More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1196 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1196  bifunctional urease subunit gamma/beta  100 
 
 		 231 aa  461  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.113473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1356  bifunctional urease subunit gamma/beta  97.84 
 
 		 231 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1135  bifunctional urease subunit gamma/beta  95.24 
 
 		 231 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.380732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6190  bifunctional urease subunit gamma/beta  88.31 
 
 		 231 aa  380  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0272769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1961  bifunctional urease subunit gamma/beta  73.16 
 
 		 231 aa  340  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2198  bifunctional urease subunit gamma/beta  64.07 
 
 		 231 aa  298  6e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116358  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2411  urease, beta/gamma subunit  64.07 
 
 		 231 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4155  urease, gamma subunit  58.57 
 
 		 206 aa  241  7.999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.877974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0888  bifunctional urease subunit gamma/beta  54.11 
 
 		 215 aa  236  3e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0398  urease, gamma subunit  58.57 
 
 		 206 aa  234  9e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3307  urease, gamma subunit  58.1 
 
 		 206 aa  228  7e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0704884  normal  0.481457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2213  urease, gamma subunit  58.91 
 
 		 206 aa  227  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0025871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4443  bifunctional urease subunit gamma/beta  51.08 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.836203 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3208  urease, gamma subunit  58.42 
 
 		 206 aa  225  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3244  urease, gamma subunit  55.45 
 
 		 206 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.502966 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3019  urease, gamma subunit  55.45 
 
 		 206 aa  217  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0792777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2863  urease, gamma subunit  55.24 
 
 		 206 aa  216  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.126627 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0056  urease, beta subunit  50.22 
 
 		 228 aa  210  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0976  bifunctional urease subunit gamma/beta  50.4 
 
 		 257 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.745602  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1686  bifunctional urease subunit gamma/beta  53.02 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.641705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1260  bifunctional urease subunit gamma/beta  46.78 
 
 		 248 aa  201  7e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4048  bifunctional urease subunit gamma/beta  46.03 
 
 		 257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3503  urease, gamma subunit  50.49 
 
 		 208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29702  predicted protein  41.04 
 
 		 878 aa  193  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10079  urease, urea amidohydrolase alpha subunit (Eurofung)  43.53 
 
 		 836 aa  188  5.999999999999999e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.28583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2768  bifunctional urease subunit gamma/beta  54.45 
 
 		 190 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6167  urease, beta subunit  43.59 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.018331 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30221  urease  40.24 
 
 		 840 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01900  urease  40.64 
 
 		 833 aa  171  6.999999999999999e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2611  urease subunit gamma  52.28 
 
 		 200 aa  164  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.158041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1553  urease subunit gamma  49.57 
 
 		 234 aa  158  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0834  bifunctional urease subunit gamma/beta  48.91 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03420  urease, gamma subunit  67 
 
 		 100 aa  144  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4224  urease, gamma subunit  71 
 
 		 100 aa  143  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0781796  normal  0.360909 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2773  urease, gamma subunit  70 
 
 		 101 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2035  urease subunit gamma  69.7 
 
 		 100 aa  141  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.16208  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2454  urease, gamma subunit  68 
 
 		 100 aa  140  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3937  urease subunit gamma  69.7 
 
 		 100 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0390  urease subunit gamma  67 
 
 		 100 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2187  urease subunit gamma  67.68 
 
 		 100 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0696523 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0992  urease subunit gamma  69.7 
 
 		 100 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214684  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1864  urease subunit gamma  67.68 
 
 		 100 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.846387  normal  0.436059 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1769  urease subunit gamma  67.68 
 
 		 100 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0958  urease subunit gamma  69.7 
 
 		 100 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215977  normal  0.0675214 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2271  urease subunit gamma  64 
 
 		 100 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0241  urease subunit gamma  65 
 
 		 100 aa  135  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1817  urease, beta subunit  55.83 
 
 		 122 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0669  urease  67.68 
 
 		 100 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0977  urease subunit gamma  64.65 
 
 		 100 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2258  urease subunit gamma  65.66 
 
 		 100 aa  132  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3621  urease subunit gamma  65 
 
 		 100 aa  132  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.706201 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3399  urease subunit gamma  64.65 
 
 		 100 aa  133  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279985  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1352  urease subunit gamma  65.66 
 
 		 100 aa  132  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4240  urease subunit gamma  64.65 
 
 		 100 aa  132  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2488  urease subunit gamma  65.66 
 
 		 100 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0930  urease subunit gamma  64.65 
 
 		 100 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3938  urease, beta subunit  64 
 
 		 117 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4008  urease subunit gamma  65.66 
 
 		 100 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.721691  normal  0.266286 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0792  urease subunit gamma  65.66 
 
 		 100 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0423  urease subunit gamma  65.66 
 
 		 100 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0781  urease subunit gamma  65.66 
 
 		 100 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0902  urease subunit gamma  65.66 
 
 		 100 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3074  urease subunit gamma  65.66 
 
 		 100 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2559  urease subunit gamma  65.66 
 
 		 100 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2182  urease subunit gamma  65.66 
 
 		 100 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.901072  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3133  urease subunit gamma  65.66 
 
 		 100 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3110  urease subunit gamma  65.66 
 
 		 100 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3692  urease subunit gamma  64.65 
 
 		 100 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2055  urease subunit gamma  65.66 
 
 		 100 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0725  urease subunit gamma  65.66 
 
 		 100 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2270  urease, beta subunit  63 
 
 		 113 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1357  urease subunit beta  47.44 
 
 		 159 aa  131  6.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.4189  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0872  urease subunit gamma  64.65 
 
 		 100 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2307  urease, gamma subunit  65.66 
 
 		 100 aa  131  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1869  urease subunit gamma  61.62 
 
 		 100 aa  131  7.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1729  urease, gamma subunit  63.64 
 
 		 100 aa  131  7.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3084  urease subunit gamma  67.68 
 
 		 100 aa  131  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3054  urease subunit beta  64.65 
 
 		 101 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3202  urease, gamma subunit  66.67 
 
 		 100 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000107337  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3310  urease subunit beta  64.65 
 
 		 101 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1313  urease subunit beta  51.91 
 
 		 164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2845  urease subunit beta  57.52 
 
 		 117 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1818  urease, gamma subunit  62 
 
 		 100 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1498  urease subunit gamma  63.64 
 
 		 100 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.791581  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2994  urease subunit beta  61.39 
 
 		 105 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3482  urease subunit beta  64.52 
 
 		 101 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2757  urease, gamma subunit  66.67 
 
 		 100 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0528404  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2844  urease subunit beta  61.17 
 
 		 105 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0725  urease, gamma subunit  63.64 
 
 		 100 aa  129  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4837  urease subunit gamma  60 
 
 		 100 aa  129  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164995  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1185  urease, gamma subunit  63.64 
 
 		 100 aa  129  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2936  urease subunit beta  61.17 
 
 		 105 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3664  urease, gamma subunit  60 
 
 		 100 aa  129  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3354  urease subunit gamma  67.68 
 
 		 100 aa  128  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.664375  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1079  urease, gamma subunit  62.63 
 
 		 100 aa  128  7.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1239  urease, gamma subunit  65.66 
 
 		 100 aa  128  8.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0689  urease, gamma subunit  60 
 
 		 100 aa  128  8.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5693  urease subunit gamma  65.66 
 
 		 114 aa  128  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0746  urease, gamma subunit  59.6 
 
 		 108 aa  128  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1429  urease, gamma subunit region  63.64 
 
 		 100 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>