14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7498 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7498  acetoacetate decarboxylase  100 
 
 		 269 aa  548  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1097  acetoacetate decarboxylase  68.94 
 
 		 275 aa  342  5e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2597  acetoacetate decarboxylase  57.85 
 
 		 266 aa  323  3e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.271869  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1034  acetoacetate decarboxylase  40.47 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.247214  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2400  hypothetical protein  39.27 
 
 		 277 aa  170  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2186  Acetoacetate decarboxylase  36.29 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4259  acetoacetate decarboxylase  32.96 
 
 		 261 aa  119  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0991  hypothetical protein  30 
 
 		 267 aa  102  6e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0076496  normal  0.0109843 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4592  acetoacetate decarboxylase  24.58 
 
 		 247 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4271  acetoacetate decarboxylase  23.35 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.13698  normal  0.618993 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4381  acetoacetate decarboxylase  23.35 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.602468  normal  0.211813 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1058  acetoacetate decarboxylase  24.02 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.595144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4983  acetoacetate decarboxylase  26.51 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3126  acetoacetate decarboxylase  26.51 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898077  normal  0.894092 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>