12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2400 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2400  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1034  acetoacetate decarboxylase  50.95 
 
 		 266 aa  259  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.247214  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2186  Acetoacetate decarboxylase  38.64 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2597  acetoacetate decarboxylase  39.2 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.271869  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7498  acetoacetate decarboxylase  39.27 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1097  acetoacetate decarboxylase  38.22 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0991  hypothetical protein  28.15 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0076496  normal  0.0109843 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4259  acetoacetate decarboxylase  28.68 
 
 		 261 aa  86.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4592  acetoacetate decarboxylase  22.81 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6203  acetoacetate decarboxylase  22.55 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.560172 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0117  Acetoacetate decarboxylase  25.38 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187521  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1397  acetoacetate decarboxylase  23.14 
 
 		 257 aa  42.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0671592  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>