More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1975 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1975  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 119 aa  245  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0377  thioredoxin  33.64 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655114  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  37.84 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  36.36 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  37.84 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  36.36 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  37.84 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2259  thioredoxin  36.45 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  37.84 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0448  thioredoxin  34.58 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  31.19 
 
 		 140 aa  76.6  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  36.36 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10788  predicted protein  37.74 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  34.82 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  35.78 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  38.24 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  36.04 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  34.86 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  36.36 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  34.21 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  36.04 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  34.86 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3727  Thioredoxin domain  33.96 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  36.27 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  33 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  33 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1389  thioredoxin domain-containing protein  37.38 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.276518  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4481  thioredoxin  33.64 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1123  thioredoxin  36.79 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  31.73 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  30.77 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3283  thioredoxin  35.51 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  29.63 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  32.35 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  32.35 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  37.5 
 
 		 141 aa  67  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4857  thioredoxin  36.73 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  31 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  32.35 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  32.35 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  31.78 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  30.56 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2134  thioredoxin  33.64 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  32.98 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3325  Thioredoxin domain protein  36.36 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000131659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  29.63 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  33.33 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  32.67 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  32.67 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2375  thioredoxin-related  35.85 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.316536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  29.25 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  34.48 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1582  thioredoxin  34.23 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.0376163 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1144  thioredoxin  31 
 
 		 421 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  29.63 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4209  thioredoxin  34.86 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  31.31 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2478  thioredoxin domain-containing protein  39.33 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  31.07 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  31.68 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  27.18 
 
 		 107 aa  63.5  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  31.19 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  35.64 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  29.81 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  30.59 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  30 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3204  thioredoxin 2  32.18 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  29.7 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  32.99 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  28.85 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  29.7 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7798  thioredoxin  27.18 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  25.49 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  29.25 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  30.84 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3341  thioredoxin 2  31.03 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142551  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3463  thioredoxin 2  31.03 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.305081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  28.57 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  30.3 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4438  thioredoxin  31.68 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.102034  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  36.14 
 
 		 304 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  31.31 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0813  thioredoxin  31.4 
 
 		 109 aa  60.1  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146615  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  32.95 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  35.63 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  27.36 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  27.45 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  27.18 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  27.18 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  30.21 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  27.45 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3742  thioredoxin  35.4 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0205  thioredoxin, putative  29.89 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.513083  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  34.48 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5119  thioredoxin  34.09 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0054  thioredoxin, putative  29.36 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3933  thioredoxin  26.32 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0218  thioredoxin  26.88 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  27.36 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  27.36 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>