More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2322 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2322  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 337 aa  676    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0672997  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3158  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  87.83 
 
 		 338 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187629  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3639  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  83.68 
 
 		 338 aa  574  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103532  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3419  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  78.64 
 
 		 337 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5040  putative oxidoreductase  72.7 
 
 		 338 aa  504  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3712  alcohol dehydrogenase  64.5 
 
 		 338 aa  435  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0666  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  63.2 
 
 		 337 aa  428  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18160  putative oxidoreductase  63.5 
 
 		 337 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1577  putative oxidoreductase  63.5 
 
 		 337 aa  428  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0754  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  61.72 
 
 		 349 aa  421  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.094248  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2758  zinc-binding alcohol dehydrogenase  62.91 
 
 		 337 aa  421  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1240  putative oxidoreductase  63.34 
 
 		 369 aa  424  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.522043  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0658  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  61.42 
 
 		 337 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3020  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  62.43 
 
 		 339 aa  418  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218397  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2953  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  62.72 
 
 		 335 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0066  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  60.83 
 
 		 337 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5533  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  64.5 
 
 		 336 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.328784 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0074  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  60.83 
 
 		 337 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0715  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  61.47 
 
 		 338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2719  zinc-binding alcohol dehydrogenase  62.13 
 
 		 335 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1160  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  59.94 
 
 		 411 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.678703  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2685  putative bifunctional oxidoreductase/alginate lyase  60.12 
 
 		 337 aa  401  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1096  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  59.35 
 
 		 337 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.381696  normal  0.273466 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2159  hypothetical protein  58.46 
 
 		 337 aa  399  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0734  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  61.42 
 
 		 336 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2133  hypothetical protein  58.16 
 
 		 337 aa  395  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3071  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  60.06 
 
 		 335 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0694028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0951  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  59.64 
 
 		 337 aa  392  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2576  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  61.18 
 
 		 335 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal  0.646954 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2256  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  59.64 
 
 		 339 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.603344  normal  0.181238 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3542  alcohol dehydrogenase  58.16 
 
 		 334 aa  389  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.946439  normal  0.516815 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5645  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  61.18 
 
 		 336 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1687  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  62.06 
 
 		 338 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.748808 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0652  zinc-binding alcohol dehydrogenase  59.12 
 
 		 337 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.215695 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2006  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  62.35 
 
 		 338 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0088  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  59.82 
 
 		 340 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.211102  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0401  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  57.52 
 
 		 337 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4026  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  60.95 
 
 		 335 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.622195  normal  0.204275 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3880  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  57.23 
 
 		 340 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115139 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3932  alcohol dehydrogenase  56.93 
 
 		 340 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0407  NADPH:quinone reductase  57.52 
 
 		 340 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3618  NADPH:quinone reductase  57.82 
 
 		 340 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1716  alcohol dehydrogenase  57.99 
 
 		 339 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.616978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1688  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  57.69 
 
 		 338 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3957  zinc-binding alcohol dehydrogenase  55.75 
 
 		 340 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0406  alcohol dehydrogenase  56.64 
 
 		 340 aa  374  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00507024 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0947  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  56.38 
 
 		 337 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4073  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  56.05 
 
 		 340 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1753  NADPH:quinone reductase  56.51 
 
 		 333 aa  371  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10178  alcohol dehydrogenase, zinc-containing protein  50.75 
 
 		 335 aa  369  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3436  alcohol dehydrogenase  55.46 
 
 		 340 aa  371  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1494  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  56.51 
 
 		 338 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253421  normal  0.032291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1565  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  61.83 
 
 		 339 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.243627  normal  0.152026 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01966  oxidoreductase, zinc-binding protein  51.93 
 
 		 363 aa  362  4e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3233  zinc-binding dehydrogenase; alginate lyase  53.55 
 
 		 339 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000117644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3489  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  53.55 
 
 		 339 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00320112  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5176  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  59.88 
 
 		 335 aa  360  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0125  alcohol dehydrogenase, zinc-binding  55.59 
 
 		 337 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.384409  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3470  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  53.25 
 
 		 339 aa  360  2e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.213053  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1405  alcohol dehydrogenase  51.91 
 
 		 341 aa  359  4e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3476  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  52.66 
 
 		 339 aa  358  7e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2325  alginate lyase  58.58 
 
 		 340 aa  358  7e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502428  normal  0.834266 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3175  NADPH:quinone reductase zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  52.96 
 
 		 339 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0158861  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0984  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  56.51 
 
 		 338 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5075  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  57.94 
 
 		 338 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1789  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  52.66 
 
 		 339 aa  355  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0107  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.71 
 
 		 341 aa  354  8.999999999999999e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3167  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.37 
 
 		 339 aa  351  8e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.144569  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3928  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  53.39 
 
 		 337 aa  351  8e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1776  alcohol dehydrogenase  57.4 
 
 		 338 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.363209  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6303  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.4 
 
 		 338 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0933  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  54.41 
 
 		 341 aa  350  2e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0429  alcohol dehydrogenase  52.82 
 
 		 335 aa  350  2e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1861  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  56.51 
 
 		 340 aa  349  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110375  normal  0.0964834 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1391  oxidoreductase, zinc-binding  50.29 
 
 		 342 aa  349  4e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3912  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.21 
 
 		 338 aa  348  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5281  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  57.77 
 
 		 340 aa  348  7e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4370  alcohol dehydrogenase  56.51 
 
 		 338 aa  346  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.396252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1801  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  56.51 
 
 		 338 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.590964  normal  0.594386 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3309  alcohol dehydrogenase  49.71 
 
 		 337 aa  338  7e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1033  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  49.41 
 
 		 337 aa  337  9.999999999999999e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02525  oxidoreductase  57.14 
 
 		 307 aa  323  3e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481971  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4454  alcohol dehydrogenase  56.77 
 
 		 350 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0701403 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3759  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.48 
 
 		 337 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0799  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  51.44 
 
 		 339 aa  298  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.115573  normal  0.158773 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2637  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.24 
 
 		 341 aa  287  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2780  Alcohol dehydrogenase. zinc-binding type 1  52.75 
 
 		 333 aa  281  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.207302  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0521  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  45.48 
 
 		 333 aa  278  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0751  quinone oxidoreductase  43.58 
 
 		 328 aa  275  1.0000000000000001e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.199766  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0550  alcohol dehydrogenase  45.77 
 
 		 333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0669  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.34 
 
 		 333 aa  268  8e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.553231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3681  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  45.66 
 
 		 333 aa  256  3e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3875  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  44.69 
 
 		 333 aa  255  7e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2256  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.35 
 
 		 335 aa  255  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2217  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.35 
 
 		 335 aa  255  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1553  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44.38 
 
 		 340 aa  249  5e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6077  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  46.23 
 
 		 328 aa  249  7e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1785  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.39 
 
 		 336 aa  239  4e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1189  NADPH:quinone reductase related Zn-dependent oxidoreductase  40.12 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0584  NADPH:quinone reductase or related Zn-dependent oxidoreductase  39.23 
 
 		 359 aa  234  1.0000000000000001e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.401848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>