15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1097 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1097  acetoacetate decarboxylase  100 
 
 
275 aa  553  1e-156  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7498  acetoacetate decarboxylase  68.94 
 
 
269 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2597  acetoacetate decarboxylase  56.98 
 
 
266 aa  308  5e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.271869  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1034  acetoacetate decarboxylase  43.94 
 
 
266 aa  196  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.247214  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2400  hypothetical protein  39.77 
 
 
277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2186  Acetoacetate decarboxylase  35.5 
 
 
266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4259  acetoacetate decarboxylase  33.73 
 
 
261 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0991  hypothetical protein  28.46 
 
 
267 aa  99.8  4e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0076496  normal  0.0109843 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4592  acetoacetate decarboxylase  25.48 
 
 
247 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1058  acetoacetate decarboxylase  25.2 
 
 
247 aa  46.6  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.595144  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4271  acetoacetate decarboxylase  25.1 
 
 
247 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.13698  normal  0.618993 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4381  acetoacetate decarboxylase  25.1 
 
 
247 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.602468  normal  0.211813 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2114  acetoacetate decarboxylase  24.08 
 
 
250 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1397  acetoacetate decarboxylase  23.23 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0671592  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1938  acetoacetate decarboxylase  23.24 
 
 
245 aa  43.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.139691  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>