108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A2256 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A2256  hypothetical protein  100 
 
 
68 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0821724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2579  XRE family transcriptional regulator  87.5 
 
 
65 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000319411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2163  DNA-binding protein  75 
 
 
66 aa  84.3  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2102  DNA-binding protein  75 
 
 
66 aa  84.3  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2318  DNA-binding protein  75 
 
 
66 aa  84.3  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.347078  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2343  DNA-binding protein  75 
 
 
66 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3781  prophage LambdaBa02, repressor protein  45.45 
 
 
68 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4070  prophage LambdaBa02, repressor protein  45.45 
 
 
68 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00909225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2412  hypothetical protein  50 
 
 
66 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364776  normal  0.166132 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1903  transcriptional regulator, XRE family  49.06 
 
 
64 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.282612  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3981  hypothetical protein  34.92 
 
 
73 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00547504  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1517  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 
73 aa  53.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449113  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 
63 aa  49.7  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 
74 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0556  hypothetical protein  48.94 
 
 
49 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0057041 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 
72 aa  47.8  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 
81 aa  47.4  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 
72 aa  47  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1664  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 
66 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.609845  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0029  Cro/CI family transcriptional regulator  39.39 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.735967  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4055  molybdate metabolism transcriptional regulator  39.34 
 
 
377 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182658  normal  0.26319 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2424  XRE family transcriptional regulator  39.22 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.21455  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2239  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  45.1 
 
 
368 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  34.43 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 
67 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 
63 aa  46.2  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 
69 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1159  DNA-binding protein  34.92 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593416  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0397  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000557711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0407  helix-turn-helix domain-containing protein  37.88 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000097753  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0153  transcriptional regulator  34.43 
 
 
64 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 
68 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  30.88 
 
 
68 aa  44.7  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  33.85 
 
 
67 aa  44.3  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 
69 aa  43.9  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0207  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 
69 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  38.33 
 
 
69 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 
69 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3240  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  31.75 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  35.19 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0162  hypothetical protein  33.33 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2552  transcriptional regulator  28.33 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1613  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
71 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1982  transcriptional regulator  36.36 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3707  molybdate metabolism transcriptional regulator  33.33 
 
 
374 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.487138  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0235  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4290  transcriptional regulator, XRE family  27.69 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.34926  normal  0.146409 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0777  XRE family transcriptional regulator  38 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000109093  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0740  transcriptional regulator  36.07 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.805789 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2928  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 
70 aa  41.6  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.000000000000595128  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0689  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
63 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285509  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3627  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 
65 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 
66 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 
67 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3146  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
80 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000500747  normal  0.0337918 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 
77 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  35.48 
 
 
67 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  39.58 
 
 
196 aa  41.6  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 
72 aa  41.6  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 
65 aa  41.2  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5865  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  33.33 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  38.46 
 
 
377 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  32.79 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0815  Cro/CI family transcriptional regulator  33.33 
 
 
71 aa  41.2  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  32.79 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  32.79 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  32.79 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  32.79 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1271  DNA-binding protein  32.73 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3410  transcriptional regulator, XRE family protein  31.25 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0277  XRE family transcriptional regulator  28.79 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.189848  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  32.79 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  32.79 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  33.33 
 
 
69 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5169  DNA-binding protein  31.25 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  33.33 
 
 
69 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  33.33 
 
 
69 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4511  XRE family transcriptional regulator  30.16 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11449  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2208  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 
73 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0421873 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  33.33 
 
 
69 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  32.79 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  33.33 
 
 
69 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  33.33 
 
 
69 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  32.73 
 
 
80 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4739  DNA-binding protein  29.85 
 
 
73 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4758  DNA-binding protein  29.85 
 
 
73 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0571449  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  36.73 
 
 
67 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  38.78 
 
 
66 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 
79 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4895  DNA-binding protein  34.48 
 
 
73 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>