.9 
 
 		 246 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1567  acetoacetate decarboxylase  63.49 
 
 		 252 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0022  acetoacetate decarboxylase  62.9 
 
 		 246 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1448  acetoacetate decarboxylase  62.9 
 
 		 246 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0020  acetoacetate decarboxylase  62.9 
 
 		 246 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1525  acetoacetate decarboxylase  62.9 
 
 		 246 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1168  acetoacetate decarboxylase  62.9 
 
 		 313 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0022  acetoacetate decarboxylase  62.9 
 
 		 313 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0024  acetoacetate decarboxylase  62.9 
 
 		 313 aa  325  6e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0919679  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4983  acetoacetate decarboxylase  62.5 
 
 		 246 aa  323  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3126  acetoacetate decarboxylase  62.5 
 
 		 246 aa  323  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898077  normal  0.894092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4525  acetoacetate decarboxylase  62.5 
 
 		 246 aa  323  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.39507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3166  acetoacetate decarboxylase  62.5 
 
 		 246 aa  323  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5714  acetoacetate decarboxylase  62.5 
 
 		 246 aa  323  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176105  normal  0.138686 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5145  acetoacetate decarboxylase  62.5 
 
 		 246 aa  323  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5311  acetoacetate decarboxylase  62.5 
 
 		 246 aa  323  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6203  acetoacetate decarboxylase  62.9 
 
 		 246 aa  314  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.560172 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4271  acetoacetate decarboxylase  63.45 
 
 		 247 aa  311  9e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.13698  normal  0.618993 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4381  acetoacetate decarboxylase  63.45 
 
 		 247 aa  311  9e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.602468  normal  0.211813 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1058  acetoacetate decarboxylase  62.65 
 
 		 247 aa  306  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.595144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2695  acetoacetate decarboxylase  59.11 
 
 		 246 aa  302  3.0000000000000004e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.537071  normal  0.885884 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0495  acetoacetate decarboxylase  60.48 
 
 		 245 aa  300  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2114  acetoacetate decarboxylase  57.94 
 
 		 250 aa  291  6e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2132  acetoacetate decarboxylase  57.48 
 
 		 249 aa  287  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1397  acetoacetate decarboxylase  58.57 
 
 		 257 aa  287  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0671592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1411  acetoacetate decarboxylase  58.62 
 
 		 263 aa  280  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305787  normal  0.188243 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01634  acetoacetate decarboxylase  55.56 
 
 		 273 aa  274  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1938  acetoacetate decarboxylase  55.23 
 
 		 245 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.139691  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0728  acetoacetate decarboxylase  51.82 
 
 		 254 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0708  acetoacetate decarboxylase  51.42 
 
 		 254 aa  249  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4592  acetoacetate decarboxylase  51.6 
 
 		 247 aa  234  8e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3628  acetoacetate decarboxylase  49.78 
 
 		 248 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331441  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0117  Acetoacetate decarboxylase  37.39 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187521  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7618  Acetoacetate decarboxylase  30.33 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2286  Acetoacetate decarboxylase  32 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>