174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1559 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1559  urease, beta subunit  100 
 
 		 142 aa  280  3.0000000000000004e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1817  urease, beta subunit  55.08 
 
 		 122 aa  134  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0056  urease, beta subunit  57.66 
 
 		 228 aa  134  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3203  urease, beta subunit  60.19 
 
 		 103 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000313456  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2411  urease, beta/gamma subunit  54.7 
 
 		 231 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1054  urease subunit beta  58.65 
 
 		 106 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19251  urease subunit beta  58.65 
 
 		 106 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1862  urease, beta subunit  62.38 
 
 		 101 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.779138  normal  0.418463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1961  bifunctional urease subunit gamma/beta  51.28 
 
 		 231 aa  131  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0960  urease subunit beta  63.37 
 
 		 101 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.657667  normal  0.124248 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2259  urease, beta subunit  62.38 
 
 		 101 aa  130  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.972861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0835  urease subunit beta  58.1 
 
 		 106 aa  130  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2270  urease, beta subunit  62.75 
 
 		 113 aa  130  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2185  urease, beta subunit  62.38 
 
 		 101 aa  130  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.108548 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08921  urease subunit beta  58.1 
 
 		 106 aa  130  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08941  urease subunit beta  55.66 
 
 		 106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.349786  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0994  urease subunit beta  59.41 
 
 		 101 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2198  bifunctional urease subunit gamma/beta  53.85 
 
 		 231 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3503  urease subunit beta  58.82 
 
 		 104 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7011  urease subunit beta  59.41 
 
 		 101 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.63705  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3695  urease subunit beta  59.8 
 
 		 104 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2033  urease subunit beta protein  61.39 
 
 		 101 aa  126  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279697  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2772  urease subunit beta  58.82 
 
 		 111 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0507  urease, beta subunit  62 
 
 		 103 aa  126  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1801  urease subunit beta  59.41 
 
 		 101 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27877 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1240  urease, beta subunit  55.88 
 
 		 113 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4155  urease, gamma subunit  61.17 
 
 		 206 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.877974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1428  urease, beta subunit  60.4 
 
 		 101 aa  124  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.767872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1026  urease, beta subunit  61.17 
 
 		 103 aa  124  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447798 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3620  urease subunit beta  57.69 
 
 		 108 aa  124  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6440  urease, beta subunit  60.61 
 
 		 122 aa  123  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290036  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1313  urease subunit beta  61.54 
 
 		 164 aa  123  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1357  urease subunit beta  61.54 
 
 		 159 aa  123  8.000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.4189  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0308  urease subunit beta  60.4 
 
 		 101 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.441813  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1953  urease subunit beta  60.4 
 
 		 101 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1686  bifunctional urease subunit gamma/beta  58.16 
 
 		 234 aa  123  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.641705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1768  urease, beta subunit  55.88 
 
 		 102 aa  123  9e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1322  urease subunit beta  56.86 
 
 		 106 aa  123  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4184  urease subunit beta  58.42 
 
 		 101 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1870  urease subunit beta  45.59 
 
 		 133 aa  122  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.646669  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0386  urease, beta subunit  60.4 
 
 		 101 aa  122  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29801  urease subunit beta  60 
 
 		 105 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01900  urease  46.21 
 
 		 833 aa  122  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0747  urease subunit beta  55.88 
 
 		 102 aa  122  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0929  urease, beta subunit  59.41 
 
 		 101 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2416  urease subunit beta  58.1 
 
 		 105 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.417471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3465  urease subunit beta  56.86 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00430973  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2442  urease, beta subunit  57 
 
 		 101 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.549938  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4894  urease, beta subunit  56.86 
 
 		 102 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3693  urease, beta subunit  59.41 
 
 		 101 aa  121  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.944796  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1473  urease, beta subunit  56.88 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2936  urease subunit beta  58.1 
 
 		 105 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0693  urease subunit beta  56.44 
 
 		 101 aa  121  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2845  urease subunit beta  57.14 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2844  urease subunit beta  57.14 
 
 		 105 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0986  urease subunit beta  59.41 
 
 		 101 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0582515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0833  urease subunit beta  55.88 
 
 		 126 aa  120  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4435  urease subunit beta  56.44 
 
 		 101 aa  120  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.635744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1183  urease, beta subunit  61 
 
 		 105 aa  120  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0955  urease, beta subunit  55.45 
 
 		 105 aa  120  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09890  urease subunit beta  56.44 
 
 		 101 aa  120  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.807213  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2489  urease subunit beta  58.42 
 
 		 101 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.832851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5694  urease, beta subunit  57.84 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0220  urease  56.44 
 
 		 101 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.773173 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0688  urease subunit beta  56 
 
 		 106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4048  bifunctional urease subunit gamma/beta  54.62 
 
 		 257 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0269  urease subunit beta  56.44 
 
 		 101 aa  118  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03430  urease, beta subunit  59 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64370  urease subunit beta  58.42 
 
 		 101 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0786003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0888  bifunctional urease subunit gamma/beta  60.64 
 
 		 215 aa  118  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0283  urease subunit beta  56.44 
 
 		 101 aa  118  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.209152  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0334  urease subunit beta  53.47 
 
 		 101 aa  118  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3938  urease, beta subunit  56.19 
 
 		 117 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3482  urease subunit beta  58.59 
 
 		 101 aa  118  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4007  urease subunit beta  58.42 
 
 		 101 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.793578  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2626  urease subunit beta  55.24 
 
 		 106 aa  117  4.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.531681 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2881  urease  54.46 
 
 		 101 aa  117  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5588  urease subunit beta  56.44 
 
 		 101 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2256  urease subunit beta  55.24 
 
 		 106 aa  116  9e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0581  urease subunit beta  57 
 
 		 101 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1209  urease, beta subunit  55.45 
 
 		 105 aa  116  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3054  urease subunit beta  56.44 
 
 		 101 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1077  urease subunit beta  56.44 
 
 		 101 aa  116  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3310  urease subunit beta  56.44 
 
 		 101 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1194  urease, beta subunit  51.52 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.385528  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1132  urease subunit beta  49.59 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.273178  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2993  urease, beta subunit  53.47 
 
 		 101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3555  urease subunit beta  49.59 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.417484  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5113  urease, beta subunit  61.05 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.755356 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4836  urease, beta subunit  45.76 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0921761  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2453  urease, beta subunit  58.7 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1078  urease subunit beta  49.59 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0871  urease subunit beta  56.44 
 
 		 101 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0478  urease, beta subunit  50.91 
 
 		 124 aa  115  3e-25  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.669506  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0422  urease subunit beta  56.44 
 
 		 101 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0901  urease subunit beta  56.44 
 
 		 101 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2313  urease subunit beta  50.94 
 
 		 136 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2356  urease subunit beta  50.94 
 
 		 136 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2386  urease subunit beta  56.44 
 
 		 101 aa  114  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692731  normal  0.33076 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1747  urease, beta subunit  57.43 
 
 		 101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.641327  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>