173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1131 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1131  urease subunit gamma  100 
 
 		 100 aa  201  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.362929  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1077  urease subunit gamma  100 
 
 		 100 aa  201  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5112  urease, gamma subunit  65 
 
 		 100 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.755356 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0992  urease subunit gamma  62.63 
 
 		 100 aa  138  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214684  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1309  urease, gamma subunit  63 
 
 		 100 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0977  urease subunit gamma  63.64 
 
 		 100 aa  137  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1471  urease, gamma subunit  64 
 
 		 100 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4240  urease subunit gamma  63.64 
 
 		 100 aa  137  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1356  urease subunit gamma  62.63 
 
 		 100 aa  136  7.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.291374  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1312  urease subunit gamma  62.63 
 
 		 100 aa  136  8.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0958  urease subunit gamma  61.62 
 
 		 100 aa  136  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215977  normal  0.0675214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2454  urease, gamma subunit  64 
 
 		 100 aa  135  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1079  urease, gamma subunit  60.61 
 
 		 100 aa  134  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1864  urease subunit gamma  61.62 
 
 		 100 aa  134  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.846387  normal  0.436059 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2187  urease subunit gamma  61.62 
 
 		 100 aa  134  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0696523 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1429  urease, gamma subunit region  59.6 
 
 		 100 aa  134  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2035  urease subunit gamma  60.61 
 
 		 100 aa  133  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.16208  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1352  urease subunit gamma  60.61 
 
 		 100 aa  133  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4008  urease subunit gamma  61.62 
 
 		 100 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.721691  normal  0.266286 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0792  urease subunit gamma  61.62 
 
 		 100 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0423  urease subunit gamma  61.62 
 
 		 100 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0781  urease subunit gamma  61.62 
 
 		 100 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0902  urease subunit gamma  61.62 
 
 		 100 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4224  urease, gamma subunit  61 
 
 		 100 aa  132  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0781796  normal  0.360909 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1769  urease subunit gamma  60.61 
 
 		 100 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0669  urease  60.61 
 
 		 100 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0872  urease subunit gamma  60.61 
 
 		 100 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2258  urease subunit gamma  60.61 
 
 		 100 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2773  urease, gamma subunit  60 
 
 		 101 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3399  urease subunit gamma  59.6 
 
 		 100 aa  131  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279985  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2488  urease subunit gamma  60.61 
 
 		 100 aa  131  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1239  urease, gamma subunit  60.61 
 
 		 100 aa  130  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3692  urease subunit gamma  59.6 
 
 		 100 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0689  urease, gamma subunit  62 
 
 		 100 aa  130  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1729  urease, gamma subunit  58.59 
 
 		 100 aa  130  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3664  urease, gamma subunit  55.56 
 
 		 100 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1498  urease subunit gamma  58.59 
 
 		 100 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.791581  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0930  urease subunit gamma  58.59 
 
 		 100 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1818  urease, gamma subunit  58 
 
 		 100 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2182  urease subunit gamma  58.59 
 
 		 100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.901072  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3133  urease subunit gamma  58.59 
 
 		 100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0725  urease, gamma subunit  58.59 
 
 		 100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0182  urease subunit gamma  58 
 
 		 100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3526  urease, gamma subunit  59.6 
 
 		 100 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.37751  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0725  urease subunit gamma  58.59 
 
 		 100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0390  urease subunit gamma  58 
 
 		 100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2559  urease subunit gamma  58.59 
 
 		 100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3074  urease subunit gamma  58.59 
 
 		 100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3110  urease subunit gamma  58.59 
 
 		 100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2055  urease subunit gamma  58.59 
 
 		 100 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3937  urease subunit gamma  56.57 
 
 		 100 aa  127  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03420  urease, gamma subunit  59 
 
 		 100 aa  127  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0241  urease subunit gamma  58 
 
 		 100 aa  127  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2307  urease, gamma subunit  56.57 
 
 		 100 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4837  urease subunit gamma  56 
 
 		 100 aa  127  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164995  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1196  urease, gamma subunit  56.57 
 
 		 100 aa  127  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4411  urease, gamma subunit  57 
 
 		 112 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3621  urease subunit gamma  57 
 
 		 100 aa  126  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.706201 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1135  bifunctional urease subunit gamma/beta  59 
 
 		 231 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.380732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1356  bifunctional urease subunit gamma/beta  58 
 
 		 231 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2271  urease subunit gamma  54 
 
 		 100 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1196  bifunctional urease subunit gamma/beta  58 
 
 		 231 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.113473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1185  urease, gamma subunit  56.57 
 
 		 100 aa  126  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6190  bifunctional urease subunit gamma/beta  56 
 
 		 231 aa  124  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0272769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0323  urease subunit gamma  57 
 
 		 100 aa  124  6e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000292656  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0880  urease subunit gamma  54.55 
 
 		 100 aa  123  8.000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2992  urease subunit gamma  58.59 
 
 		 100 aa  123  9e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3102  urease subunit gamma  60 
 
 		 100 aa  122  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29791  urease subunit gamma  55 
 
 		 100 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64350  urease subunit gamma  54.55 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3464  urease subunit gamma  55.56 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000536162  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5586  urease subunit gamma  54.55 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4432  urease subunit gamma  54.55 
 
 		 100 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.988903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0387  urease subunit gamma  55 
 
 		 100 aa  121  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1961  bifunctional urease subunit gamma/beta  54 
 
 		 231 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4891  urease, gamma subunit  54.55 
 
 		 100 aa  121  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1472  urease, gamma subunit  52 
 
 		 100 aa  120  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.49465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2712  Urease  54.55 
 
 		 101 aa  120  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0988  urease, gamma subunit  54.55 
 
 		 100 aa  120  7e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0584  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2443  urease, gamma subunit  54.55 
 
 		 100 aa  119  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.972396  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0746  urease, gamma subunit  53.54 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3307  urease, gamma subunit  58 
 
 		 206 aa  118  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0704884  normal  0.481457 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2882  urease  53.54 
 
 		 100 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5693  urease subunit gamma  53.61 
 
 		 114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4155  urease, gamma subunit  55 
 
 		 206 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.877974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2388  urease subunit gamma  53 
 
 		 100 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.989941  normal  0.233519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3202  urease, gamma subunit  52.53 
 
 		 100 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000107337  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3485  urease subunit gamma  53 
 
 		 100 aa  117  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0508  urease, gamma subunit  53 
 
 		 100 aa  117  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09900  urease subunit gamma  52.53 
 
 		 100 aa  117  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.587773  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1321  urease subunit gamma  57.58 
 
 		 100 aa  117  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2068  urease, gamma subunit  53.54 
 
 		 102 aa  116  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000614886  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2757  urease, gamma subunit  53.54 
 
 		 100 aa  116  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0528404  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0834  urease subunit gamma  54.64 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19241  urease subunit gamma  52 
 
 		 100 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.473665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0695  urease subunit gamma  51.52 
 
 		 100 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00887  urease subunit gamma  54.55 
 
 		 100 aa  116  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3084  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2013  urease, gamma subunit  54 
 
 		 100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>