174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1132 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3555  urease subunit beta  100 
 
 		 158 aa  323  7e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.417484  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1132  urease subunit beta  100 
 
 		 158 aa  323  7e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.273178  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1078  urease subunit beta  100 
 
 		 144 aa  296  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1357  urease subunit beta  57.14 
 
 		 159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.4189  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1313  urease subunit beta  52.56 
 
 		 164 aa  169  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1470  urease, beta subunit  54.96 
 
 		 136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1308  urease, beta subunit  54.96 
 
 		 136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.321935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5113  urease, beta subunit  53.44 
 
 		 136 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.755356 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1870  urease subunit beta  50.86 
 
 		 133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.646669  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3663  urease subunit beta  58.33 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.334015  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2772  urease subunit beta  60.87 
 
 		 111 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03430  urease, beta subunit  57.29 
 
 		 144 aa  123  8.000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1961  bifunctional urease subunit gamma/beta  50.43 
 
 		 231 aa  120  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4836  urease, beta subunit  54.08 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0921761  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1817  urease, beta subunit  47.58 
 
 		 122 aa  117  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08941  urease subunit beta  55.21 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.349786  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0056  urease, beta subunit  53.26 
 
 		 228 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1559  urease, beta subunit  49.59 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1473  urease, beta subunit  54.08 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2626  urease subunit beta  58.62 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.531681 
 
 
-
 
NC_004310  BR0269  urease subunit beta  52.08 
 
 		 101 aa  114  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0283  urease subunit beta  52.08 
 
 		 101 aa  114  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.209152  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1356  bifunctional urease subunit gamma/beta  54.17 
 
 		 231 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2313  urease subunit beta  51.04 
 
 		 136 aa  114  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2356  urease subunit beta  51.04 
 
 		 136 aa  114  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0334  urease subunit beta  52.08 
 
 		 101 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00888  probable urease (beta subunit) protein  61.18 
 
 		 102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3054  urease subunit beta  54.17 
 
 		 101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6190  bifunctional urease subunit gamma/beta  54.17 
 
 		 231 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0272769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08921  urease subunit beta  54.17 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2213  urease, gamma subunit  60.92 
 
 		 206 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0025871 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1054  urease subunit beta  52.63 
 
 		 106 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19251  urease subunit beta  52.63 
 
 		 106 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29801  urease subunit beta  55.21 
 
 		 105 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1183  urease, beta subunit  58.33 
 
 		 105 aa  111  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1135  bifunctional urease subunit gamma/beta  55.21 
 
 		 231 aa  111  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.380732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2012  urease, beta subunit  52.08 
 
 		 104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0398  urease, gamma subunit  59.77 
 
 		 206 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1686  bifunctional urease subunit gamma/beta  53.06 
 
 		 234 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.641705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4155  urease, gamma subunit  48.67 
 
 		 206 aa  110  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.877974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0747  urease subunit beta  58.14 
 
 		 102 aa  110  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3208  urease, gamma subunit  59.77 
 
 		 206 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3310  urease subunit beta  54.17 
 
 		 101 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2066  urease, beta subunit  52.69 
 
 		 147 aa  110  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000367697  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2256  urease subunit beta  57.47 
 
 		 106 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1196  bifunctional urease subunit gamma/beta  54.84 
 
 		 231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.113473 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0688  urease subunit beta  50 
 
 		 106 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0835  urease subunit beta  53.12 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3307  urease, gamma subunit  46.9 
 
 		 206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0704884  normal  0.481457 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0386  urease, beta subunit  54.17 
 
 		 101 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2453  urease, beta subunit  56.32 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0391  urease, beta subunit  50.45 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3620  urease subunit beta  53.12 
 
 		 108 aa  108  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2259  urease, beta subunit  52.08 
 
 		 101 aa  107  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.972861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0955  urease, beta subunit  52.08 
 
 		 105 aa  107  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2270  urease, beta subunit  53.12 
 
 		 113 aa  107  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6440  urease, beta subunit  51.55 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290036  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3693  urease, beta subunit  52.08 
 
 		 101 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.944796  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29702  predicted protein  48.15 
 
 		 878 aa  106  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2714  Urease  46.61 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2411  urease, beta/gamma subunit  50.57 
 
 		 231 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01900  urease  48 
 
 		 833 aa  105  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1240  urease, beta subunit  55.17 
 
 		 113 aa  106  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1747  urease, beta subunit  52.08 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.641327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3482  urease subunit beta  51.04 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2198  bifunctional urease subunit gamma/beta  43.85 
 
 		 231 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3244  urease, gamma subunit  56.32 
 
 		 206 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.502966 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0929  urease, beta subunit  51.04 
 
 		 101 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3019  urease, gamma subunit  56.32 
 
 		 206 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0792777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3695  urease subunit beta  51.04 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0324  urease subunit beta  53.19 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00761079  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3103  urease, beta subunit  53.12 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2185  urease, beta subunit  51.04 
 
 		 101 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.108548 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2183  urease subunit beta  53.12 
 
 		 101 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0724  urease subunit beta  53.12 
 
 		 101 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2558  urease subunit beta  53.12 
 
 		 101 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3111  urease subunit beta  53.12 
 
 		 101 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2056  urease subunit beta  53.12 
 
 		 101 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0888  bifunctional urease subunit gamma/beta  47.11 
 
 		 215 aa  104  5e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3938  urease, beta subunit  53.12 
 
 		 117 aa  104  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0960  urease subunit beta  51.04 
 
 		 101 aa  104  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.657667  normal  0.124248 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2368  urease subunit beta  50 
 
 		 101 aa  103  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.569035 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0994  urease subunit beta  52.08 
 
 		 101 aa  103  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4184  urease subunit beta  51.04 
 
 		 101 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3134  urease, beta/gamma subunit  53.12 
 
 		 132 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1727  urease, beta subunit  52.08 
 
 		 101 aa  103  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0668  urease subunit beta  54.65 
 
 		 102 aa  103  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.164313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3075  urease subunit beta  52.08 
 
 		 101 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1862  urease, beta subunit  50 
 
 		 101 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.779138  normal  0.418463 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0791  urease subunit beta  56.47 
 
 		 101 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0975  urease subunit beta  55.29 
 
 		 101 aa  102  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0478  urease, beta subunit  48.57 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.669506  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0780  urease subunit beta  56.47 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64370  urease subunit beta  56.32 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0786003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2845  urease subunit beta  46.3 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2863  urease, gamma subunit  56.32 
 
 		 206 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.126627 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0726  urease, beta subunit  48.98 
 
 		 127 aa  102  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0833  urease subunit beta  48.89 
 
 		 126 aa  102  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1801  urease subunit beta  50 
 
 		 101 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27877 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0901  urease subunit beta  55.29 
 
 		 101 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>