More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0888 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0888  bifunctional urease subunit gamma/beta  100 
 
 		 215 aa  434  1e-121  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1135  bifunctional urease subunit gamma/beta  55.81 
 
 		 231 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.380732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1356  bifunctional urease subunit gamma/beta  55.4 
 
 		 231 aa  226  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1196  bifunctional urease subunit gamma/beta  55.4 
 
 		 231 aa  225  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.113473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1961  bifunctional urease subunit gamma/beta  49.12 
 
 		 231 aa  224  8e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6190  bifunctional urease subunit gamma/beta  53.33 
 
 		 231 aa  223  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0272769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0398  urease, gamma subunit  54.85 
 
 		 206 aa  218  7e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2198  bifunctional urease subunit gamma/beta  49.12 
 
 		 231 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2213  urease, gamma subunit  54.37 
 
 		 206 aa  216  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0025871 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4155  urease, gamma subunit  52.43 
 
 		 206 aa  215  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.877974  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2411  urease, beta/gamma subunit  48.68 
 
 		 231 aa  214  9e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3307  urease, gamma subunit  55.02 
 
 		 206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0704884  normal  0.481457 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2863  urease, gamma subunit  52.91 
 
 		 206 aa  209  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.126627 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3208  urease, gamma subunit  53.4 
 
 		 206 aa  208  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3244  urease, gamma subunit  52.43 
 
 		 206 aa  208  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.502966 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3019  urease, gamma subunit  52.43 
 
 		 206 aa  208  6e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0792777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0056  urease, beta subunit  48.33 
 
 		 228 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0976  bifunctional urease subunit gamma/beta  39.68 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.745602  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6167  urease, beta subunit  41.41 
 
 		 247 aa  177  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.018331 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3503  urease, gamma subunit  44.06 
 
 		 208 aa  173  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1260  bifunctional urease subunit gamma/beta  39.68 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1686  bifunctional urease subunit gamma/beta  46.26 
 
 		 234 aa  169  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.641705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4048  bifunctional urease subunit gamma/beta  37.3 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4443  bifunctional urease subunit gamma/beta  42.42 
 
 		 232 aa  166  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.836203 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29702  predicted protein  38.49 
 
 		 878 aa  165  5e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1553  urease subunit gamma  45.37 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30221  urease  38.85 
 
 		 840 aa  152  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10079  urease, urea amidohydrolase alpha subunit (Eurofung)  36.22 
 
 		 836 aa  150  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.28583 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01900  urease  36.14 
 
 		 833 aa  149  3e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2768  bifunctional urease subunit gamma/beta  47.49 
 
 		 190 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2611  urease subunit gamma  48.94 
 
 		 200 aa  145  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.158041 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0834  bifunctional urease subunit gamma/beta  43.75 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3202  urease, gamma subunit  62 
 
 		 100 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000107337  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2454  urease, gamma subunit  63.64 
 
 		 100 aa  128  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1817  urease, beta subunit  53.72 
 
 		 122 aa  126  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3354  urease subunit gamma  59 
 
 		 100 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.664375  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0726  urease, beta subunit  59.18 
 
 		 127 aa  125  7e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5693  urease subunit gamma  58 
 
 		 114 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3084  urease subunit gamma  58 
 
 		 100 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0323  urease subunit gamma  59.6 
 
 		 100 aa  124  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000292656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2773  urease, gamma subunit  60.61 
 
 		 101 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2757  urease, gamma subunit  59.6 
 
 		 100 aa  123  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0528404  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0834  urease subunit gamma  59 
 
 		 122 aa  122  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2258  urease subunit gamma  59 
 
 		 100 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3692  urease subunit gamma  59 
 
 		 100 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2488  urease subunit gamma  59 
 
 		 100 aa  121  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1196  urease, gamma subunit  57.58 
 
 		 100 aa  121  9e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0792  urease subunit gamma  58 
 
 		 100 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0872  urease subunit gamma  58 
 
 		 100 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4008  urease subunit gamma  58 
 
 		 100 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.721691  normal  0.266286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0423  urease subunit gamma  58 
 
 		 100 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0781  urease subunit gamma  58 
 
 		 100 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0241  urease subunit gamma  57.58 
 
 		 100 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0902  urease subunit gamma  58 
 
 		 100 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0930  urease subunit gamma  58 
 
 		 100 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0689  urease, gamma subunit  59.6 
 
 		 100 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1498  urease subunit gamma  58 
 
 		 100 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.791581  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1769  urease subunit gamma  59 
 
 		 100 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0390  urease subunit gamma  56.57 
 
 		 100 aa  119  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6439  urease subunit gamma  54.55 
 
 		 100 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691822  normal  0.288199 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1869  urease subunit gamma  55.56 
 
 		 100 aa  119  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3110  urease subunit gamma  57 
 
 		 100 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2182  urease subunit gamma  57 
 
 		 100 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.901072  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3133  urease subunit gamma  57 
 
 		 100 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0725  urease subunit gamma  57 
 
 		 100 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2055  urease subunit gamma  57 
 
 		 100 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3074  urease subunit gamma  57 
 
 		 100 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4837  urease subunit gamma  55.56 
 
 		 100 aa  119  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164995  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2559  urease subunit gamma  57 
 
 		 100 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3103  urease, beta subunit  59.22 
 
 		 112 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2681  urease, gamma subunit  56.57 
 
 		 100 aa  118  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.399817  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3056  urease subunit gamma  55.56 
 
 		 100 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.23215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1818  urease, gamma subunit  54.55 
 
 		 100 aa  118  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1559  urease, beta subunit  60.64 
 
 		 142 aa  118  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08941  urease subunit beta  53.21 
 
 		 106 aa  117  9e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.349786  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2683  urease, beta subunit  61.17 
 
 		 101 aa  117  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171584  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1211  urease, gamma subunit  53.54 
 
 		 103 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3485  urease subunit gamma  54.55 
 
 		 100 aa  116  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2388  urease subunit gamma  54.55 
 
 		 100 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.989941  normal  0.233519 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2355  urease subunit gamma  54.55 
 
 		 100 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1747  urease, beta subunit  60.19 
 
 		 101 aa  116  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.641327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0880  urease subunit gamma  55.56 
 
 		 100 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3526  urease, gamma subunit  57.58 
 
 		 100 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.37751  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2312  urease subunit gamma  54.55 
 
 		 100 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.79134  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3620  urease subunit beta  55.66 
 
 		 108 aa  116  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2443  urease, gamma subunit  57 
 
 		 100 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.972396  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4411  urease, gamma subunit  57.58 
 
 		 112 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0387  urease subunit gamma  54.55 
 
 		 100 aa  116  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0479  urease subunit gamma  56.57 
 
 		 101 aa  116  3e-25  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.939914  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2270  urease, beta subunit  58.25 
 
 		 113 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3312  urease subunit gamma  54.55 
 
 		 100 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2453  urease, beta subunit  56.04 
 
 		 130 aa  115  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1557  urease, gamma subunit  53.54 
 
 		 125 aa  115  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3664  urease, gamma subunit  55.56 
 
 		 100 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08921  urease subunit beta  53.21 
 
 		 106 aa  114  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1954  urease subunit gamma  54.55 
 
 		 100 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3621  urease subunit gamma  57.58 
 
 		 100 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.706201 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0309  urease subunit gamma  54.55 
 
 		 100 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.510674  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1239  urease, gamma subunit  56.57 
 
 		 100 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0881  urease subunit beta  56.38 
 
 		 111 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.590043  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>