174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1870 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1870  urease subunit beta  100 
 
 		 133 aa  269  1e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.646669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2313  urease subunit beta  75.37 
 
 		 136 aa  210  5.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2356  urease subunit beta  75.37 
 
 		 136 aa  210  5.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1470  urease, beta subunit  58.04 
 
 		 136 aa  138  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1308  urease, beta subunit  58.04 
 
 		 136 aa  138  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.321935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1054  urease subunit beta  58.25 
 
 		 106 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19251  urease subunit beta  58.25 
 
 		 106 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5113  urease, beta subunit  56.48 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.755356 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2683  urease, beta subunit  62.38 
 
 		 101 aa  134  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171584  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3054  urease subunit beta  59.41 
 
 		 101 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0334  urease subunit beta  61.39 
 
 		 101 aa  133  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2772  urease subunit beta  57.28 
 
 		 111 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3695  urease subunit beta  58.25 
 
 		 104 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3310  urease subunit beta  58.42 
 
 		 101 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0269  urease subunit beta  61.39 
 
 		 101 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1428  urease, beta subunit  59.41 
 
 		 101 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.767872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29801  urease subunit beta  57.84 
 
 		 105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1817  urease, beta subunit  60.58 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0283  urease subunit beta  61.39 
 
 		 101 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.209152  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0835  urease subunit beta  59.8 
 
 		 106 aa  131  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4184  urease subunit beta  61.39 
 
 		 101 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3503  urease subunit beta  58.25 
 
 		 104 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0688  urease subunit beta  57.14 
 
 		 106 aa  130  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2411  urease, beta/gamma subunit  56.57 
 
 		 231 aa  130  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3620  urease subunit beta  61.54 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1801  urease subunit beta  59.41 
 
 		 101 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27877 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08941  urease subunit beta  57.28 
 
 		 106 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.349786  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1313  urease subunit beta  61.46 
 
 		 164 aa  130  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1357  urease subunit beta  61.46 
 
 		 159 aa  130  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.4189  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2626  urease subunit beta  53.92 
 
 		 106 aa  130  6e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.531681 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7011  urease subunit beta  59.41 
 
 		 101 aa  130  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.63705  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2256  urease subunit beta  56.86 
 
 		 106 aa  129  9e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3663  urease subunit beta  58.42 
 
 		 109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.334015  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0747  urease subunit beta  59.8 
 
 		 102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3482  urease subunit beta  58.42 
 
 		 101 aa  129  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2198  bifunctional urease subunit gamma/beta  55.56 
 
 		 231 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08921  urease subunit beta  58.82 
 
 		 106 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2881  urease  59.41 
 
 		 101 aa  128  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2066  urease, beta subunit  65.56 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000367697  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2270  urease, beta subunit  57.84 
 
 		 113 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0881  urease subunit beta  59.22 
 
 		 111 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.590043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3555  urease subunit beta  50.86 
 
 		 158 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.417484  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1132  urease subunit beta  50.86 
 
 		 158 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.273178  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1078  urease subunit beta  50.86 
 
 		 144 aa  126  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0960  urease subunit beta  57.43 
 
 		 101 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.657667  normal  0.124248 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3244  urease, gamma subunit  61 
 
 		 206 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.502966 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3208  urease, gamma subunit  59 
 
 		 206 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2386  urease subunit beta  58.42 
 
 		 101 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692731  normal  0.33076 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1768  urease, beta subunit  57.43 
 
 		 102 aa  124  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0398  urease, gamma subunit  60 
 
 		 206 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3019  urease, gamma subunit  60 
 
 		 206 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0792777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2845  urease subunit beta  55.88 
 
 		 117 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0791  urease subunit beta  57.43 
 
 		 101 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3103  urease, beta subunit  56.44 
 
 		 112 aa  123  9e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2844  urease subunit beta  55.88 
 
 		 105 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2213  urease, gamma subunit  58 
 
 		 206 aa  123  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0025871 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0308  urease subunit beta  55.45 
 
 		 101 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.441813  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09890  urease subunit beta  56.44 
 
 		 101 aa  123  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.807213  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0780  urease subunit beta  57.43 
 
 		 101 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1953  urease subunit beta  55.45 
 
 		 101 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1559  urease, beta subunit  45.59 
 
 		 142 aa  122  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03430  urease, beta subunit  53.92 
 
 		 144 aa  122  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4836  urease, beta subunit  54.81 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0921761  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1747  urease, beta subunit  56.44 
 
 		 101 aa  122  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.641327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2936  urease subunit beta  55.88 
 
 		 105 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2259  urease, beta subunit  55.45 
 
 		 101 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.972861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2416  urease subunit beta  56.86 
 
 		 105 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.417471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0986  urease subunit beta  55.45 
 
 		 101 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0582515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0324  urease subunit beta  57.28 
 
 		 103 aa  120  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00761079  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2453  urease, beta subunit  57.69 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2185  urease, beta subunit  53.47 
 
 		 101 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.108548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1356  bifunctional urease subunit gamma/beta  55.56 
 
 		 231 aa  120  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2306  urease subunit beta  53.85 
 
 		 108 aa  120  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1026  urease, beta subunit  54.37 
 
 		 103 aa  120  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447798 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0391  urease, beta subunit  51.96 
 
 		 117 aa  120  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2993  urease, beta subunit  50.5 
 
 		 101 aa  120  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3938  urease, beta subunit  55.34 
 
 		 117 aa  120  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0929  urease, beta subunit  54.46 
 
 		 101 aa  120  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2012  urease, beta subunit  52.88 
 
 		 104 aa  120  7e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1240  urease, beta subunit  55.45 
 
 		 113 aa  120  8e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0693  urease subunit beta  53.47 
 
 		 101 aa  120  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4435  urease subunit beta  54.46 
 
 		 101 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.635744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0581  urease subunit beta  53.47 
 
 		 101 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1135  bifunctional urease subunit gamma/beta  53.47 
 
 		 231 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.380732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6440  urease, beta subunit  57.45 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290036  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5588  urease subunit beta  55.45 
 
 		 101 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2442  urease, beta subunit  53.47 
 
 		 101 aa  119  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.549938  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4894  urease, beta subunit  53.92 
 
 		 102 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2714  Urease  50.98 
 
 		 217 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1351  urease subunit beta  51.96 
 
 		 112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.568363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1183  urease, beta subunit  56.44 
 
 		 105 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1862  urease, beta subunit  52.48 
 
 		 101 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.779138  normal  0.418463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1961  bifunctional urease subunit gamma/beta  55.67 
 
 		 231 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0975  urease subunit beta  53.47 
 
 		 101 aa  118  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0056  urease, beta subunit  50.96 
 
 		 228 aa  118  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2033  urease subunit beta protein  52.48 
 
 		 101 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279697  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64370  urease subunit beta  55.45 
 
 		 101 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0786003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0726  urease, beta subunit  45.67 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2994  urease subunit beta  52.43 
 
 		 105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0955  urease, beta subunit  56.44 
 
 		 105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>