More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1961 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1961  bifunctional urease subunit gamma/beta  100 
 
 		 231 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1356  bifunctional urease subunit gamma/beta  73.16 
 
 		 231 aa  323  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1135  bifunctional urease subunit gamma/beta  73.16 
 
 		 231 aa  322  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.380732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1196  bifunctional urease subunit gamma/beta  73.16 
 
 		 231 aa  321  7e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.113473 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6190  bifunctional urease subunit gamma/beta  73.16 
 
 		 231 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0272769  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2411  urease, beta/gamma subunit  63.64 
 
 		 231 aa  299  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2198  bifunctional urease subunit gamma/beta  64.07 
 
 		 231 aa  299  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4155  urease, gamma subunit  55.77 
 
 		 206 aa  232  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.877974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0888  bifunctional urease subunit gamma/beta  49.12 
 
 		 215 aa  224  9e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3307  urease, gamma subunit  56.37 
 
 		 206 aa  223  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0704884  normal  0.481457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2213  urease, gamma subunit  54.46 
 
 		 206 aa  221  7e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0025871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4443  bifunctional urease subunit gamma/beta  48.48 
 
 		 232 aa  220  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.836203 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0398  urease, gamma subunit  53.96 
 
 		 206 aa  219  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3208  urease, gamma subunit  53.11 
 
 		 206 aa  217  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0056  urease, beta subunit  49.12 
 
 		 228 aa  217  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2863  urease, gamma subunit  53.47 
 
 		 206 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.126627 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1260  bifunctional urease subunit gamma/beta  43.82 
 
 		 248 aa  208  6e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3244  urease, gamma subunit  51.47 
 
 		 206 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.502966 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3019  urease, gamma subunit  51.47 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0792777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29702  predicted protein  42.63 
 
 		 878 aa  202  3e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4048  bifunctional urease subunit gamma/beta  44.44 
 
 		 257 aa  201  9e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1686  bifunctional urease subunit gamma/beta  56.04 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.641705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0976  bifunctional urease subunit gamma/beta  45.63 
 
 		 257 aa  197  9e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.745602  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3503  urease, gamma subunit  46.08 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6167  urease, beta subunit  43.16 
 
 		 247 aa  178  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.018331 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10079  urease, urea amidohydrolase alpha subunit (Eurofung)  43.4 
 
 		 836 aa  175  5e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.28583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2768  bifunctional urease subunit gamma/beta  52.36 
 
 		 190 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2611  urease subunit gamma  51.78 
 
 		 200 aa  169  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.158041 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01900  urease  42.24 
 
 		 833 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1553  urease subunit gamma  47.64 
 
 		 234 aa  163  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30221  urease  40.65 
 
 		 840 aa  162  6e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0834  bifunctional urease subunit gamma/beta  46.49 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2773  urease, gamma subunit  70 
 
 		 101 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03420  urease, gamma subunit  68 
 
 		 100 aa  143  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2454  urease, gamma subunit  69 
 
 		 100 aa  142  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4224  urease, gamma subunit  69 
 
 		 100 aa  141  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0781796  normal  0.360909 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2307  urease, gamma subunit  67.68 
 
 		 100 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0390  urease subunit gamma  65 
 
 		 100 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1817  urease, beta subunit  54.17 
 
 		 122 aa  137  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0241  urease subunit gamma  64 
 
 		 100 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3354  urease subunit gamma  68.69 
 
 		 100 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.664375  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0992  urease subunit gamma  66.67 
 
 		 100 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214684  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3621  urease subunit gamma  65 
 
 		 100 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.706201 
 
 
-
 
NC_004310  BR1357  urease subunit beta  49.67 
 
 		 159 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.4189  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2271  urease subunit gamma  63 
 
 		 100 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1313  urease subunit beta  54.69 
 
 		 164 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2035  urease subunit gamma  64.65 
 
 		 100 aa  132  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.16208  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0958  urease subunit gamma  65.66 
 
 		 100 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215977  normal  0.0675214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4411  urease, gamma subunit  59.09 
 
 		 112 aa  131  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1559  urease, beta subunit  51.28 
 
 		 142 aa  131  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1769  urease subunit gamma  63.64 
 
 		 100 aa  131  9e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0688  urease subunit beta  57.14 
 
 		 106 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1818  urease, gamma subunit  60 
 
 		 100 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4240  urease subunit gamma  65.66 
 
 		 100 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1864  urease subunit gamma  63.64 
 
 		 100 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.846387  normal  0.436059 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3202  urease, gamma subunit  63.64 
 
 		 100 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000107337  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3937  urease subunit gamma  64.65 
 
 		 100 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2187  urease subunit gamma  63.64 
 
 		 100 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0696523 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0689  urease, gamma subunit  61 
 
 		 100 aa  129  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4837  urease subunit gamma  60 
 
 		 100 aa  129  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164995  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0669  urease  66.67 
 
 		 100 aa  129  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2881  urease  59.18 
 
 		 101 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3664  urease, gamma subunit  61.62 
 
 		 100 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2258  urease subunit gamma  62.63 
 
 		 100 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3084  urease subunit gamma  64.65 
 
 		 100 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0977  urease subunit gamma  63.64 
 
 		 100 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1352  urease subunit gamma  64.65 
 
 		 100 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2488  urease subunit gamma  62.63 
 
 		 100 aa  128  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0834  urease subunit gamma  65.66 
 
 		 122 aa  128  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2443  urease, gamma subunit  62.63 
 
 		 100 aa  128  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.972396  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1557  urease, gamma subunit  55.56 
 
 		 125 aa  128  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2757  urease, gamma subunit  63.64 
 
 		 100 aa  128  8.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0528404  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4008  urease subunit gamma  62.63 
 
 		 100 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.721691  normal  0.266286 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0792  urease subunit gamma  62.63 
 
 		 100 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0423  urease subunit gamma  62.63 
 
 		 100 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0781  urease subunit gamma  62.63 
 
 		 100 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0902  urease subunit gamma  62.63 
 
 		 100 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2182  urease subunit gamma  62.63 
 
 		 100 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.901072  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2055  urease subunit gamma  62.63 
 
 		 100 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3133  urease subunit gamma  62.63 
 
 		 100 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3110  urease subunit gamma  62.63 
 
 		 100 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3399  urease subunit gamma  63.64 
 
 		 100 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279985  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0725  urease subunit gamma  62.63 
 
 		 100 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2559  urease subunit gamma  62.63 
 
 		 100 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3074  urease subunit gamma  62.63 
 
 		 100 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3692  urease subunit gamma  61.62 
 
 		 100 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2068  urease, gamma subunit  58.59 
 
 		 102 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000614886  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0872  urease subunit gamma  61.62 
 
 		 100 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1869  urease subunit gamma  58.59 
 
 		 100 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5693  urease subunit gamma  62.63 
 
 		 114 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0725  urease, gamma subunit  57.58 
 
 		 100 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0930  urease subunit gamma  60.61 
 
 		 100 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1079  urease, gamma subunit  61.62 
 
 		 100 aa  126  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1498  urease subunit gamma  60.61 
 
 		 100 aa  126  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.791581  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3526  urease, gamma subunit  61.62 
 
 		 100 aa  126  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.37751  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1729  urease, gamma subunit  62.63 
 
 		 100 aa  126  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1240  urease, beta subunit  56.73 
 
 		 113 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2388  urease subunit gamma  62 
 
 		 100 aa  125  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.989941  normal  0.233519 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0746  urease, gamma subunit  56.57 
 
 		 108 aa  125  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0747  urease subunit beta  59.38 
 
 		 102 aa  125  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>