More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3307 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3307  urease, gamma subunit  100 
 
 		 206 aa  411  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0704884  normal  0.481457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0398  urease, gamma subunit  75.73 
 
 		 206 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2863  urease, gamma subunit  75.24 
 
 		 206 aa  316  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.126627 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2213  urease, gamma subunit  75.73 
 
 		 206 aa  315  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0025871 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4155  urease, gamma subunit  75.73 
 
 		 206 aa  315  3e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.877974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3208  urease, gamma subunit  75.73 
 
 		 206 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3019  urease, gamma subunit  73.79 
 
 		 206 aa  311  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0792777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3244  urease, gamma subunit  73.79 
 
 		 206 aa  311  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.502966 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1135  bifunctional urease subunit gamma/beta  59.05 
 
 		 231 aa  230  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.380732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1356  bifunctional urease subunit gamma/beta  58.1 
 
 		 231 aa  230  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1196  bifunctional urease subunit gamma/beta  58.1 
 
 		 231 aa  228  6e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.113473 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6190  bifunctional urease subunit gamma/beta  59.05 
 
 		 231 aa  227  8e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0272769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1961  bifunctional urease subunit gamma/beta  56.37 
 
 		 231 aa  223  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0888  bifunctional urease subunit gamma/beta  55.02 
 
 		 215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2198  bifunctional urease subunit gamma/beta  51.43 
 
 		 231 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116358  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2411  urease, beta/gamma subunit  50.95 
 
 		 231 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4048  bifunctional urease subunit gamma/beta  48.89 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3503  urease, gamma subunit  52.48 
 
 		 208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1260  bifunctional urease subunit gamma/beta  45.7 
 
 		 248 aa  191  6e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0976  bifunctional urease subunit gamma/beta  48 
 
 		 257 aa  191  8e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.745602  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0056  urease, beta subunit  51.17 
 
 		 228 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29702  predicted protein  45.74 
 
 		 878 aa  187  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2388  urease subunit gamma  89 
 
 		 100 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.989941  normal  0.233519 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3485  urease subunit gamma  88 
 
 		 100 aa  183  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2681  urease, gamma subunit  90 
 
 		 100 aa  182  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.399817  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3312  urease subunit gamma  88 
 
 		 100 aa  181  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0332  urease subunit gamma  87 
 
 		 100 aa  181  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.474292  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1745  urease, gamma subunit  87 
 
 		 100 aa  181  9.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.430274  normal  0.727576 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0282  urease subunit gamma  86 
 
 		 100 aa  179  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113858  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3056  urease subunit gamma  88 
 
 		 100 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.23215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4185  urease subunit gamma  85 
 
 		 100 aa  177  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0268  urease subunit gamma  85 
 
 		 100 aa  177  9e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1800  urease subunit gamma  82 
 
 		 100 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3504  urease subunit gamma  82 
 
 		 100 aa  175  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.94879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0985  urease subunit gamma  83 
 
 		 100 aa  175  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2369  urease subunit gamma  85 
 
 		 100 aa  174  6e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.437343 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0309  urease subunit gamma  83 
 
 		 100 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.510674  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1954  urease subunit gamma  83 
 
 		 100 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1025  urease, gamma subunit  82 
 
 		 100 aa  172  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452528 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1211  urease, gamma subunit  78.64 
 
 		 103 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6167  urease, beta subunit  45.93 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.018331 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3696  urease, gamma subunit  81 
 
 		 100 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0387  urease subunit gamma  81 
 
 		 100 aa  167  9e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1706  urease, gamma subunit  82 
 
 		 100 aa  167  9e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513247 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01900  urease  44 
 
 		 833 aa  166  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2013  urease, gamma subunit  82 
 
 		 100 aa  166  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4443  bifunctional urease subunit gamma/beta  46.77 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.836203 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1686  bifunctional urease subunit gamma/beta  53.23 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.641705  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10079  urease, urea amidohydrolase alpha subunit (Eurofung)  42.11 
 
 		 836 aa  161  8.000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.28583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1553  urease subunit gamma  50.72 
 
 		 234 aa  157  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2386  urease subunit beta  72.28 
 
 		 101 aa  156  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692731  normal  0.33076 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2683  urease, beta subunit  72.28 
 
 		 101 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171584  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3464  urease subunit gamma  74.75 
 
 		 100 aa  154  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000536162  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2368  urease subunit beta  68.32 
 
 		 101 aa  154  8e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.569035 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30221  urease  40.66 
 
 		 840 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2768  bifunctional urease subunit gamma/beta  49.2 
 
 		 190 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27452  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0269  urease subunit beta  69.31 
 
 		 101 aa  151  5.9999999999999996e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0283  urease subunit beta  69.31 
 
 		 101 aa  151  5.9999999999999996e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.209152  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2012  urease, beta subunit  70.3 
 
 		 104 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1747  urease, beta subunit  72.28 
 
 		 101 aa  151  8e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.641327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3054  urease subunit beta  70.3 
 
 		 101 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0834  bifunctional urease subunit gamma/beta  51.2 
 
 		 230 aa  149  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0334  urease subunit beta  66.34 
 
 		 101 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3482  urease subunit beta  69.7 
 
 		 101 aa  149  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3310  urease subunit beta  70.3 
 
 		 101 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2611  urease subunit gamma  50.8 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.158041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3695  urease subunit beta  69.31 
 
 		 104 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0669  urease  74.75 
 
 		 100 aa  148  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4240  urease subunit gamma  75.76 
 
 		 100 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7012  urease gamma subunit  82.56 
 
 		 86 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451916  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0508  urease, gamma subunit  73.74 
 
 		 100 aa  146  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2773  urease, gamma subunit  71 
 
 		 101 aa  145  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4224  urease, gamma subunit  72 
 
 		 100 aa  145  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0781796  normal  0.360909 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1801  urease subunit beta  69.31 
 
 		 101 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27877 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0689  urease, gamma subunit  69 
 
 		 100 aa  145  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0954  urease subunit gamma  68.69 
 
 		 100 aa  145  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0992  urease subunit gamma  72.73 
 
 		 100 aa  144  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214684  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1185  urease, gamma subunit  73.74 
 
 		 100 aa  145  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7011  urease subunit beta  68.32 
 
 		 101 aa  145  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.63705  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1864  urease subunit gamma  71.72 
 
 		 100 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.846387  normal  0.436059 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2187  urease subunit gamma  71.72 
 
 		 100 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0696523 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0958  urease subunit gamma  72.73 
 
 		 100 aa  144  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215977  normal  0.0675214 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2035  urease subunit gamma  70.71 
 
 		 100 aa  144  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.16208  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3621  urease subunit gamma  70 
 
 		 100 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.706201 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0977  urease subunit gamma  72.73 
 
 		 100 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1429  urease, gamma subunit region  69.7 
 
 		 100 aa  143  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5586  urease subunit gamma  69.7 
 
 		 100 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1240  urease, beta subunit  62.04 
 
 		 113 aa  142  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1352  urease subunit gamma  73.74 
 
 		 100 aa  143  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3526  urease, gamma subunit  70.71 
 
 		 100 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.37751  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64350  urease subunit gamma  69.7 
 
 		 100 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0986  urease subunit beta  70.3 
 
 		 101 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0582515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1079  urease, gamma subunit  70.71 
 
 		 100 aa  143  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3664  urease, gamma subunit  67.68 
 
 		 100 aa  142  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3503  urease subunit beta  68.32 
 
 		 104 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0386  urease, beta subunit  67.33 
 
 		 101 aa  142  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1428  urease, beta subunit  66.34 
 
 		 101 aa  142  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.767872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0390  urease subunit gamma  68 
 
 		 100 aa  142  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3084  urease subunit gamma  69.7 
 
 		 100 aa  142  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0308  urease subunit beta  67.33 
 
 		 101 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.441813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>