173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2187 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1864  urease subunit gamma  100 
 
 		 100 aa  203  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.846387  normal  0.436059 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2187  urease subunit gamma  100 
 
 		 100 aa  203  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0696523 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2035  urease subunit gamma  92 
 
 		 100 aa  189  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.16208  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0930  urease subunit gamma  88.89 
 
 		 100 aa  186  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0792  urease subunit gamma  89.9 
 
 		 100 aa  185  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0992  urease subunit gamma  89 
 
 		 100 aa  185  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4008  urease subunit gamma  89.9 
 
 		 100 aa  185  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.721691  normal  0.266286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0423  urease subunit gamma  89.9 
 
 		 100 aa  185  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0781  urease subunit gamma  89.9 
 
 		 100 aa  185  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0902  urease subunit gamma  89.9 
 
 		 100 aa  185  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0872  urease subunit gamma  88.89 
 
 		 100 aa  184  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2488  urease subunit gamma  88.89 
 
 		 100 aa  184  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0958  urease subunit gamma  89 
 
 		 100 aa  184  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215977  normal  0.0675214 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3692  urease subunit gamma  87.88 
 
 		 100 aa  183  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1498  urease subunit gamma  86.87 
 
 		 100 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.791581  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2182  urease subunit gamma  86.87 
 
 		 100 aa  181  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.901072  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3133  urease subunit gamma  86.87 
 
 		 100 aa  181  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1769  urease subunit gamma  88.89 
 
 		 100 aa  181  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0725  urease subunit gamma  86.87 
 
 		 100 aa  181  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2559  urease subunit gamma  86.87 
 
 		 100 aa  181  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3074  urease subunit gamma  86.87 
 
 		 100 aa  181  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3110  urease subunit gamma  86.87 
 
 		 100 aa  181  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2055  urease subunit gamma  86.87 
 
 		 100 aa  181  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2258  urease subunit gamma  86.87 
 
 		 100 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3399  urease subunit gamma  87 
 
 		 100 aa  180  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279985  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4240  urease subunit gamma  88 
 
 		 100 aa  180  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2271  urease subunit gamma  83.84 
 
 		 100 aa  179  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1185  urease, gamma subunit  85 
 
 		 100 aa  179  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0977  urease subunit gamma  86 
 
 		 100 aa  178  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1729  urease, gamma subunit  87 
 
 		 100 aa  178  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1352  urease subunit gamma  87 
 
 		 100 aa  177  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1196  urease, gamma subunit  86 
 
 		 100 aa  175  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1429  urease, gamma subunit region  83 
 
 		 100 aa  175  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3621  urease subunit gamma  82.83 
 
 		 100 aa  175  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.706201 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3937  urease subunit gamma  84 
 
 		 100 aa  175  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1079  urease, gamma subunit  85.86 
 
 		 100 aa  174  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64350  urease subunit gamma  82.83 
 
 		 100 aa  173  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5586  urease subunit gamma  82.83 
 
 		 100 aa  173  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4432  urease subunit gamma  80.81 
 
 		 100 aa  172  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.988903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0584  urease subunit gamma  81 
 
 		 100 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4891  urease, gamma subunit  80.81 
 
 		 100 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0669  urease  82.83 
 
 		 100 aa  170  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2882  urease  80.81 
 
 		 100 aa  170  7.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3526  urease, gamma subunit  83.84 
 
 		 100 aa  169  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.37751  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0695  urease subunit gamma  77.78 
 
 		 100 aa  167  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2443  urease, gamma subunit  81.82 
 
 		 100 aa  167  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.972396  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0746  urease, gamma subunit  74 
 
 		 108 aa  167  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09900  urease subunit gamma  79.8 
 
 		 100 aa  166  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.587773  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1239  urease, gamma subunit  80 
 
 		 100 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2992  urease subunit gamma  78 
 
 		 100 aa  164  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4411  urease, gamma subunit  75.76 
 
 		 112 aa  164  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00887  urease subunit gamma  74 
 
 		 100 aa  160  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2307  urease, gamma subunit  76 
 
 		 100 aa  160  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3464  urease subunit gamma  78 
 
 		 100 aa  160  7e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000536162  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0182  urease subunit gamma  75.76 
 
 		 100 aa  159  8.000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0954  urease subunit gamma  77.78 
 
 		 100 aa  159  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4224  urease, gamma subunit  75.76 
 
 		 100 aa  157  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0781796  normal  0.360909 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0988  urease, gamma subunit  73 
 
 		 100 aa  157  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0880  urease subunit gamma  74 
 
 		 100 aa  157  5e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2773  urease, gamma subunit  74.75 
 
 		 101 aa  154  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0390  urease subunit gamma  73.74 
 
 		 100 aa  152  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0241  urease subunit gamma  72.73 
 
 		 100 aa  150  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4837  urease subunit gamma  69.7 
 
 		 100 aa  150  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164995  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2454  urease, gamma subunit  72.73 
 
 		 100 aa  150  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3102  urease subunit gamma  80.81 
 
 		 100 aa  149  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0834  urease subunit gamma  65.66 
 
 		 100 aa  149  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08911  urease subunit gamma  66.67 
 
 		 100 aa  149  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.81237  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08931  urease subunit gamma  65.66 
 
 		 100 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.132639  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1472  urease, gamma subunit  67.68 
 
 		 100 aa  147  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.49465 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1869  urease subunit gamma  68 
 
 		 100 aa  145  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2995  urease subunit gamma  79 
 
 		 100 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2312  urease subunit gamma  68 
 
 		 100 aa  145  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.79134  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2355  urease subunit gamma  68 
 
 		 100 aa  145  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4185  urease subunit gamma  68.69 
 
 		 100 aa  144  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3307  urease, gamma subunit  71.72 
 
 		 206 aa  144  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0704884  normal  0.481457 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3664  urease, gamma subunit  69.7 
 
 		 100 aa  144  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0268  urease subunit gamma  70.71 
 
 		 100 aa  144  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0282  urease subunit gamma  70.71 
 
 		 100 aa  144  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113858  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1053  urease subunit gamma  66.67 
 
 		 100 aa  143  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3504  urease subunit gamma  69.7 
 
 		 100 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.94879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1800  urease subunit gamma  68.69 
 
 		 100 aa  143  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1818  urease, gamma subunit  69.7 
 
 		 100 aa  143  9e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1706  urease, gamma subunit  69.7 
 
 		 100 aa  142  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513247 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2843  urease subunit gamma  79 
 
 		 100 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1025  urease, gamma subunit  66.67 
 
 		 100 aa  141  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452528 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2937  urease subunit gamma  79 
 
 		 100 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0725  urease, gamma subunit  68 
 
 		 100 aa  142  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3485  urease subunit gamma  67.68 
 
 		 100 aa  142  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2846  urease subunit gamma  79 
 
 		 100 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.343873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1321  urease subunit gamma  78 
 
 		 100 aa  142  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0219  urease subunit gamma  77 
 
 		 100 aa  141  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.771264 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0332  urease subunit gamma  70.71 
 
 		 100 aa  141  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.474292  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2255  urease subunit gamma  65.66 
 
 		 100 aa  141  4e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2625  urease subunit gamma  66.67 
 
 		 100 aa  140  4e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7363  normal  0.529146 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0689  urease, gamma subunit  67.68 
 
 		 100 aa  140  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19241  urease subunit gamma  65.66 
 
 		 100 aa  140  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.473665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29791  urease subunit gamma  66.67 
 
 		 100 aa  140  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2388  urease subunit gamma  67.68 
 
 		 100 aa  140  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.989941  normal  0.233519 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2415  urease subunit gamma  78 
 
 		 100 aa  139  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3312  urease subunit gamma  67.68 
 
 		 100 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>