173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3411 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3411  urease, gamma subunit  100 
 
 		 100 aa  200  7e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0268  urease, gamma subunit  79.8 
 
 		 100 aa  157  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0699  urease, gamma subunit  78.79 
 
 		 100 aa  152  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0516736  hitchhiker  0.0000000372935 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2388  urease subunit gamma  65.66 
 
 		 100 aa  134  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.989941  normal  0.233519 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3503  urease, gamma subunit  69 
 
 		 208 aa  133  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1211  urease, gamma subunit  66.67 
 
 		 103 aa  133  9e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2369  urease subunit gamma  63.64 
 
 		 100 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.437343 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3485  urease subunit gamma  64.65 
 
 		 100 aa  131  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3696  urease, gamma subunit  63.64 
 
 		 100 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0268  urease subunit gamma  64.65 
 
 		 100 aa  131  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3019  urease, gamma subunit  65.66 
 
 		 206 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0792777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4185  urease subunit gamma  63.64 
 
 		 100 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3244  urease, gamma subunit  65.66 
 
 		 206 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.502966 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0282  urease subunit gamma  64.65 
 
 		 100 aa  130  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113858  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0508  urease, gamma subunit  68.69 
 
 		 100 aa  130  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0332  urease subunit gamma  63.64 
 
 		 100 aa  130  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.474292  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2863  urease, gamma subunit  64.65 
 
 		 206 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.126627 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0985  urease subunit gamma  64.65 
 
 		 100 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3464  urease subunit gamma  63.64 
 
 		 100 aa  129  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000536162  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0725  urease, gamma subunit  61.62 
 
 		 100 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1706  urease, gamma subunit  63.64 
 
 		 100 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1800  urease subunit gamma  61.62 
 
 		 100 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1745  urease, gamma subunit  61.62 
 
 		 100 aa  129  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.430274  normal  0.727576 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3504  urease subunit gamma  61.62 
 
 		 100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.94879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2681  urease, gamma subunit  64.65 
 
 		 100 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.399817  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3056  urease subunit gamma  64.65 
 
 		 100 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.23215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4155  urease, gamma subunit  63.64 
 
 		 206 aa  128  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.877974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1025  urease, gamma subunit  61.62 
 
 		 100 aa  127  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452528 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0976  bifunctional urease subunit gamma/beta  62.63 
 
 		 257 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.745602  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0387  urease subunit gamma  62.63 
 
 		 100 aa  127  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4048  bifunctional urease subunit gamma/beta  61.62 
 
 		 257 aa  127  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2882  urease  62.63 
 
 		 100 aa  126  9.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3307  urease, gamma subunit  63.64 
 
 		 206 aa  126  9.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0704884  normal  0.481457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0398  urease, gamma subunit  63.64 
 
 		 206 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0309  urease subunit gamma  63.64 
 
 		 100 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.510674  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3312  urease subunit gamma  63.64 
 
 		 100 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1954  urease subunit gamma  63.64 
 
 		 100 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3208  urease, gamma subunit  64.65 
 
 		 206 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7012  urease gamma subunit  69.41 
 
 		 86 aa  124  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451916  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1472  urease, gamma subunit  57.58 
 
 		 100 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.49465 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0880  urease subunit gamma  59.6 
 
 		 100 aa  124  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2213  urease, gamma subunit  63.64 
 
 		 206 aa  123  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0025871 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3526  urease, gamma subunit  60.61 
 
 		 100 aa  123  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.37751  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0182  urease subunit gamma  62.63 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64350  urease subunit gamma  60.61 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1818  urease, gamma subunit  59.6 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3202  urease, gamma subunit  60.61 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000107337  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3354  urease subunit gamma  62.63 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.664375  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5586  urease subunit gamma  60.61 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4224  urease, gamma subunit  61.62 
 
 		 100 aa  121  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0781796  normal  0.360909 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4837  urease subunit gamma  58.59 
 
 		 100 aa  121  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164995  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19241  urease subunit gamma  59.6 
 
 		 100 aa  120  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.473665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1185  urease, gamma subunit  62.63 
 
 		 100 aa  120  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1239  urease, gamma subunit  59.6 
 
 		 100 aa  120  6e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2312  urease subunit gamma  55.56 
 
 		 100 aa  120  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.79134  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2355  urease subunit gamma  55.56 
 
 		 100 aa  120  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3084  urease subunit gamma  62.63 
 
 		 100 aa  120  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2307  urease, gamma subunit  60.61 
 
 		 100 aa  119  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0323  urease subunit gamma  55.56 
 
 		 100 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000292656  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2757  urease, gamma subunit  61 
 
 		 100 aa  119  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0528404  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08911  urease subunit gamma  55 
 
 		 100 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.81237  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6439  urease subunit gamma  57.58 
 
 		 100 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691822  normal  0.288199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4891  urease, gamma subunit  57.58 
 
 		 100 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0390  urease subunit gamma  60.61 
 
 		 100 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1053  urease subunit gamma  58 
 
 		 100 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0584  urease subunit gamma  58.59 
 
 		 100 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1079  urease, gamma subunit  57.58 
 
 		 100 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08931  urease subunit gamma  54 
 
 		 100 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.132639  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4240  urease subunit gamma  59.6 
 
 		 100 aa  118  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0834  urease subunit gamma  53 
 
 		 100 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3399  urease subunit gamma  59.6 
 
 		 100 aa  118  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279985  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2625  urease subunit gamma  59.6 
 
 		 100 aa  117  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7363  normal  0.529146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5693  urease subunit gamma  59.79 
 
 		 114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09900  urease subunit gamma  58.59 
 
 		 100 aa  117  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.587773  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4432  urease subunit gamma  57.58 
 
 		 100 aa  117  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.988903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0992  urease subunit gamma  58.59 
 
 		 100 aa  117  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214684  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4411  urease, gamma subunit  57.58 
 
 		 112 aa  116  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2992  urease subunit gamma  57.58 
 
 		 100 aa  116  9e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0695  urease subunit gamma  56.57 
 
 		 100 aa  116  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4008  urease subunit gamma  56.57 
 
 		 100 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.721691  normal  0.266286 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2255  urease subunit gamma  58.59 
 
 		 100 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0834  urease subunit gamma  58.76 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0423  urease subunit gamma  56.57 
 
 		 100 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0746  urease, gamma subunit  52.53 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0781  urease subunit gamma  56.57 
 
 		 100 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0241  urease subunit gamma  59.6 
 
 		 100 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0902  urease subunit gamma  56.57 
 
 		 100 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0977  urease subunit gamma  57.58 
 
 		 100 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1729  urease, gamma subunit  56.57 
 
 		 100 aa  116  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29791  urease subunit gamma  61.62 
 
 		 100 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0669  urease  57.58 
 
 		 100 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0792  urease subunit gamma  56.57 
 
 		 100 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1321  urease subunit gamma  60.61 
 
 		 100 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1196  urease, gamma subunit  54.55 
 
 		 100 aa  116  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2488  urease subunit gamma  56.57 
 
 		 100 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2258  urease subunit gamma  57.58 
 
 		 100 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551581  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1869  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0725  urease subunit gamma  56.57 
 
 		 100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2013  urease, gamma subunit  57.58 
 
 		 100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2443  urease, gamma subunit  57.58 
 
 		 100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.972396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>