More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3503 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3503  urease, gamma subunit  100 
 
 
208 aa  408  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1260  bifunctional urease subunit gamma/beta  46.4 
 
 
248 aa  200  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3307  urease, gamma subunit  52.48 
 
 
206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0704884  normal  0.481457 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6190  bifunctional urease subunit gamma/beta  51.47 
 
 
231 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0272769  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1196  bifunctional urease subunit gamma/beta  50.49 
 
 
231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.113473 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2863  urease, gamma subunit  51.49 
 
 
206 aa  193  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.126627 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1135  bifunctional urease subunit gamma/beta  49.51 
 
 
231 aa  193  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.380732  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1356  bifunctional urease subunit gamma/beta  49.02 
 
 
231 aa  192  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4155  urease, gamma subunit  50 
 
 
206 aa  192  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.877974  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0398  urease, gamma subunit  50.99 
 
 
206 aa  192  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3208  urease, gamma subunit  50.99 
 
 
206 aa  191  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2213  urease, gamma subunit  51.98 
 
 
206 aa  190  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0025871 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3244  urease, gamma subunit  50 
 
 
206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.502966 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3019  urease, gamma subunit  50 
 
 
206 aa  188  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0792777  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1961  bifunctional urease subunit gamma/beta  46.08 
 
 
231 aa  187  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0976  bifunctional urease subunit gamma/beta  49.36 
 
 
257 aa  178  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.745602  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4048  bifunctional urease subunit gamma/beta  48.67 
 
 
257 aa  177  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0888  bifunctional urease subunit gamma/beta  44.06 
 
 
215 aa  173  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29702  predicted protein  43.95 
 
 
878 aa  172  2.9999999999999996e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2411  urease, beta/gamma subunit  46.38 
 
 
231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10079  urease, urea amidohydrolase alpha subunit (Eurofung)  44.74 
 
 
836 aa  167  7e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.28583 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2198  bifunctional urease subunit gamma/beta  45.89 
 
 
231 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116358  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30221  urease  41.88 
 
 
840 aa  159  4e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01900  urease  40.18 
 
 
833 aa  158  4e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0056  urease, beta subunit  46.53 
 
 
228 aa  156  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0699  urease, gamma subunit  76.24 
 
 
100 aa  151  8e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0516736  hitchhiker  0.0000000372935 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0268  urease, gamma subunit  73.27 
 
 
100 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6167  urease, beta subunit  44.83 
 
 
247 aa  145  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.018331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2768  bifunctional urease subunit gamma/beta  45.79 
 
 
190 aa  138  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27452  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3411  urease, gamma subunit  69 
 
 
100 aa  133  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1686  bifunctional urease subunit gamma/beta  44.55 
 
 
234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.641705  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4443  bifunctional urease subunit gamma/beta  38.61 
 
 
232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.836203 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2611  urease subunit gamma  45.6 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.158041 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3504  urease subunit gamma  58 
 
 
100 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.94879  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3203  urease, beta subunit  66.3 
 
 
103 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000313456  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1706  urease, gamma subunit  60 
 
 
100 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513247 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0282  urease subunit gamma  58 
 
 
100 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6439  urease subunit gamma  57 
 
 
100 aa  118  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691822  normal  0.288199 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1800  urease subunit gamma  57 
 
 
100 aa  118  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1079  urease, gamma subunit  55.45 
 
 
100 aa  118  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3485  urease subunit gamma  57 
 
 
100 aa  117  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0268  urease subunit gamma  57 
 
 
100 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0977  urease subunit gamma  58 
 
 
100 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0508  urease, gamma subunit  61.39 
 
 
100 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0507  urease, beta subunit  66.3 
 
 
103 aa  116  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3526  urease, gamma subunit  56.44 
 
 
100 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.37751  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1352  urease subunit gamma  57 
 
 
100 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0725  urease, gamma subunit  55 
 
 
100 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2388  urease subunit gamma  55 
 
 
100 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.989941  normal  0.233519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3202  urease, gamma subunit  58 
 
 
100 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000107337  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1211  urease, gamma subunit  58 
 
 
103 aa  115  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4185  urease subunit gamma  56 
 
 
100 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0669  urease  56.44 
 
 
100 aa  115  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161058  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1745  urease, gamma subunit  56 
 
 
100 aa  115  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.430274  normal  0.727576 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3399  urease subunit gamma  56 
 
 
100 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279985  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2307  urease, gamma subunit  57 
 
 
100 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0332  urease subunit gamma  56 
 
 
100 aa  114  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.474292  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5693  urease subunit gamma  61.22 
 
 
114 aa  114  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0985  urease subunit gamma  58 
 
 
100 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187458  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0988  urease, gamma subunit  53 
 
 
100 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2773  urease, gamma subunit  55.88 
 
 
101 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1553  urease subunit gamma  44.57 
 
 
234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2416  urease subunit beta  58.51 
 
 
105 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.417471  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3056  urease subunit gamma  55 
 
 
100 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.23215  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0958  urease subunit gamma  57 
 
 
100 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215977  normal  0.0675214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2845  urease subunit beta  54.81 
 
 
117 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68752  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3312  urease subunit gamma  55 
 
 
100 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6440  urease, beta subunit  60.82 
 
 
122 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290036  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3084  urease subunit gamma  58 
 
 
100 aa  112  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901362  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3696  urease, gamma subunit  54 
 
 
100 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1729  urease, gamma subunit  53 
 
 
100 aa  112  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0689  urease, gamma subunit  53 
 
 
100 aa  112  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1472  urease, gamma subunit  53 
 
 
100 aa  112  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.49465 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4240  urease subunit gamma  54 
 
 
100 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0746  urease, gamma subunit  49 
 
 
108 aa  111  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2681  urease, gamma subunit  55 
 
 
100 aa  111  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.399817  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1025  urease, gamma subunit  54 
 
 
100 aa  111  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.452528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3354  urease subunit gamma  57 
 
 
100 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.664375  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1954  urease subunit gamma  57 
 
 
100 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0309  urease subunit gamma  57 
 
 
100 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.510674  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0834  bifunctional urease subunit gamma/beta  47.52 
 
 
230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3464  urease subunit gamma  55 
 
 
100 aa  110  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000536162  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2757  urease, gamma subunit  57 
 
 
100 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0528404  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0992  urease subunit gamma  55 
 
 
100 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214684  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2386  urease subunit beta  57.61 
 
 
101 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692731  normal  0.33076 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3938  urease, beta subunit  59.57 
 
 
117 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0834  urease subunit gamma  57.14 
 
 
122 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4432  urease subunit gamma  53.47 
 
 
100 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.988903  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1239  urease, gamma subunit  53 
 
 
100 aa  109  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2756  urease, beta subunit  54.21 
 
 
124 aa  109  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.109038  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2306  urease subunit beta  54.26 
 
 
108 aa  109  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0387  urease subunit gamma  55 
 
 
100 aa  109  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3664  urease, gamma subunit  48 
 
 
100 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0391  urease, beta subunit  61.96 
 
 
117 aa  108  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2270  urease, beta subunit  58.51 
 
 
113 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2013  urease, gamma subunit  55 
 
 
100 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0954  urease subunit gamma  54 
 
 
100 aa  108  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1429  urease, gamma subunit region  52 
 
 
100 aa  108  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3621  urease subunit gamma  51 
 
 
100 aa  108  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.706201 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1196  urease, gamma subunit  50 
 
 
100 aa  108  7.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>