15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02690 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_02690  acetoacetate decarboxylase  100 
 
 		 276 aa  565  1e-160  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1743  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.95 
 
 		 937 aa  150  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0763  acetoacetate decarboxylase  29.59 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.325494  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0117  Acetoacetate decarboxylase  28.57 
 
 		 243 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187521  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7618  Acetoacetate decarboxylase  28.06 
 
 		 271 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2286  Acetoacetate decarboxylase  26.84 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0817  acetoacetate decarboxylase  36.56 
 
 		 254 aa  49.7  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3166  acetoacetate decarboxylase  30.97 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5145  acetoacetate decarboxylase  30.97 
 
 		 246 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5714  acetoacetate decarboxylase  30.97 
 
 		 246 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176105  normal  0.138686 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4525  acetoacetate decarboxylase  30.97 
 
 		 246 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.39507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5311  acetoacetate decarboxylase  30.97 
 
 		 246 aa  46.2  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1397  acetoacetate decarboxylase  31.25 
 
 		 257 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0671592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4983  acetoacetate decarboxylase  30.97 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3126  acetoacetate decarboxylase  30.97 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898077  normal  0.894092 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>