More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4443 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4443  bifunctional urease subunit gamma/beta  100 
 
 		 232 aa  467  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.836203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1961  bifunctional urease subunit gamma/beta  48.48 
 
 		 231 aa  220  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1135  bifunctional urease subunit gamma/beta  51.52 
 
 		 231 aa  214  7e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.380732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1356  bifunctional urease subunit gamma/beta  51.52 
 
 		 231 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1196  bifunctional urease subunit gamma/beta  51.08 
 
 		 231 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.113473 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6190  bifunctional urease subunit gamma/beta  50.48 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0272769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2198  bifunctional urease subunit gamma/beta  43.72 
 
 		 231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116358  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2411  urease, beta/gamma subunit  42.86 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6167  urease, beta subunit  43.59 
 
 		 247 aa  171  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.018331 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0888  bifunctional urease subunit gamma/beta  42.42 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3307  urease, gamma subunit  46.77 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0704884  normal  0.481457 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4155  urease, gamma subunit  44.29 
 
 		 206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.877974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0056  urease, beta subunit  42.99 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1553  urease subunit gamma  47.26 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3244  urease, gamma subunit  43.81 
 
 		 206 aa  155  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.502966 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4048  bifunctional urease subunit gamma/beta  36.51 
 
 		 257 aa  154  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3019  urease, gamma subunit  43.81 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0792777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3208  urease, gamma subunit  46.45 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1686  bifunctional urease subunit gamma/beta  44.93 
 
 		 234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.641705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0976  bifunctional urease subunit gamma/beta  36.11 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.745602  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2213  urease, gamma subunit  43.81 
 
 		 206 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0025871 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2863  urease, gamma subunit  43.81 
 
 		 206 aa  149  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.126627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0398  urease, gamma subunit  43.81 
 
 		 206 aa  148  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1260  bifunctional urease subunit gamma/beta  34.65 
 
 		 248 aa  142  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0834  bifunctional urease subunit gamma/beta  44.54 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30221  urease  33.88 
 
 		 840 aa  133  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3503  urease, gamma subunit  38.61 
 
 		 208 aa  133  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29702  predicted protein  31.23 
 
 		 878 aa  123  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2768  bifunctional urease subunit gamma/beta  40.31 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27452  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10079  urease, urea amidohydrolase alpha subunit (Eurofung)  32.55 
 
 		 836 aa  116  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.28583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2611  urease subunit gamma  42.41 
 
 		 200 aa  115  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.158041 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01900  urease  30.43 
 
 		 833 aa  112  7.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1559  urease, beta subunit  49.17 
 
 		 142 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3054  urease subunit beta  54.46 
 
 		 101 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08921  urease subunit beta  50 
 
 		 106 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08941  urease subunit beta  48.08 
 
 		 106 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.349786  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3310  urease subunit beta  53.47 
 
 		 101 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1862  urease, beta subunit  51.49 
 
 		 101 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.779138  normal  0.418463 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2626  urease subunit beta  49.51 
 
 		 106 aa  105  5e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.531681 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29801  urease subunit beta  52.94 
 
 		 105 aa  105  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3620  urease subunit beta  52.38 
 
 		 108 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2270  urease, beta subunit  50.98 
 
 		 113 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3482  urease subunit beta  53.54 
 
 		 101 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2185  urease, beta subunit  50.5 
 
 		 101 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.108548 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3203  urease, beta subunit  50 
 
 		 103 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000313456  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1870  urease subunit beta  50.98 
 
 		 133 aa  102  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.646669  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1557  urease, gamma subunit  44.63 
 
 		 125 aa  102  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3938  urease, beta subunit  49.14 
 
 		 117 aa  102  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3103  urease, beta subunit  51.49 
 
 		 112 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2259  urease, beta subunit  50.5 
 
 		 101 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.972861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2356  urease subunit beta  50 
 
 		 136 aa  102  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2313  urease subunit beta  50 
 
 		 136 aa  102  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2256  urease subunit beta  49.51 
 
 		 106 aa  101  8e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0835  urease subunit beta  48.08 
 
 		 106 aa  101  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2489  urease subunit beta  50.5 
 
 		 101 aa  101  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.832851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2453  urease, beta subunit  51 
 
 		 130 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0726  urease, beta subunit  43.7 
 
 		 127 aa  101  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1801  urease subunit beta  52.48 
 
 		 101 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27877 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3695  urease subunit beta  50.98 
 
 		 104 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0334  urease subunit beta  50.5 
 
 		 101 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3503  urease subunit beta  50.98 
 
 		 104 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0422  urease subunit beta  50.5 
 
 		 101 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0901  urease subunit beta  50.5 
 
 		 101 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1817  urease, beta subunit  45.08 
 
 		 122 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3353  urease, beta subunit  49.09 
 
 		 105 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.880629  normal  0.518335 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4007  urease subunit beta  51.49 
 
 		 101 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.793578  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4836  urease, beta subunit  48.48 
 
 		 122 aa  99.8  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0921761  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2012  urease, beta subunit  51.96 
 
 		 104 aa  99.8  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1054  urease subunit beta  47.52 
 
 		 106 aa  99.4  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19251  urease subunit beta  47.52 
 
 		 106 aa  99.4  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0780  urease subunit beta  50.5 
 
 		 101 aa  99.4  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2033  urease subunit beta protein  48.51 
 
 		 101 aa  99  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279697  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3083  urease, beta subunit  48.18 
 
 		 104 aa  99  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0871  urease subunit beta  49.5 
 
 		 101 aa  98.2  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1428  urease, beta subunit  48.51 
 
 		 101 aa  98.2  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.767872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2845  urease subunit beta  46.85 
 
 		 117 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3693  urease, beta subunit  50.5 
 
 		 101 aa  98.2  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.944796  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2833  urease, beta subunit  48.18 
 
 		 105 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2386  urease subunit beta  50.5 
 
 		 101 aa  98.2  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692731  normal  0.33076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7011  urease subunit beta  50.5 
 
 		 101 aa  97.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.63705  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2850  urease, beta subunit  48.18 
 
 		 105 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2772  urease subunit beta  47.62 
 
 		 111 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0960  urease subunit beta  49.5 
 
 		 101 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.657667  normal  0.124248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1473  urease, beta subunit  44.64 
 
 		 126 aa  98.2  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2806  urease, beta subunit  48.18 
 
 		 105 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0478999  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0791  urease subunit beta  49.5 
 
 		 101 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2844  urease subunit beta  48.54 
 
 		 105 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478498  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0269  urease subunit beta  51.49 
 
 		 101 aa  97.1  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1240  urease, beta subunit  46.15 
 
 		 113 aa  97.1  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2683  urease, beta subunit  52.17 
 
 		 101 aa  97.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171584  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0747  urease subunit beta  48.04 
 
 		 102 aa  97.1  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0283  urease subunit beta  51.49 
 
 		 101 aa  97.1  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.209152  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2936  urease subunit beta  48.54 
 
 		 105 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2416  urease subunit beta  47.57 
 
 		 105 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.417471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1308  urease, beta subunit  54.17 
 
 		 136 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.321935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0308  urease subunit beta  49.5 
 
 		 101 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.441813  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1953  urease subunit beta  49.5 
 
 		 101 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1470  urease, beta subunit  54.17 
 
 		 136 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4184  urease subunit beta  49.5 
 
 		 101 aa  95.9  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1026  urease, beta subunit  50 
 
 		 103 aa  95.9  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>