35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7640 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7640  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  528  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.323453 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3367  hypothetical protein  30.84 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000245713  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4381  acetoacetate decarboxylase  26.03 
 
 
247 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.602468  normal  0.211813 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1058  acetoacetate decarboxylase  25.62 
 
 
247 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.595144  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4271  acetoacetate decarboxylase  26.03 
 
 
247 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.13698  normal  0.618993 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0495  acetoacetate decarboxylase  28.22 
 
 
245 aa  62  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3126  acetoacetate decarboxylase  26.45 
 
 
246 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898077  normal  0.894092 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4983  acetoacetate decarboxylase  26.45 
 
 
246 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2132  acetoacetate decarboxylase  25.21 
 
 
249 aa  53.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4525  acetoacetate decarboxylase  26.03 
 
 
246 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.39507  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5145  acetoacetate decarboxylase  26.03 
 
 
246 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5714  acetoacetate decarboxylase  26.03 
 
 
246 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176105  normal  0.138686 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3166  acetoacetate decarboxylase  26.03 
 
 
246 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5311  acetoacetate decarboxylase  25.82 
 
 
246 aa  52.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1567  acetoacetate decarboxylase  26.67 
 
 
252 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984324  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2695  acetoacetate decarboxylase  25.39 
 
 
246 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.537071  normal  0.885884 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2916  acetoacetate decarboxylase  26.64 
 
 
252 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2114  acetoacetate decarboxylase  25.1 
 
 
250 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6203  acetoacetate decarboxylase  25.39 
 
 
246 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.560172 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1397  acetoacetate decarboxylase  25.33 
 
 
257 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0671592  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0117  Acetoacetate decarboxylase  28.17 
 
 
243 aa  49.7  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187521  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0020  acetoacetate decarboxylase  24.38 
 
 
246 aa  48.5  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0022  acetoacetate decarboxylase  24.38 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0024  acetoacetate decarboxylase  24.38 
 
 
313 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0919679  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1448  acetoacetate decarboxylase  24.38 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1525  acetoacetate decarboxylase  24.38 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0018  acetoacetate decarboxylase  24.38 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0022  acetoacetate decarboxylase  24.38 
 
 
313 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1168  acetoacetate decarboxylase  24.38 
 
 
313 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1411  acetoacetate decarboxylase  25.3 
 
 
263 aa  45.4  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305787  normal  0.188243 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0708  acetoacetate decarboxylase  25.77 
 
 
254 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3919  acetoacetate decarboxylase  26.29 
 
 
251 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5526  acetoacetate decarboxylase  26.01 
 
 
267 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.0278315 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0728  acetoacetate decarboxylase  25.77 
 
 
254 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3628  acetoacetate decarboxylase  24.07 
 
 
248 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>