174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2313 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2313  urease subunit beta  100 
 
 
136 aa  278  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2356  urease subunit beta  100 
 
 
136 aa  278  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1870  urease subunit beta  75.37 
 
 
133 aa  210  5.999999999999999e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.646669  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2626  urease subunit beta  57.84 
 
 
106 aa  139  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.531681 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2256  urease subunit beta  59.8 
 
 
106 aa  136  1e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29801  urease subunit beta  57.84 
 
 
105 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0334  urease subunit beta  62.38 
 
 
101 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2683  urease, beta subunit  61.62 
 
 
101 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171584  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0747  urease subunit beta  60.78 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3482  urease subunit beta  59.41 
 
 
101 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2772  urease subunit beta  55.77 
 
 
111 aa  131  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1428  urease, beta subunit  59.41 
 
 
101 aa  131  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.767872  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1308  urease, beta subunit  57.41 
 
 
136 aa  131  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.321935  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2270  urease, beta subunit  59.8 
 
 
113 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1470  urease, beta subunit  57.41 
 
 
136 aa  131  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3054  urease subunit beta  57.43 
 
 
101 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612969  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1054  urease subunit beta  54.37 
 
 
106 aa  130  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3620  urease subunit beta  61.76 
 
 
108 aa  130  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19251  urease subunit beta  54.37 
 
 
106 aa  130  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0269  urease subunit beta  60.4 
 
 
101 aa  130  7.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2411  urease, beta/gamma subunit  52.83 
 
 
231 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0283  urease subunit beta  60.4 
 
 
101 aa  130  7.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.209152  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3310  urease subunit beta  56.44 
 
 
101 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0881  urease subunit beta  59.62 
 
 
111 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.590043  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5113  urease, beta subunit  54.63 
 
 
136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.755356 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08941  urease subunit beta  53.4 
 
 
106 aa  127  6e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.349786  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3695  urease subunit beta  55.77 
 
 
104 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1768  urease, beta subunit  57.43 
 
 
102 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2386  urease subunit beta  58.42 
 
 
101 aa  126  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692731  normal  0.33076 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0688  urease subunit beta  56.19 
 
 
106 aa  125  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0835  urease subunit beta  53.92 
 
 
106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3503  urease subunit beta  55.77 
 
 
104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0391  urease, beta subunit  56.86 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2198  bifunctional urease subunit gamma/beta  55.67 
 
 
231 aa  124  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116358  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4184  urease subunit beta  58.42 
 
 
101 aa  124  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3103  urease, beta subunit  56.44 
 
 
112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08921  urease subunit beta  53.92 
 
 
106 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1801  urease subunit beta  56.44 
 
 
101 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.27877 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0960  urease subunit beta  56.44 
 
 
101 aa  123  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.657667  normal  0.124248 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0791  urease subunit beta  57.43 
 
 
101 aa  123  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7011  urease subunit beta  56.44 
 
 
101 aa  123  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.63705  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1351  urease subunit beta  53.85 
 
 
112 aa  123  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.568363  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0780  urease subunit beta  57.43 
 
 
101 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3244  urease, gamma subunit  58 
 
 
206 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.502966 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2881  urease  55.45 
 
 
101 aa  122  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2259  urease, beta subunit  56.44 
 
 
101 aa  122  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.972861  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2993  urease, beta subunit  53.47 
 
 
101 aa  122  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2066  urease, beta subunit  61.11 
 
 
147 aa  122  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000367697  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3019  urease, gamma subunit  57 
 
 
206 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0792777  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1817  urease, beta subunit  50.43 
 
 
122 aa  122  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0986  urease subunit beta  55.45 
 
 
101 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0582515  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1747  urease, beta subunit  56.44 
 
 
101 aa  121  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.641327  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2012  urease, beta subunit  54.37 
 
 
104 aa  121  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2845  urease subunit beta  54.9 
 
 
117 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68752  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2844  urease subunit beta  54.9 
 
 
105 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478498  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1357  urease subunit beta  58.33 
 
 
159 aa  120  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.4189  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1313  urease subunit beta  63.22 
 
 
164 aa  120  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2416  urease subunit beta  55.88 
 
 
105 aa  120  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.417471  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0955  urease, beta subunit  56.44 
 
 
105 aa  120  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3663  urease subunit beta  52.48 
 
 
109 aa  120  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.334015  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3208  urease, gamma subunit  56 
 
 
206 aa  120  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0308  urease subunit beta  53.47 
 
 
101 aa  120  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.441813  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0324  urease subunit beta  57.28 
 
 
103 aa  120  9e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00761079  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1953  urease subunit beta  53.47 
 
 
101 aa  120  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5694  urease, beta subunit  54.29 
 
 
120 aa  120  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0833  urease subunit beta  52.25 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0975  urease subunit beta  53.47 
 
 
101 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0398  urease, gamma subunit  58.16 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3307  urease, gamma subunit  54.46 
 
 
206 aa  118  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0704884  normal  0.481457 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3465  urease subunit beta  58.82 
 
 
106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00430973  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2489  urease subunit beta  56.44 
 
 
101 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.832851  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1240  urease, beta subunit  54.46 
 
 
113 aa  118  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4155  urease, gamma subunit  55 
 
 
206 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.877974  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09890  urease subunit beta  54.46 
 
 
101 aa  118  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.807213  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2213  urease, gamma subunit  55 
 
 
206 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0025871 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0871  urease subunit beta  54.46 
 
 
101 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2453  urease, beta subunit  56.73 
 
 
130 aa  117  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2936  urease subunit beta  52.94 
 
 
105 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2185  urease, beta subunit  52.48 
 
 
101 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.108548 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0183  urease, beta subunit  57 
 
 
106 aa  117  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0422  urease subunit beta  54.46 
 
 
101 aa  116  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0901  urease subunit beta  54.46 
 
 
101 aa  116  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1077  urease subunit beta  49.5 
 
 
101 aa  115  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6440  urease, beta subunit  52.88 
 
 
122 aa  115  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290036  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1026  urease, beta subunit  51.46 
 
 
103 aa  116  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.447798 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00888  probable urease (beta subunit) protein  53.92 
 
 
102 aa  116  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2442  urease, beta subunit  53.47 
 
 
101 aa  116  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.549938  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0994  urease subunit beta  53.47 
 
 
101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0581  urease subunit beta  52.48 
 
 
101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2306  urease subunit beta  50.49 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3203  urease, beta subunit  52.43 
 
 
103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000313456  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1497  urease subunit beta  54.46 
 
 
101 aa  115  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0478  urease, beta subunit  48.18 
 
 
124 aa  115  3e-25  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.669506  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1559  urease, beta subunit  50.94 
 
 
142 aa  115  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0929  urease, beta subunit  53.47 
 
 
101 aa  114  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03430  urease, beta subunit  52.94 
 
 
144 aa  115  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1356  bifunctional urease subunit gamma/beta  51.52 
 
 
231 aa  114  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01900  urease  51.46 
 
 
833 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4435  urease subunit beta  52.48 
 
 
101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.635744  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4007  urease subunit beta  53.47 
 
 
101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.793578  normal  0.443182 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>