More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2437 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2437  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  100 
 
 
330 aa  659    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.12399 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2027  alcohol dehydrogenase  72.17 
 
 
328 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2961  alcohol dehydrogenase  57.1 
 
 
331 aa  353  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.284622 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2325  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.91 
 
 
331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4656  alcohol dehydrogenase  49.84 
 
 
336 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1337  alcohol dehydrogenase  43.93 
 
 
336 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0856  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  45.76 
 
 
302 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2452  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.58 
 
 
314 aa  189  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37950  zinc-containing alcohol dehydrogenase  43.15 
 
 
331 aa  183  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02791  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  39.17 
 
 
311 aa  165  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2447  alcohol dehydrogenase  34.6 
 
 
331 aa  156  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767036  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.53 
 
 
326 aa  153  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6978  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1670  alcohol dehydrogenase  30.38 
 
 
328 aa  138  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000446585  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05254  oxidoreductase  31.89 
 
 
329 aa  125  9e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  38.89 
 
 
314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1489  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.2 
 
 
330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151992  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2576  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  31.9 
 
 
335 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal  0.646954 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5645  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  36.84 
 
 
336 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0734  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  38.24 
 
 
336 aa  105  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4019  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.53 
 
 
317 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.209092 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  30.53 
 
 
308 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.54 
 
 
317 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0288  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.21 
 
 
313 aa  104  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.817819  normal  0.0965437 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3071  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  32.09 
 
 
335 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0694028  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.4 
 
 
326 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0692  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.33 
 
 
320 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3309  alcohol dehydrogenase  36.09 
 
 
337 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0561  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.2 
 
 
332 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2719  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.8 
 
 
335 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0107  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.63 
 
 
341 aa  101  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7480  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
328 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.851059  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0018  alcohol dehydrogenase  32.14 
 
 
336 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.760899  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1742  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  31.66 
 
 
314 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2863  alcohol dehydrogenase  35.96 
 
 
325 aa  99.4  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1240  putative oxidoreductase  36.4 
 
 
369 aa  99.4  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.522043  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.04 
 
 
308 aa  99.8  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.44 
 
 
317 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  30.29 
 
 
313 aa  98.6  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.23 
 
 
359 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2953  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.51 
 
 
335 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0550  alcohol dehydrogenase  31.06 
 
 
333 aa  97.1  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  29.66 
 
 
331 aa  96.7  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1688  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  41.34 
 
 
338 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851726  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.46 
 
 
325 aa  96.7  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0783  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.63 
 
 
347 aa  96.7  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604967  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0894  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  28.57 
 
 
332 aa  96.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0782  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  28.21 
 
 
338 aa  96.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.793313  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2613  alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 
316 aa  96.3  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.616835 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0510  alcohol dehydrogenase  35.65 
 
 
326 aa  96.3  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01312  conserved hypothetical protein  29.61 
 
 
347 aa  95.9  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.673154 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1716  alcohol dehydrogenase  41.34 
 
 
339 aa  95.9  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.616978  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0669  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.11 
 
 
333 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.553231  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6202  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
328 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85677  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5040  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.54 
 
 
323 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13939  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.35 
 
 
320 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18400  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  31.13 
 
 
333 aa  94.7  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.18114  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2704  alcohol dehydrogenase  29.41 
 
 
337 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18160  putative oxidoreductase  40.11 
 
 
337 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1584  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  32.41 
 
 
310 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3453  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.41 
 
 
337 aa  94  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1640  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.55 
 
 
324 aa  93.6  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.140848  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.94 
 
 
331 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.98 
 
 
331 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  25.79 
 
 
332 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  25.79 
 
 
332 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1494  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  42.22 
 
 
338 aa  93.2  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253421  normal  0.032291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3712  alcohol dehydrogenase  35.87 
 
 
338 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.79 
 
 
332 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.82 
 
 
341 aa  93.2  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  28.98 
 
 
331 aa  92.8  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  25.79 
 
 
332 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2252  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.97 
 
 
327 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1036  alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 
333 aa  92.8  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1577  putative oxidoreductase  39.57 
 
 
337 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  25.88 
 
 
333 aa  92.4  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1925  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.59 
 
 
317 aa  92.8  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000755536  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2309  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.41 
 
 
309 aa  92.4  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1067  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.86 
 
 
309 aa  92.4  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1501  alcohol dehydrogenase  33.19 
 
 
324 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.640721  normal  0.504159 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3182  alcohol dehydrogenase  29.21 
 
 
339 aa  92.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2988  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.1 
 
 
338 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.9 
 
 
317 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.7 
 
 
333 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  25.79 
 
 
332 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  28.98 
 
 
331 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.79 
 
 
332 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1789  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.09 
 
 
339 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3647  alcohol dehydrogenase  30.28 
 
 
333 aa  92  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3470  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.66 
 
 
337 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3158  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.14 
 
 
338 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187629  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3639  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  33.2 
 
 
338 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103532  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.9 
 
 
317 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3146  alcohol dehydrogenase  29.6 
 
 
337 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0679914  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3337  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.04 
 
 
331 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  32.9 
 
 
317 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  35.32 
 
 
327 aa  91.3  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5242  alcohol dehydrogenase  31.56 
 
 
321 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0558445 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.03 
 
 
311 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  29.63 
 
 
326 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1660  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.59 
 
 
332 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.384338  normal  0.405975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>