More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2027 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2027  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 328 aa  654    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2437  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  72.17 
 
 		 330 aa  435  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12399 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2961  alcohol dehydrogenase  55.69 
 
 		 331 aa  340  2.9999999999999998e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.284622 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2325  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.56 
 
 		 331 aa  335  5e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4656  alcohol dehydrogenase  48.28 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1337  alcohol dehydrogenase  42.94 
 
 		 336 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0856  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44.19 
 
 		 302 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2452  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.64 
 
 		 314 aa  190  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37950  zinc-containing alcohol dehydrogenase  40.24 
 
 		 331 aa  190  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2447  alcohol dehydrogenase  35.51 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02791  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.33 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0562  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.17 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.6978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1670  alcohol dehydrogenase  29.94 
 
 		 328 aa  136  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000446585  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2613  alcohol dehydrogenase  31.41 
 
 		 316 aa  116  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.616835 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  30.97 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05254  oxidoreductase  28.48 
 
 		 329 aa  113  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0948  NADPH:quinone reductase related Zn-dependent oxidoreductase  33.47 
 
 		 312 aa  112  9e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.102607  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1742  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  31.33 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0734  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  37.3 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.02 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1753  NADPH:quinone reductase  30.41 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1489  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.18 
 
 		 330 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151992  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4019  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.15 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.209092 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3639  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  35.04 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103532  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5560  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.24 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3158  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.94 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187629  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2719  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.14 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0692  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.65 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0406  alcohol dehydrogenase  34.84 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00507024 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5645  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  37.61 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0658  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.24 
 
 		 337 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3894  alcohol dehydrogenase  30.12 
 
 		 312 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00052515  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1577  putative oxidoreductase  35.06 
 
 		 337 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3618  NADPH:quinone reductase  33.73 
 
 		 340 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18160  putative oxidoreductase  35.06 
 
 		 337 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0510  alcohol dehydrogenase  38.64 
 
 		 326 aa  103  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0666  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.85 
 
 		 337 aa  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1160  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  41.9 
 
 		 411 aa  102  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.678703  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0407  NADPH:quinone reductase  33.73 
 
 		 340 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2256  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  34.39 
 
 		 339 aa  102  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.603344  normal  0.181238 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3712  alcohol dehydrogenase  36.17 
 
 		 338 aa  102  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0754  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  33.46 
 
 		 349 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.094248  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.43 
 
 		 317 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0125  alcohol dehydrogenase, zinc-binding  33.07 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.384409  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.88 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2892  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.84 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2953  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.71 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1553  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.12 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.79 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  29.23 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2322  alcohol dehydrogenase  34.69 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0672997  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1660  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.28 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.384338  normal  0.405975 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.54 
 
 		 331 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.79 
 
 		 331 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3071  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  35.25 
 
 		 335 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0694028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5758  alcohol dehydrogenase  36.49 
 
 		 328 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0529264 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8677  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.4 
 
 		 338 aa  99.8  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  30.22 
 
 		 308 aa  99.4  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0288  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.74 
 
 		 313 aa  99.4  8e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.817819  normal  0.0965437 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2543  alcohol dehydrogenase  30.87 
 
 		 308 aa  99.4  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549026  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0561  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.52 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01312  conserved hypothetical protein  34.31 
 
 		 347 aa  98.2  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.673154 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1789  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.54 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.67 
 
 		 317 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  28.92 
 
 		 331 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  31.67 
 
 		 317 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0401  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.3 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.1 
 
 		 343 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386855  normal  0.701371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1925  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.35 
 
 		 317 aa  97.1  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000755536  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  30.74 
 
 		 314 aa  97.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10178  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  30.3 
 
 		 335 aa  96.7  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1391  oxidoreductase, zinc-binding  32.93 
 
 		 342 aa  96.3  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6202  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.04 
 
 		 328 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85677  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11094  hypothetical oxidoreductase (Eurofung)  31.6 
 
 		 348 aa  96.3  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.348085 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2576  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  33.74 
 
 		 335 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal  0.646954 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.16 
 
 		 317 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0521  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  33.47 
 
 		 333 aa  95.9  9e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1240  putative oxidoreductase  35.93 
 
 		 369 aa  95.5  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.522043  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  33.9 
 
 		 307 aa  95.5  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.051943  normal  0.176939 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5242  alcohol dehydrogenase  29.31 
 
 		 321 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155449  normal  0.0558445 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1688  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  41.67 
 
 		 338 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0107  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.54 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5297  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.86 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13031  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3436  alcohol dehydrogenase  32.53 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.57 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  31.72 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0074  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  41.18 
 
 		 337 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0066  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  40.64 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3167  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 		 339 aa  94  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.144569  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  33.94 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01926  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.33 
 
 		 335 aa  94.4  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.60827  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0757  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.87 
 
 		 334 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1238  alcohol dehydrogenase  30.87 
 
 		 334 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3227  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.29 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.659744  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.14 
 
 		 359 aa  93.6  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3932  alcohol dehydrogenase  32.53 
 
 		 340 aa  93.6  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0783  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.07 
 
 		 347 aa  93.6  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604967  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1166  alcohol dehydrogenase  28.19 
 
 		 333 aa  93.6  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0715  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  34.78 
 
 		 338 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>