174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1473 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1473  urease, beta subunit  100 
 
 		 126 aa  259  6e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4836  urease, beta subunit  59.84 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0921761  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1817  urease, beta subunit  64.65 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2453  urease, beta subunit  52.38 
 
 		 130 aa  135  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2442  urease, beta subunit  60.61 
 
 		 101 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.549938  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1240  urease, beta subunit  61.62 
 
 		 113 aa  130  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2259  urease, beta subunit  63.64 
 
 		 101 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.972861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0747  urease subunit beta  64.29 
 
 		 102 aa  129  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64370  urease subunit beta  62.63 
 
 		 101 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0786003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5588  urease subunit beta  62.63 
 
 		 101 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0994  urease subunit beta  62.63 
 
 		 101 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0929  urease, beta subunit  64.65 
 
 		 101 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2411  urease, beta/gamma subunit  52.54 
 
 		 231 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1428  urease, beta subunit  58.59 
 
 		 101 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.767872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3693  urease, beta subunit  63.64 
 
 		 101 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.944796  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2772  urease subunit beta  59.6 
 
 		 111 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1183  urease, beta subunit  62 
 
 		 105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1862  urease, beta subunit  62.63 
 
 		 101 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.779138  normal  0.418463 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1194  urease, beta subunit  55 
 
 		 112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.385528  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2185  urease, beta subunit  62.63 
 
 		 101 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.108548 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3938  urease, beta subunit  60.61 
 
 		 117 aa  124  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0955  urease, beta subunit  60 
 
 		 105 aa  124  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0334  urease subunit beta  56.57 
 
 		 101 aa  122  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4435  urease subunit beta  58.59 
 
 		 101 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.635744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08921  urease subunit beta  58 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1686  bifunctional urease subunit gamma/beta  55.34 
 
 		 234 aa  122  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.641705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7011  urease subunit beta  58.59 
 
 		 101 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.63705  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2270  urease, beta subunit  58.59 
 
 		 113 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3663  urease subunit beta  55.56 
 
 		 109 aa  121  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.334015  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1559  urease, beta subunit  56.88 
 
 		 142 aa  121  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3620  urease subunit beta  59.6 
 
 		 108 aa  120  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0835  urease subunit beta  56 
 
 		 106 aa  121  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1768  urease, beta subunit  57.58 
 
 		 102 aa  121  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0960  urease subunit beta  59.6 
 
 		 101 aa  121  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.657667  normal  0.124248 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0422  urease subunit beta  61.62 
 
 		 101 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0901  urease subunit beta  61.62 
 
 		 101 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2198  bifunctional urease subunit gamma/beta  51.69 
 
 		 231 aa  120  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0871  urease subunit beta  61.62 
 
 		 101 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1313  urease subunit beta  58.16 
 
 		 164 aa  120  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1357  urease subunit beta  58.16 
 
 		 159 aa  120  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.4189  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4894  urease, beta subunit  58 
 
 		 102 aa  120  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03430  urease, beta subunit  54 
 
 		 144 aa  120  7e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6190  bifunctional urease subunit gamma/beta  59.18 
 
 		 231 aa  120  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0272769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2489  urease subunit beta  59.6 
 
 		 101 aa  120  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.832851  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2033  urease subunit beta protein  61.62 
 
 		 101 aa  120  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279697  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_004310  BR0269  urease subunit beta  56.57 
 
 		 101 aa  120  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3134  urease, beta/gamma subunit  62 
 
 		 132 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0283  urease subunit beta  56.57 
 
 		 101 aa  120  8e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.209152  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0581  urease subunit beta  56.57 
 
 		 101 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1801  urease subunit beta  57.58 
 
 		 101 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27877 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3695  urease subunit beta  57.58 
 
 		 104 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3503  urease subunit beta  56.57 
 
 		 104 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08941  urease subunit beta  55 
 
 		 106 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.349786  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4184  urease subunit beta  58.59 
 
 		 101 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0391  urease, beta subunit  53.4 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1054  urease subunit beta  51 
 
 		 106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2881  urease  58.59 
 
 		 101 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1356  bifunctional urease subunit gamma/beta  59.79 
 
 		 231 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4007  urease subunit beta  60.61 
 
 		 101 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.793578  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09890  urease subunit beta  59.6 
 
 		 101 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.807213  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0780  urease subunit beta  60.61 
 
 		 101 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19251  urease subunit beta  51 
 
 		 106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29801  urease subunit beta  53.54 
 
 		 105 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1961  bifunctional urease subunit gamma/beta  49.15 
 
 		 231 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1322  urease subunit beta  55.05 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0693  urease subunit beta  57.58 
 
 		 101 aa  118  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2845  urease subunit beta  55.77 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0791  urease subunit beta  60.61 
 
 		 101 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2183  urease subunit beta  61.62 
 
 		 101 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1135  bifunctional urease subunit gamma/beta  59.79 
 
 		 231 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.380732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0324  urease subunit beta  58 
 
 		 103 aa  117  3.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00761079  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0726  urease, beta subunit  48.74 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0724  urease subunit beta  61.62 
 
 		 101 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2558  urease subunit beta  61.62 
 
 		 101 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3111  urease subunit beta  61.62 
 
 		 101 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2056  urease subunit beta  61.62 
 
 		 101 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2368  urease subunit beta  57.58 
 
 		 101 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.569035 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1196  bifunctional urease subunit gamma/beta  61.7 
 
 		 231 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.113473 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0688  urease subunit beta  55.56 
 
 		 106 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3103  urease, beta subunit  55.56 
 
 		 112 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3075  urease subunit beta  60.61 
 
 		 101 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2844  urease subunit beta  55.34 
 
 		 105 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2936  urease subunit beta  55.34 
 
 		 105 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1727  urease, beta subunit  56.57 
 
 		 101 aa  116  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2416  urease subunit beta  56.31 
 
 		 105 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.417471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1470  urease, beta subunit  50.83 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4223  urease, beta subunit  58 
 
 		 102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816788  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1308  urease, beta subunit  50.83 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.321935  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1870  urease subunit beta  53 
 
 		 133 aa  114  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.646669  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1747  urease, beta subunit  56.57 
 
 		 101 aa  114  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.641327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0220  urease  55.56 
 
 		 101 aa  115  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.773173 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1132  urease subunit beta  54.08 
 
 		 158 aa  114  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.273178  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3555  urease subunit beta  54.08 
 
 		 158 aa  114  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.417484  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3310  urease subunit beta  56.57 
 
 		 101 aa  114  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1078  urease subunit beta  54.08 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1497  urease subunit beta  59.6 
 
 		 101 aa  114  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0242  urease, beta subunit  53.98 
 
 		 115 aa  114  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2756  urease, beta subunit  56.38 
 
 		 124 aa  113  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.109038  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0183  urease, beta subunit  53.77 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1026  urease, beta subunit  56.57 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447798 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>