134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3459 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3459  phospholipase/carboxylesterase  100 
 
 		 247 aa  493  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.817506  normal  0.676516 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3966  phospholipase/carboxylesterase  96.94 
 
 		 229 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.346189  normal  0.196094 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4300  phospholipase/carboxylesterase  84.72 
 
 		 229 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4066  phospholipase/carboxylesterase  84.72 
 
 		 229 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3456  phospholipase/carboxylesterase  84.72 
 
 		 229 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1982  phospholipase/carboxylesterase  83.84 
 
 		 227 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4511  phospholipase/carboxylesterase  78.26 
 
 		 228 aa  344  7e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.642593 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2954  phospholipase/carboxylesterase  46.36 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.231462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2128  phospholipase/carboxylesterase  48.42 
 
 		 231 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282469  hitchhiker  0.000267211 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2537  phospholipase/carboxylesterase  46.8 
 
 		 219 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311842  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3244  phospholipase/carboxylesterase  39 
 
 		 245 aa  146  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2297  phospholipase/carboxylesterase  39.2 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.563406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2931  phospholipase/carboxylesterase  34.11 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2495  phospholipase/carboxylesterase  34.9 
 
 		 221 aa  102  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.402748  normal  0.915999 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1955  phospholipase/carboxylesterase  33.64 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2918  phospholipase/carboxylesterase  28.79 
 
 		 218 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2092  phospholipase/Carboxylesterase  31.28 
 
 		 224 aa  96.3  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.907639 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2061  phospholipase/Carboxylesterase  29.95 
 
 		 223 aa  95.9  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1691  serine esterase  31.88 
 
 		 227 aa  92.8  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2462  phospholipase/Carboxylesterase  28.85 
 
 		 225 aa  92  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1861  phospholipase/carboxylesterase  31.09 
 
 		 228 aa  89  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25946  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2100  phospholipase/Carboxylesterase  33.02 
 
 		 221 aa  87.8  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0569  phospholipase/Carboxylesterase  37.69 
 
 		 218 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2066  phospholipase/carboxylesterase  29.59 
 
 		 238 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1614  phospholipase/carboxylesterase  32.55 
 
 		 221 aa  86.3  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2306  phospholipase/carboxylesterase  33.52 
 
 		 235 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412885  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3304  phospholipase/Carboxylesterase  32.42 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2101  phospholipase/carboxylesterase  28 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1893  phospholipase/Carboxylesterase  28.93 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0572  phospholipase/Carboxylesterase  36.32 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.637211  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3140  phospholipase/carboxylesterase  27.84 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0649605  normal  0.347756 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0317  serine esterase  26.92 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441133 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08036  hypothetical protein  25.81 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119993  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2447  phospholipase/carboxylesterase  26.84 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252523  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3306  phospholipase/carboxylesterase family protein  27.15 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.703144  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0092  phospholipase/Carboxylesterase  23.98 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.898581  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1983  phospholipase/Carboxylesterase  33.33 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0573653  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1698  phospholipase/Carboxylesterase  28.29 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1208  phospholipase/Carboxylesterase  27.4 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2498  phospholipase/carboxylesterase  29.17 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06070  predicted esterase  28.5 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.998593  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2197  carboxylesterase  29.11 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610315  normal  0.977178 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1158  phospholipase/carboxylesterase  31.21 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0188854 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3813  phospholipase/carboxylesterase  26.41 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0993955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0540  phospholipase/carboxylesterase  34.17 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0982945  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3420  phospholipase/Carboxylesterase  26.29 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1899  Carboxylesterase  27.78 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0365567  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1107  carboxylesterase  29.67 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.175918  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0054  carboxylesterase  27.4 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.691003  normal  0.104617 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4377  phospholipase/carboxylesterase  27.05 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3258  phospholipase/carboxylesterase  25.69 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3402  carboxylesterase  26.57 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4424  phospholipase/Carboxylesterase  28.04 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1327  phospholipase/carboxylesterase  32.56 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4488  phospholipase/Carboxylesterase  28.04 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2404  carboxylesterase, putative  26.45 
 
 		 319 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0171467  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1167  carboxylesterase, putative  27.23 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00098882  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2054  phospholipase/carboxylesterase  30.5 
 
 		 381 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1610  phospholipase/carboxylesterase  27.23 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.247692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0272  putative carboxylesterase  27.23 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0149548  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1942  phospholipase/carboxylesterase  27.23 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1958  phospholipase/carboxylesterase  27.23 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0275939  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1688  putative phospholipase / carboxylesterase  30.73 
 
 		 223 aa  53.9  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00377416  normal  0.0415953 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2107  carboxylesterase  27.23 
 
 		 228 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.213325  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0931  esterase/lipase/thioesterase, active site  29.26 
 
 		 288 aa  52.8  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.396781  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1364  phospholipase/Carboxylesterase  26.63 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000864483 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3561  carboxylesterase  25.37 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.839773 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0989  hypothetical protein  29.26 
 
 		 288 aa  52.4  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3946  phospholipase/carboxylesterase  28.57 
 
 		 219 aa  52  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0903  carboxylesterase  26.21 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.892603  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1296  carboxylesterase  24.27 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12720  predicted esterase  32.1 
 
 		 211 aa  50.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.699828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1369  hypothetical protein  28.71 
 
 		 292 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11300  Carboxylesterase I  27.14 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3782  carboxylesterase  25 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1189  phospholipase/Carboxylesterase  32.63 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0360922 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4553  carboxylesterase  23.41 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1073  phospholipase/Carboxylesterase  33.03 
 
 		 218 aa  50.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4934  phospholipase/carboxylesterase  29.03 
 
 		 210 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00035929 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0395  Carboxylesterase  24.52 
 
 		 231 aa  48.9  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0967  carboxylesterase  26.47 
 
 		 221 aa  48.9  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000584217 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2136  carboxylesterase  26.42 
 
 		 224 aa  48.9  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000191828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5284  phospholipase/Carboxylesterase  31.25 
 
 		 202 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14080  carboxylesterase  25.6 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4429  carboxylesterase  23.41 
 
 		 218 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.708757 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1907  carboxylesterase  27.92 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000226911  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2138  carboxylesterase  25.59 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145278  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0236  phospholipase/Carboxylesterase  25.47 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0959  phospholipase/carboxylesterase  32.98 
 
 		 193 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.258344  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1254  carboxylesterase  22.33 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0551  carboxylesterase protein  26.24 
 
 		 226 aa  47  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315382  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1307  phospholipase/carboxylesterase  23.67 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.839904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0972  phospholipase/carboxylesterase  23.41 
 
 		 218 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24861  esterase  27.75 
 
 		 201 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3749  phospholipase/carboxylesterase  30.48 
 
 		 213 aa  45.8  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1272  Carboxylesterase  23.19 
 
 		 220 aa  45.8  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2114  phospholipase/Carboxylesterase  31.66 
 
 		 224 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0451  esterase  26.73 
 
 		 209 aa  45.4  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2077  phospholipase/carboxylesterase  28.86 
 
 		 220 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.214877 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31530  predicted esterase  31.85 
 
 		 226 aa  45.8  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>