174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0975 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0975  urease subunit beta  100 
 
 		 101 aa  206  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1351  urease subunit beta  88.12 
 
 		 112 aa  189  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.568363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4242  urease, beta subunit  85.15 
 
 		 101 aa  177  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1077  urease subunit beta  78.22 
 
 		 101 aa  171  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3400  urease subunit beta  80.2 
 
 		 101 aa  170  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.180648  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0668  urease subunit beta  78.43 
 
 		 102 aa  166  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.164313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3528  urease, beta subunit  79.21 
 
 		 116 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.603861  normal  0.242695 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1727  urease, beta subunit  75 
 
 		 101 aa  154  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1428  urease, beta subunit  73.27 
 
 		 101 aa  152  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.767872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0929  urease, beta subunit  70.3 
 
 		 101 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4007  urease subunit beta  70.3 
 
 		 101 aa  149  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.793578  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2489  urease subunit beta  70.3 
 
 		 101 aa  149  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.832851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0791  urease subunit beta  70.3 
 
 		 101 aa  148  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2259  urease, beta subunit  71.29 
 
 		 101 aa  149  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.972861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3693  urease, beta subunit  69.31 
 
 		 101 aa  148  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.944796  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0422  urease subunit beta  70.3 
 
 		 101 aa  147  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0901  urease subunit beta  70.3 
 
 		 101 aa  147  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1497  urease subunit beta  70.3 
 
 		 101 aa  147  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0780  urease subunit beta  69.31 
 
 		 101 aa  147  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0871  urease subunit beta  69.31 
 
 		 101 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2183  urease subunit beta  68.32 
 
 		 101 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3134  urease, beta/gamma subunit  68.32 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0724  urease subunit beta  68.32 
 
 		 101 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2558  urease subunit beta  68.32 
 
 		 101 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3111  urease subunit beta  68.32 
 
 		 101 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2056  urease subunit beta  68.32 
 
 		 101 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3075  urease subunit beta  67.33 
 
 		 101 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2881  urease  69.31 
 
 		 101 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3938  urease, beta subunit  72.28 
 
 		 117 aa  143  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4184  urease subunit beta  69.31 
 
 		 101 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1801  urease subunit beta  69.31 
 
 		 101 aa  139  9e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27877 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1768  urease, beta subunit  66.34 
 
 		 102 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2368  urease subunit beta  68.32 
 
 		 101 aa  139  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.569035 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2185  urease, beta subunit  67.33 
 
 		 101 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.108548 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1862  urease, beta subunit  67.33 
 
 		 101 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.779138  normal  0.418463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7011  urease subunit beta  68.32 
 
 		 101 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.63705  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0994  urease subunit beta  67.33 
 
 		 101 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5588  urease subunit beta  68.32 
 
 		 101 aa  137  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0308  urease subunit beta  66.34 
 
 		 101 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.441813  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1953  urease subunit beta  66.34 
 
 		 101 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0960  urease subunit beta  67.33 
 
 		 101 aa  135  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.657667  normal  0.124248 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0986  urease subunit beta  66.34 
 
 		 101 aa  135  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0582515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3503  urease subunit beta  66.34 
 
 		 104 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2033  urease subunit beta protein  65.35 
 
 		 101 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279697  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4435  urease subunit beta  66.34 
 
 		 101 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.635744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0581  urease subunit beta  66.34 
 
 		 101 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3054  urease subunit beta  64.36 
 
 		 101 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0334  urease subunit beta  63.37 
 
 		 101 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0269  urease subunit beta  66.34 
 
 		 101 aa  134  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0283  urease subunit beta  66.34 
 
 		 101 aa  134  6.0000000000000005e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.209152  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4894  urease, beta subunit  66.34 
 
 		 102 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3695  urease subunit beta  65.35 
 
 		 104 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3310  urease subunit beta  63.37 
 
 		 101 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2270  urease, beta subunit  64.36 
 
 		 113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0386  urease, beta subunit  63.37 
 
 		 101 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64370  urease subunit beta  66.34 
 
 		 101 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0786003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1194  urease, beta subunit  59.41 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.385528  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09890  urease subunit beta  66.34 
 
 		 101 aa  131  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.807213  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1183  urease, beta subunit  63.37 
 
 		 105 aa  131  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0955  urease, beta subunit  62.38 
 
 		 105 aa  131  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4155  urease, gamma subunit  63 
 
 		 206 aa  130  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.877974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0693  urease subunit beta  66.67 
 
 		 101 aa  130  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0220  urease  63.37 
 
 		 101 aa  130  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.773173 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2012  urease, beta subunit  64.36 
 
 		 104 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3482  urease subunit beta  61.39 
 
 		 101 aa  129  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0747  urease subunit beta  58.42 
 
 		 102 aa  128  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1209  urease, beta subunit  60.4 
 
 		 105 aa  129  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2993  urease, beta subunit  60.4 
 
 		 101 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2416  urease subunit beta  61.39 
 
 		 105 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.417471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1240  urease, beta subunit  60.4 
 
 		 113 aa  128  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2683  urease, beta subunit  63.37 
 
 		 101 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171584  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2442  urease, beta subunit  62.38 
 
 		 101 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.549938  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1054  urease subunit beta  60.4 
 
 		 106 aa  127  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19251  urease subunit beta  60.4 
 
 		 106 aa  127  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1026  urease, beta subunit  63.37 
 
 		 103 aa  127  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1322  urease subunit beta  63.73 
 
 		 106 aa  127  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2386  urease subunit beta  60.4 
 
 		 101 aa  127  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692731  normal  0.33076 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1747  urease, beta subunit  62.38 
 
 		 101 aa  126  8.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.641327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2626  urease subunit beta  60.4 
 
 		 106 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.531681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2844  urease subunit beta  60.4 
 
 		 105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3103  urease, beta subunit  62.38 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29801  urease subunit beta  61.39 
 
 		 105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2936  urease subunit beta  60.4 
 
 		 105 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2256  urease subunit beta  59.41 
 
 		 106 aa  125  3e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2845  urease subunit beta  60.4 
 
 		 117 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00888  probable urease (beta subunit) protein  57.43 
 
 		 102 aa  124  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1817  urease, beta subunit  59.41 
 
 		 122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2994  urease subunit beta  59.41 
 
 		 105 aa  123  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0183  urease, beta subunit  60.61 
 
 		 106 aa  122  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3307  urease, gamma subunit  59.41 
 
 		 206 aa  122  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0704884  normal  0.481457 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2306  urease subunit beta  58.42 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0688  urease subunit beta  55.45 
 
 		 106 aa  121  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0881  urease subunit beta  60.4 
 
 		 111 aa  120  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.590043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3465  urease subunit beta  58.42 
 
 		 106 aa  120  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00430973  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2313  urease subunit beta  53.47 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2356  urease subunit beta  53.47 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3620  urease subunit beta  57.43 
 
 		 108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2453  urease, beta subunit  59.22 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1870  urease subunit beta  53.47 
 
 		 133 aa  118  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.646669  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5694  urease, beta subunit  59.41 
 
 		 120 aa  116  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>