173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0725 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0725  urease, gamma subunit  100 
 
 
100 aa  202  1e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1818  urease, gamma subunit  77.78 
 
 
100 aa  159  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0390  urease subunit gamma  74.75 
 
 
100 aa  152  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3526  urease, gamma subunit  70.71 
 
 
100 aa  149  8e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.37751  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1196  urease, gamma subunit  72 
 
 
100 aa  150  8e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1239  urease, gamma subunit  70 
 
 
100 aa  149  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1472  urease, gamma subunit  68.69 
 
 
100 aa  148  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.49465 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0880  urease subunit gamma  67 
 
 
100 aa  147  4e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0241  urease subunit gamma  70.71 
 
 
100 aa  147  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4240  urease subunit gamma  69 
 
 
100 aa  147  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3399  urease subunit gamma  70 
 
 
100 aa  146  9e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279985  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1185  urease, gamma subunit  68 
 
 
100 aa  145  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2307  urease, gamma subunit  67 
 
 
100 aa  145  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0977  urease subunit gamma  68 
 
 
100 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4837  urease subunit gamma  67.68 
 
 
100 aa  144  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164995  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2773  urease, gamma subunit  69.7 
 
 
101 aa  145  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1352  urease subunit gamma  68 
 
 
100 aa  144  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1729  urease, gamma subunit  67 
 
 
100 aa  143  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2035  urease subunit gamma  69 
 
 
100 aa  143  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.16208  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2258  urease subunit gamma  67.68 
 
 
100 aa  143  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551581  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64350  urease subunit gamma  68.69 
 
 
100 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5586  urease subunit gamma  68.69 
 
 
100 aa  142  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1079  urease, gamma subunit  66.67 
 
 
100 aa  142  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1864  urease subunit gamma  68 
 
 
100 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.846387  normal  0.436059 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2488  urease subunit gamma  66.67 
 
 
100 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2187  urease subunit gamma  68 
 
 
100 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0696523 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1769  urease subunit gamma  67.68 
 
 
100 aa  141  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3692  urease subunit gamma  65.66 
 
 
100 aa  141  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0930  urease subunit gamma  65.66 
 
 
100 aa  141  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0689  urease, gamma subunit  65.66 
 
 
100 aa  141  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2882  urease  65.66 
 
 
100 aa  140  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2312  urease subunit gamma  67 
 
 
100 aa  140  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.79134  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2355  urease subunit gamma  67 
 
 
100 aa  140  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0584  urease subunit gamma  67 
 
 
100 aa  140  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4008  urease subunit gamma  65.66 
 
 
100 aa  140  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.721691  normal  0.266286 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0792  urease subunit gamma  65.66 
 
 
100 aa  140  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0423  urease subunit gamma  65.66 
 
 
100 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0781  urease subunit gamma  65.66 
 
 
100 aa  140  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0902  urease subunit gamma  65.66 
 
 
100 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2443  urease, gamma subunit  66.67 
 
 
100 aa  140  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.972396  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0872  urease subunit gamma  64.65 
 
 
100 aa  140  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1498  urease subunit gamma  64.65 
 
 
100 aa  139  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.791581  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2182  urease subunit gamma  64.65 
 
 
100 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.901072  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3621  urease subunit gamma  65.66 
 
 
100 aa  139  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.706201 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3133  urease subunit gamma  64.65 
 
 
100 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0958  urease subunit gamma  65 
 
 
100 aa  139  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215977  normal  0.0675214 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0725  urease subunit gamma  64.65 
 
 
100 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2559  urease subunit gamma  64.65 
 
 
100 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3074  urease subunit gamma  64.65 
 
 
100 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3110  urease subunit gamma  64.65 
 
 
100 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2055  urease subunit gamma  64.65 
 
 
100 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4891  urease, gamma subunit  65.66 
 
 
100 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0992  urease subunit gamma  64 
 
 
100 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214684  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0746  urease, gamma subunit  64 
 
 
108 aa  139  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0695  urease subunit gamma  67.68 
 
 
100 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5693  urease subunit gamma  67.01 
 
 
114 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0669  urease  63.64 
 
 
100 aa  138  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161058  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2454  urease, gamma subunit  64.65 
 
 
100 aa  138  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2271  urease subunit gamma  63.64 
 
 
100 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178249  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3202  urease, gamma subunit  63.64 
 
 
100 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000107337  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3937  urease subunit gamma  64 
 
 
100 aa  137  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3464  urease subunit gamma  64 
 
 
100 aa  137  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000536162  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03420  urease, gamma subunit  63.64 
 
 
100 aa  136  7.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3664  urease, gamma subunit  59.6 
 
 
100 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1429  urease, gamma subunit region  62 
 
 
100 aa  135  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4224  urease, gamma subunit  64.65 
 
 
100 aa  135  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0781796  normal  0.360909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0508  urease, gamma subunit  62.63 
 
 
100 aa  136  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0988  urease, gamma subunit  65 
 
 
100 aa  136  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1869  urease subunit gamma  65 
 
 
100 aa  135  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2757  urease, gamma subunit  64.65 
 
 
100 aa  135  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0528404  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09900  urease subunit gamma  65.66 
 
 
100 aa  135  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.587773  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3084  urease subunit gamma  63.64 
 
 
100 aa  134  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901362  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4411  urease, gamma subunit  64.65 
 
 
112 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6439  urease subunit gamma  64.65 
 
 
100 aa  134  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691822  normal  0.288199 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4432  urease subunit gamma  63.64 
 
 
100 aa  134  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.988903  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0834  urease subunit gamma  63.92 
 
 
122 aa  132  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0332  urease subunit gamma  62.63 
 
 
100 aa  132  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.474292  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0834  urease subunit gamma  58.59 
 
 
100 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0182  urease subunit gamma  61.62 
 
 
100 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3354  urease subunit gamma  62.63 
 
 
100 aa  131  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.664375  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08911  urease subunit gamma  59.6 
 
 
100 aa  131  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.81237  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1800  urease subunit gamma  60.61 
 
 
100 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08931  urease subunit gamma  58.59 
 
 
100 aa  130  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.132639  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00887  urease subunit gamma  61 
 
 
100 aa  131  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3504  urease subunit gamma  60.61 
 
 
100 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.94879  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1025  urease, gamma subunit  60.61 
 
 
100 aa  130  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.452528 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0282  urease subunit gamma  60.61 
 
 
100 aa  130  7.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113858  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1196  bifunctional urease subunit gamma/beta  63.64 
 
 
231 aa  129  9e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.113473 
 
 
-
 
NC_004310  BR0268  urease subunit gamma  60.61 
 
 
100 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6190  bifunctional urease subunit gamma/beta  62.63 
 
 
231 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0272769  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03320  urease, gamma subunit  63.64 
 
 
100 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.968805  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3485  urease subunit gamma  61.62 
 
 
100 aa  129  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1356  bifunctional urease subunit gamma/beta  63.64 
 
 
231 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3411  urease, gamma subunit  61.62 
 
 
100 aa  129  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2863  urease, gamma subunit  62.63 
 
 
206 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.126627 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1706  urease, gamma subunit  61.62 
 
 
100 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513247 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1131  urease subunit gamma  58.59 
 
 
100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.362929  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2992  urease subunit gamma  60 
 
 
100 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2388  urease subunit gamma  60.61 
 
 
100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.989941  normal  0.233519 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1077  urease subunit gamma  58.59 
 
 
100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>