174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0726 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0726  urease, beta subunit  100 
 
 
127 aa  257  5.0000000000000005e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1817  urease, beta subunit  57.58 
 
 
122 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0888  bifunctional urease subunit gamma/beta  59.18 
 
 
215 aa  125  3e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2198  bifunctional urease subunit gamma/beta  57.43 
 
 
231 aa  124  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116358  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1026  urease, beta subunit  55.34 
 
 
103 aa  122  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.447798 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2066  urease, beta subunit  61.29 
 
 
147 aa  121  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000367697  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0324  urease subunit beta  59.41 
 
 
103 aa  120  6e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00761079  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2411  urease, beta/gamma subunit  53.27 
 
 
231 aa  120  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2772  urease subunit beta  52.43 
 
 
111 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1870  urease subunit beta  45.67 
 
 
133 aa  117  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.646669  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1473  urease, beta subunit  48.74 
 
 
126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3310  urease subunit beta  56.57 
 
 
101 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0391  urease, beta subunit  55.56 
 
 
117 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0308  urease subunit beta  54.55 
 
 
101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.441813  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3054  urease subunit beta  55.56 
 
 
101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612969  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1953  urease subunit beta  54.55 
 
 
101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1686  bifunctional urease subunit gamma/beta  48.31 
 
 
234 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.641705  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30221  urease  44.26 
 
 
840 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7011  urease subunit beta  56.84 
 
 
101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.63705  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1054  urease subunit beta  55.1 
 
 
106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3103  urease, beta subunit  55.56 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1747  urease, beta subunit  58.51 
 
 
101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.641327  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19251  urease subunit beta  55.1 
 
 
106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29801  urease subunit beta  54.55 
 
 
105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1961  bifunctional urease subunit gamma/beta  52.48 
 
 
231 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0386  urease, beta subunit  59.57 
 
 
101 aa  114  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4836  urease, beta subunit  44.63 
 
 
122 aa  113  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0921761  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03430  urease, beta subunit  53.54 
 
 
144 aa  113  7.999999999999999e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2714  Urease  58.7 
 
 
217 aa  113  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4048  bifunctional urease subunit gamma/beta  44.44 
 
 
257 aa  113  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3307  urease, gamma subunit  52.13 
 
 
206 aa  112  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0704884  normal  0.481457 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0986  urease subunit beta  53.54 
 
 
101 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0582515  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3695  urease subunit beta  52.53 
 
 
104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5113  urease, beta subunit  47.27 
 
 
136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.755356 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4184  urease subunit beta  53.68 
 
 
101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2012  urease, beta subunit  51.52 
 
 
104 aa  111  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0334  urease subunit beta  50.51 
 
 
101 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1559  urease, beta subunit  50.85 
 
 
142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0183  urease, beta subunit  50.51 
 
 
106 aa  110  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6190  bifunctional urease subunit gamma/beta  53.47 
 
 
231 aa  110  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0272769  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3503  urease subunit beta  54.74 
 
 
104 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1356  bifunctional urease subunit gamma/beta  53.61 
 
 
231 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2626  urease subunit beta  54.55 
 
 
106 aa  110  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.531681 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2313  urease subunit beta  49.49 
 
 
136 aa  110  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2356  urease subunit beta  49.49 
 
 
136 aa  110  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2881  urease  54.74 
 
 
101 aa  110  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2683  urease, beta subunit  54.26 
 
 
101 aa  110  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171584  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1428  urease, beta subunit  52.53 
 
 
101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.767872  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3620  urease subunit beta  52.53 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1801  urease subunit beta  53.68 
 
 
101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.27877 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0976  bifunctional urease subunit gamma/beta  48.15 
 
 
257 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.745602  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2386  urease subunit beta  54.84 
 
 
101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692731  normal  0.33076 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1768  urease, beta subunit  49.49 
 
 
102 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1135  bifunctional urease subunit gamma/beta  53.61 
 
 
231 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.380732  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1470  urease, beta subunit  49 
 
 
136 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1308  urease, beta subunit  49 
 
 
136 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.321935  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29702  predicted protein  43.64 
 
 
878 aa  108  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1313  urease subunit beta  54 
 
 
164 aa  107  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1196  bifunctional urease subunit gamma/beta  53.12 
 
 
231 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.113473 
 
 
-
 
NC_004310  BR0269  urease subunit beta  50.51 
 
 
101 aa  107  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1357  urease subunit beta  54 
 
 
159 aa  107  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.4189  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0283  urease subunit beta  50.51 
 
 
101 aa  107  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.209152  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2368  urease subunit beta  52.13 
 
 
101 aa  107  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.569035 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4007  urease subunit beta  52.53 
 
 
101 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.793578  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2256  urease subunit beta  54.55 
 
 
106 aa  107  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2270  urease, beta subunit  50.51 
 
 
113 aa  106  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64370  urease subunit beta  52.53 
 
 
101 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0786003  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3203  urease, beta subunit  46.6 
 
 
103 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000313456  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2936  urease subunit beta  52.53 
 
 
105 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2806  urease, beta subunit  48.94 
 
 
105 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0478999  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0747  urease subunit beta  50 
 
 
102 aa  106  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2850  urease, beta subunit  48.94 
 
 
105 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1862  urease, beta subunit  52.53 
 
 
101 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.779138  normal  0.418463 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2833  urease, beta subunit  48.94 
 
 
105 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3482  urease subunit beta  53.76 
 
 
101 aa  106  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2185  urease, beta subunit  52.53 
 
 
101 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.108548 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0960  urease subunit beta  51.52 
 
 
101 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.657667  normal  0.124248 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2259  urease, beta subunit  51.52 
 
 
101 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.972861  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2845  urease subunit beta  50.51 
 
 
117 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68752  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1553  urease subunit gamma  49.58 
 
 
234 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2844  urease subunit beta  50.51 
 
 
105 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478498  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2183  urease subunit beta  53.54 
 
 
101 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4435  urease subunit beta  49.49 
 
 
101 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.635744  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3134  urease, beta/gamma subunit  53.54 
 
 
132 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0835  urease subunit beta  50.51 
 
 
106 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1183  urease, beta subunit  51.52 
 
 
105 aa  104  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0688  urease subunit beta  48.48 
 
 
106 aa  105  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0724  urease subunit beta  53.54 
 
 
101 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2558  urease subunit beta  53.54 
 
 
101 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3111  urease subunit beta  53.54 
 
 
101 aa  104  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2056  urease subunit beta  53.54 
 
 
101 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0693  urease subunit beta  49.49 
 
 
101 aa  105  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2442  urease, beta subunit  50.51 
 
 
101 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.549938  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0581  urease subunit beta  50.51 
 
 
101 aa  104  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09890  urease subunit beta  50.51 
 
 
101 aa  104  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.807213  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0881  urease subunit beta  50.49 
 
 
111 aa  104  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.590043  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2994  urease subunit beta  55.56 
 
 
105 aa  104  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3208  urease, gamma subunit  51.06 
 
 
206 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0422  urease subunit beta  52.53 
 
 
101 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0901  urease subunit beta  52.53 
 
 
101 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>