25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GBAA_4070 on replicon NC_007530
Organism: Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS3781  prophage LambdaBa02, repressor protein  100 
 
 
68 aa  140  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4070  prophage LambdaBa02, repressor protein  100 
 
 
68 aa  140  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00909225  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3981  hypothetical protein  69.23 
 
 
73 aa  100  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00547504  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2412  hypothetical protein  54.55 
 
 
66 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364776  normal  0.166132 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2256  hypothetical protein  45.45 
 
 
68 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0821724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2579  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 
65 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000319411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2102  DNA-binding protein  40.74 
 
 
66 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2318  DNA-binding protein  40.74 
 
 
66 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.347078  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2343  DNA-binding protein  40.74 
 
 
66 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2163  DNA-binding protein  40.74 
 
 
66 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1903  transcriptional regulator, XRE family  30.19 
 
 
64 aa  47  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.282612  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  41.27 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5640  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.731345  normal  0.328925 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  33.33 
 
 
67 aa  42  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  33.33 
 
 
66 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
202 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0744  transcriptional regulator  31.25 
 
 
69 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0407  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000097753  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0397  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000557711  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0689  XRE family transcriptional regulator  27.42 
 
 
63 aa  40.8  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285509  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3817  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00145193  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  30.16 
 
 
69 aa  40.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>