44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2695 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2695  acetoacetate decarboxylase  100 
 
 
246 aa  502  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.537071  normal  0.885884 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6203  acetoacetate decarboxylase  72.36 
 
 
246 aa  374  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.560172 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2916  acetoacetate decarboxylase  69.92 
 
 
252 aa  363  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1567  acetoacetate decarboxylase  69.51 
 
 
252 aa  362  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984324  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1411  acetoacetate decarboxylase  71.37 
 
 
263 aa  355  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305787  normal  0.188243 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0022  acetoacetate decarboxylase  67.48 
 
 
313 aa  354  5.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1168  acetoacetate decarboxylase  67.48 
 
 
313 aa  354  5.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3126  acetoacetate decarboxylase  66.67 
 
 
246 aa  354  6.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898077  normal  0.894092 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4983  acetoacetate decarboxylase  66.67 
 
 
246 aa  354  6.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0018  acetoacetate decarboxylase  67.48 
 
 
246 aa  353  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0022  acetoacetate decarboxylase  67.48 
 
 
246 aa  353  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0024  acetoacetate decarboxylase  67.48 
 
 
313 aa  353  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0919679  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1448  acetoacetate decarboxylase  67.48 
 
 
246 aa  353  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0020  acetoacetate decarboxylase  67.48 
 
 
246 aa  353  1e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1525  acetoacetate decarboxylase  67.48 
 
 
246 aa  353  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5714  acetoacetate decarboxylase  65.85 
 
 
246 aa  351  7e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176105  normal  0.138686 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5145  acetoacetate decarboxylase  65.85 
 
 
246 aa  351  7e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3166  acetoacetate decarboxylase  65.85 
 
 
246 aa  351  7e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4525  acetoacetate decarboxylase  65.85 
 
 
246 aa  351  7e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.39507  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5311  acetoacetate decarboxylase  65.85 
 
 
246 aa  350  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0495  acetoacetate decarboxylase  64.75 
 
 
245 aa  334  7.999999999999999e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4381  acetoacetate decarboxylase  65.7 
 
 
247 aa  332  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.602468  normal  0.211813 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4271  acetoacetate decarboxylase  65.7 
 
 
247 aa  332  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.13698  normal  0.618993 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1058  acetoacetate decarboxylase  65.29 
 
 
247 aa  332  4e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.595144  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1397  acetoacetate decarboxylase  63.97 
 
 
257 aa  330  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0671592  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2132  acetoacetate decarboxylase  63.67 
 
 
249 aa  328  4e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2114  acetoacetate decarboxylase  59.44 
 
 
250 aa  311  4.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5526  acetoacetate decarboxylase  59.92 
 
 
267 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.0278315 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5563  acetoacetate decarboxylase  59.11 
 
 
259 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2412  acetoacetate decarboxylase  59.51 
 
 
259 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.652307 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3919  acetoacetate decarboxylase  58.23 
 
 
251 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0728  acetoacetate decarboxylase  56.43 
 
 
254 aa  285  4e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0708  acetoacetate decarboxylase  56.02 
 
 
254 aa  284  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01634  acetoacetate decarboxylase  53.36 
 
 
273 aa  270  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1938  acetoacetate decarboxylase  48.98 
 
 
245 aa  255  5e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.139691  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3628  acetoacetate decarboxylase  47.76 
 
 
248 aa  228  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331441  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4592  acetoacetate decarboxylase  46.96 
 
 
247 aa  224  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7618  Acetoacetate decarboxylase  32.64 
 
 
271 aa  132  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0117  Acetoacetate decarboxylase  36.86 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187521  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2286  Acetoacetate decarboxylase  28.36 
 
 
280 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7640  hypothetical protein  25.39 
 
 
256 aa  52  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.323453 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1128  hypothetical protein  29.28 
 
 
264 aa  50.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.219472  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0744  Acetoacetate decarboxylase  30.7 
 
 
219 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02690  acetoacetate decarboxylase  26.62 
 
 
276 aa  41.6  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>