174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2066 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2066  urease, beta subunit  100 
 
 		 147 aa  296  5e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000367697  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2714  Urease  62.71 
 
 		 217 aa  158  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5113  urease, beta subunit  55.28 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.755356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1470  urease, beta subunit  55.28 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1308  urease, beta subunit  55.28 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.321935  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1870  urease subunit beta  65.56 
 
 		 133 aa  128  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.646669  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1135  bifunctional urease subunit gamma/beta  64.29 
 
 		 231 aa  128  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.380732  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2411  urease, beta/gamma subunit  53.51 
 
 		 231 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1356  bifunctional urease subunit gamma/beta  65.62 
 
 		 231 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1961  bifunctional urease subunit gamma/beta  55.96 
 
 		 231 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1686  bifunctional urease subunit gamma/beta  53.39 
 
 		 234 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.641705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1313  urease subunit beta  60.64 
 
 		 164 aa  126  8.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1357  urease subunit beta  60.64 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.4189  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0726  urease, beta subunit  53.1 
 
 		 127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2198  bifunctional urease subunit gamma/beta  52.63 
 
 		 231 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6190  bifunctional urease subunit gamma/beta  61.46 
 
 		 231 aa  123  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0272769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1559  urease, beta subunit  53.39 
 
 		 142 aa  123  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1054  urease subunit beta  58.06 
 
 		 106 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1196  bifunctional urease subunit gamma/beta  65.93 
 
 		 231 aa  123  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.113473 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19251  urease subunit beta  58.06 
 
 		 106 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2313  urease subunit beta  61.11 
 
 		 136 aa  122  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2356  urease subunit beta  61.11 
 
 		 136 aa  122  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2256  urease subunit beta  62.64 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2626  urease subunit beta  58.33 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.531681 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0888  bifunctional urease subunit gamma/beta  53.51 
 
 		 215 aa  121  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0835  urease subunit beta  60.64 
 
 		 106 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3482  urease subunit beta  64.37 
 
 		 101 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29801  urease subunit beta  59.34 
 
 		 105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1473  urease, beta subunit  48.74 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.515544 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3054  urease subunit beta  61.05 
 
 		 101 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08921  urease subunit beta  59.57 
 
 		 106 aa  117  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3310  urease subunit beta  63.74 
 
 		 101 aa  117  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2270  urease, beta subunit  61.96 
 
 		 113 aa  116  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08941  urease subunit beta  58.51 
 
 		 106 aa  116  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.349786  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3620  urease subunit beta  60.64 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1026  urease, beta subunit  62.64 
 
 		 103 aa  116  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447798 
 
 
-
 
NC_004310  BR0269  urease subunit beta  61.96 
 
 		 101 aa  115  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0283  urease subunit beta  61.96 
 
 		 101 aa  115  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.209152  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4836  urease, beta subunit  46.49 
 
 		 122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0921761  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2881  urease  61.54 
 
 		 101 aa  114  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0398  urease, gamma subunit  61.54 
 
 		 206 aa  114  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0960  urease subunit beta  61.96 
 
 		 101 aa  114  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.657667  normal  0.124248 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1428  urease, beta subunit  59.34 
 
 		 101 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.767872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1132  urease subunit beta  45.83 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.273178  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3555  urease subunit beta  45.83 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.417484  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3503  urease subunit beta  59.38 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1260  bifunctional urease subunit gamma/beta  52.21 
 
 		 248 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0324  urease subunit beta  61.36 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00761079  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2453  urease, beta subunit  48.6 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1817  urease, beta subunit  50.88 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2213  urease, gamma subunit  59.34 
 
 		 206 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0025871 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2386  urease subunit beta  63.64 
 
 		 101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692731  normal  0.33076 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1078  urease subunit beta  45.83 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1747  urease, beta subunit  61.96 
 
 		 101 aa  111  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.641327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0976  bifunctional urease subunit gamma/beta  51.75 
 
 		 257 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.745602  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2683  urease, beta subunit  63.86 
 
 		 101 aa  111  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171584  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0747  urease subunit beta  57.95 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7011  urease subunit beta  61.96 
 
 		 101 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.63705  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0581  urease subunit beta  55.21 
 
 		 101 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4184  urease subunit beta  61.96 
 
 		 101 aa  110  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3103  urease, beta subunit  55.1 
 
 		 112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64370  urease subunit beta  60.44 
 
 		 101 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0786003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0334  urease subunit beta  57.61 
 
 		 101 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10079  urease, urea amidohydrolase alpha subunit (Eurofung)  49.57 
 
 		 836 aa  110  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.28583 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0308  urease subunit beta  59.78 
 
 		 101 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.441813  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1801  urease subunit beta  60 
 
 		 101 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27877 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1953  urease subunit beta  59.78 
 
 		 101 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0881  urease subunit beta  56.25 
 
 		 111 aa  110  6e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.590043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0693  urease subunit beta  55.21 
 
 		 101 aa  110  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2845  urease subunit beta  57.45 
 
 		 117 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09890  urease subunit beta  57.29 
 
 		 101 aa  110  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.807213  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0986  urease subunit beta  60.87 
 
 		 101 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0582515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00888  probable urease (beta subunit) protein  56.18 
 
 		 102 aa  110  9e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2844  urease subunit beta  57.45 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2185  urease, beta subunit  58.7 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.108548 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4435  urease subunit beta  55.21 
 
 		 101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.635744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2416  urease subunit beta  57.45 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.417471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2936  urease subunit beta  58.51 
 
 		 105 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2994  urease subunit beta  54 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0688  urease subunit beta  50.51 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0791  urease subunit beta  60 
 
 		 101 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3244  urease, gamma subunit  58.24 
 
 		 206 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.502966 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0780  urease subunit beta  60 
 
 		 101 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1194  urease, beta subunit  56.04 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.385528  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2012  urease, beta subunit  53.68 
 
 		 104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2993  urease, beta subunit  54.95 
 
 		 101 aa  107  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3019  urease, gamma subunit  58.24 
 
 		 206 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0792777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2368  urease subunit beta  58.62 
 
 		 101 aa  107  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.569035 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4894  urease, beta subunit  55.21 
 
 		 102 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1862  urease, beta subunit  57.61 
 
 		 101 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.779138  normal  0.418463 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5588  urease subunit beta  58.24 
 
 		 101 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03430  urease, beta subunit  54.17 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1768  urease, beta subunit  55.43 
 
 		 102 aa  105  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0056  urease, beta subunit  48.04 
 
 		 228 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3203  urease, beta subunit  59.26 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000313456  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4443  bifunctional urease subunit gamma/beta  48.41 
 
 		 232 aa  105  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.836203 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2033  urease subunit beta protein  56.52 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279697  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01900  urease  50.94 
 
 		 833 aa  105  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3208  urease, gamma subunit  56.04 
 
 		 206 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4048  bifunctional urease subunit gamma/beta  48.25 
 
 		 257 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>