More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2411 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2411  urease, beta/gamma subunit  100 
 
 		 231 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2198  bifunctional urease subunit gamma/beta  94.81 
 
 		 231 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1961  bifunctional urease subunit gamma/beta  63.64 
 
 		 231 aa  299  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6190  bifunctional urease subunit gamma/beta  66.23 
 
 		 231 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0272769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1135  bifunctional urease subunit gamma/beta  64.5 
 
 		 231 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.380732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1356  bifunctional urease subunit gamma/beta  64.07 
 
 		 231 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1196  bifunctional urease subunit gamma/beta  64.07 
 
 		 231 aa  280  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.113473 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0056  urease, beta subunit  50.9 
 
 		 228 aa  222  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4155  urease, gamma subunit  53.33 
 
 		 206 aa  220  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.877974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2213  urease, gamma subunit  52.86 
 
 		 206 aa  217  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0025871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0398  urease, gamma subunit  53.81 
 
 		 206 aa  217  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3208  urease, gamma subunit  53.99 
 
 		 206 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0888  bifunctional urease subunit gamma/beta  48.68 
 
 		 215 aa  214  9.999999999999999e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3307  urease, gamma subunit  50.95 
 
 		 206 aa  209  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0704884  normal  0.481457 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2863  urease, gamma subunit  51.64 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.126627 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3244  urease, gamma subunit  51.17 
 
 		 206 aa  202  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.502966 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1260  bifunctional urease subunit gamma/beta  45.71 
 
 		 248 aa  202  4e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3019  urease, gamma subunit  51.17 
 
 		 206 aa  201  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0792777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0976  bifunctional urease subunit gamma/beta  46.72 
 
 		 257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.745602  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1686  bifunctional urease subunit gamma/beta  55.5 
 
 		 234 aa  197  7.999999999999999e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.641705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4048  bifunctional urease subunit gamma/beta  46.03 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4443  bifunctional urease subunit gamma/beta  42.86 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.836203 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29702  predicted protein  39.84 
 
 		 878 aa  181  6e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6167  urease, beta subunit  43.4 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.018331 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3503  urease, gamma subunit  46.38 
 
 		 208 aa  172  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01900  urease  42.13 
 
 		 833 aa  167  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10079  urease, urea amidohydrolase alpha subunit (Eurofung)  40.66 
 
 		 836 aa  161  7e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.28583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1553  urease subunit gamma  48.94 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30221  urease  36.93 
 
 		 840 aa  156  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2768  bifunctional urease subunit gamma/beta  50.79 
 
 		 190 aa  156  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0834  bifunctional urease subunit gamma/beta  45.69 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2611  urease subunit gamma  51.83 
 
 		 200 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.158041 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2773  urease, gamma subunit  65 
 
 		 101 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4224  urease, gamma subunit  63 
 
 		 100 aa  135  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0781796  normal  0.360909 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1559  urease, beta subunit  54.7 
 
 		 142 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1817  urease, beta subunit  54.17 
 
 		 122 aa  131  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1870  urease subunit beta  56.57 
 
 		 133 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.646669  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3202  urease, gamma subunit  63.64 
 
 		 100 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000107337  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2454  urease, gamma subunit  60 
 
 		 100 aa  130  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03420  urease, gamma subunit  61 
 
 		 100 aa  130  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2313  urease subunit beta  52.83 
 
 		 136 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2356  urease subunit beta  52.83 
 
 		 136 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0992  urease subunit gamma  61.62 
 
 		 100 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214684  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0689  urease, gamma subunit  59 
 
 		 100 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1769  urease subunit gamma  58.59 
 
 		 100 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4411  urease, gamma subunit  56.6 
 
 		 112 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1869  urease subunit gamma  57.58 
 
 		 100 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2035  urease subunit gamma  59.6 
 
 		 100 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.16208  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3937  urease subunit gamma  60.61 
 
 		 100 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2307  urease, gamma subunit  61.62 
 
 		 100 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1473  urease, beta subunit  52.54 
 
 		 126 aa  126  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3399  urease subunit gamma  59.6 
 
 		 100 aa  126  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279985  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0746  urease, gamma subunit  56.57 
 
 		 108 aa  126  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0958  urease subunit gamma  60.61 
 
 		 100 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215977  normal  0.0675214 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1864  urease subunit gamma  57.58 
 
 		 100 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.846387  normal  0.436059 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2187  urease subunit gamma  57.58 
 
 		 100 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0696523 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0688  urease subunit beta  56.57 
 
 		 106 aa  125  7e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1818  urease, gamma subunit  58 
 
 		 100 aa  124  9e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4837  urease subunit gamma  57 
 
 		 100 aa  124  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164995  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3621  urease subunit gamma  57 
 
 		 100 aa  124  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.706201 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0835  urease subunit beta  56.57 
 
 		 106 aa  124  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0880  urease subunit gamma  60.61 
 
 		 100 aa  124  9e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3664  urease, gamma subunit  56.57 
 
 		 100 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2271  urease subunit gamma  56 
 
 		 100 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0241  urease subunit gamma  56 
 
 		 100 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0390  urease subunit gamma  56 
 
 		 100 aa  123  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0977  urease subunit gamma  57.58 
 
 		 100 aa  123  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1352  urease subunit gamma  57.58 
 
 		 100 aa  123  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0182  urease subunit gamma  60 
 
 		 100 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4240  urease subunit gamma  57.58 
 
 		 100 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5693  urease subunit gamma  60.61 
 
 		 114 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2714  Urease  50 
 
 		 217 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08921  urease subunit beta  57.58 
 
 		 106 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19251  urease subunit beta  57 
 
 		 106 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1054  urease subunit beta  57 
 
 		 106 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3620  urease subunit beta  56 
 
 		 108 aa  122  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0669  urease  60.61 
 
 		 100 aa  122  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2258  urease subunit gamma  56.57 
 
 		 100 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08941  urease subunit beta  55 
 
 		 106 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.349786  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1729  urease, gamma subunit  57.58 
 
 		 100 aa  122  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1079  urease, gamma subunit  57.58 
 
 		 100 aa  122  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3354  urease subunit gamma  62.63 
 
 		 100 aa  121  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.664375  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0747  urease subunit beta  56 
 
 		 102 aa  121  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1429  urease, gamma subunit region  59.6 
 
 		 100 aa  121  9e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2453  urease, beta subunit  52.1 
 
 		 130 aa  121  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0269  urease subunit beta  57.58 
 
 		 101 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1428  urease, beta subunit  57.58 
 
 		 101 aa  121  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.767872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2757  urease, gamma subunit  60.61 
 
 		 100 aa  120  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0528404  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2488  urease subunit gamma  55.56 
 
 		 100 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0283  urease subunit beta  57.58 
 
 		 101 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.209152  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4008  urease subunit gamma  55.56 
 
 		 100 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.721691  normal  0.266286 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0792  urease subunit gamma  55.56 
 
 		 100 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1801  urease subunit beta  58.59 
 
 		 101 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27877 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3692  urease subunit gamma  55.56 
 
 		 100 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2312  urease subunit gamma  54.55 
 
 		 100 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.79134  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2355  urease subunit gamma  54.55 
 
 		 100 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0423  urease subunit gamma  55.56 
 
 		 100 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0781  urease subunit gamma  55.56 
 
 		 100 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3084  urease subunit gamma  62.63 
 
 		 100 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0902  urease subunit gamma  55.56 
 
 		 100 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>