More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4656 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4656  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
336 aa  674    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2961  alcohol dehydrogenase  47.5 
 
 
331 aa  269  5e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.284622 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1337  alcohol dehydrogenase  48.61 
 
 
336 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2325  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.77 
 
 
331 aa  256  3e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2437  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  49.84 
 
 
330 aa  252  6e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.12399 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0856  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  49.16 
 
 
302 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37950  zinc-containing alcohol dehydrogenase  49.22 
 
 
331 aa  240  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2027  alcohol dehydrogenase  48.28 
 
 
328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2452  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.05 
 
 
314 aa  207  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02791  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  43.36 
 
 
311 aa  188  9e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 
326 aa  161  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6978  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1670  alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
328 aa  150  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000446585  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2447  alcohol dehydrogenase  33.66 
 
 
331 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767036  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1489  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.91 
 
 
330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151992  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.14 
 
 
311 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  30.96 
 
 
313 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  34.43 
 
 
327 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.36 
 
 
336 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  0.659937 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.71 
 
 
308 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  34.94 
 
 
314 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.83 
 
 
322 aa  106  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  30.7 
 
 
317 aa  105  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.7 
 
 
317 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0288  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.61 
 
 
313 aa  105  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.817819  normal  0.0965437 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1067  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.52 
 
 
309 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.26 
 
 
317 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  30.26 
 
 
317 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  31.6 
 
 
304 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  34.62 
 
 
305 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.08 
 
 
320 aa  103  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  36.89 
 
 
312 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0019  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.91 
 
 
322 aa  102  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5739  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.9 
 
 
308 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.382073  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2379  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.21 
 
 
338 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.849199  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2309  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.44 
 
 
309 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1586  alcohol dehydrogenase  36.09 
 
 
330 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0348041  normal  0.0356101 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0178  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.37 
 
 
302 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0108316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0176  alcohol dehydrogenase  29.37 
 
 
302 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0261853  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1093  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  29.92 
 
 
337 aa  100  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0168  alcohol dehydrogenase, zinc containing  27.33 
 
 
302 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.662209  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4198  alcohol dehydrogenase  30.93 
 
 
323 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00226105  normal  0.135586 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4700  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.09 
 
 
339 aa  99.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3883  alcohol dehydrogenase  29.28 
 
 
326 aa  99.4  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.014306  normal  0.116687 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0734  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  35.77 
 
 
336 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0886  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  34.6 
 
 
315 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0165  alcohol dehydrogenase, zinc containing  28.97 
 
 
302 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.93 
 
 
334 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  29.39 
 
 
308 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1036  alcohol dehydrogenase  30.42 
 
 
333 aa  97.8  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18400  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  33.04 
 
 
333 aa  97.4  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.18114  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01926  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.03 
 
 
335 aa  97.8  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.60827  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0197  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.97 
 
 
302 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0434  alcohol dehydrogenase  32 
 
 
339 aa  97.1  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0384  NADPH-quinone reductase  33.58 
 
 
339 aa  97.1  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.1 
 
 
359 aa  96.7  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4344  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  34.47 
 
 
356 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2863  alcohol dehydrogenase  35.22 
 
 
325 aa  96.3  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4019  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.6 
 
 
317 aa  95.9  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.209092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4764  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  29.65 
 
 
324 aa  95.9  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000104281  hitchhiker  0.000232398 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0125  alcohol dehydrogenase, zinc-binding  32.06 
 
 
337 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.384409  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3789  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.07 
 
 
323 aa  95.9  9e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6202  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.05 
 
 
328 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85677  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  30.56 
 
 
308 aa  95.1  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0954  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.02 
 
 
330 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.319163  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4459  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.7 
 
 
338 aa  94.7  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0062  putative Zinc-binding dehydrogenase  29.36 
 
 
364 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0506  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.95 
 
 
317 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0663  alcohol dehydrogenase  32.39 
 
 
327 aa  95.1  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951167  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5025  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.04 
 
 
345 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583153  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5835  alcohol dehydrogenase  34.04 
 
 
345 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1166  alcohol dehydrogenase  29.45 
 
 
333 aa  94.4  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5274  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  35.78 
 
 
324 aa  94  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315369  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  28.4 
 
 
331 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6510  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.26 
 
 
309 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.267083 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.25 
 
 
331 aa  94  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0221  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.57 
 
 
302 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000569438  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  28.4 
 
 
331 aa  93.2  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0162  alcohol dehydrogenase  26.67 
 
 
302 aa  93.2  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  30.56 
 
 
331 aa  93.2  6e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0429  alcohol dehydrogenase  39.31 
 
 
335 aa  92.8  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0198  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.57 
 
 
302 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000282555  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3527  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.31 
 
 
336 aa  92.4  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.845395  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.45 
 
 
341 aa  92.4  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5087  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.68 
 
 
334 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1742  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  33.63 
 
 
314 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0418  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.2 
 
 
327 aa  92.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0697  alcohol dehydrogenase  25.58 
 
 
329 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3729  alcohol dehydrogenase  32.78 
 
 
329 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.17576 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.85 
 
 
310 aa  91.3  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8441  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.22 
 
 
305 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.883915  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6236  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.6 
 
 
326 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547714  normal  0.621953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0607  alcohol dehydrogenase  29.39 
 
 
328 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.11 
 
 
331 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3507  alcohol dehydrogenase  33.48 
 
 
322 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5331  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.67 
 
 
324 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5420  alcohol dehydrogenase  36.67 
 
 
324 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4637  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.08 
 
 
309 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1925  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.48 
 
 
317 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000755536  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  28.07 
 
 
335 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1189  alcohol dehydrogenase  32.05 
 
 
324 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0796506  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>