174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0833 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0833  urease subunit beta  100 
 
 		 126 aa  249  7e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5694  urease, beta subunit  76.85 
 
 		 120 aa  166  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3203  urease, beta subunit  74.51 
 
 		 103 aa  153  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000313456  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0507  urease, beta subunit  75.49 
 
 		 103 aa  151  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2626  urease subunit beta  63.11 
 
 		 106 aa  132  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.531681 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0791  urease subunit beta  66.34 
 
 		 101 aa  130  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0780  urease subunit beta  66.34 
 
 		 101 aa  130  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3503  urease subunit beta  61.54 
 
 		 104 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6440  urease, beta subunit  67.39 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290036  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3695  urease subunit beta  60.58 
 
 		 104 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2259  urease, beta subunit  62.38 
 
 		 101 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.972861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1322  urease subunit beta  58.25 
 
 		 106 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1497  urease subunit beta  62.38 
 
 		 101 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0422  urease subunit beta  62.38 
 
 		 101 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0901  urease subunit beta  62.38 
 
 		 101 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2489  urease subunit beta  63.37 
 
 		 101 aa  124  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.832851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3693  urease, beta subunit  61.39 
 
 		 101 aa  124  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.944796  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1209  urease, beta subunit  60.4 
 
 		 105 aa  123  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7011  urease subunit beta  58.42 
 
 		 101 aa  123  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.63705  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4184  urease subunit beta  57.43 
 
 		 101 aa  123  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1801  urease subunit beta  60.4 
 
 		 101 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27877 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0881  urease subunit beta  56.19 
 
 		 111 aa  123  9e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.590043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0871  urease subunit beta  62.38 
 
 		 101 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2386  urease subunit beta  60.4 
 
 		 101 aa  123  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692731  normal  0.33076 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0929  urease, beta subunit  60.4 
 
 		 101 aa  122  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4007  urease subunit beta  62.38 
 
 		 101 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.793578  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3054  urease subunit beta  59.41 
 
 		 101 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612969  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2033  urease subunit beta protein  61.39 
 
 		 101 aa  121  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279697  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3938  urease, beta subunit  59.8 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3482  urease subunit beta  58.42 
 
 		 101 aa  121  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1727  urease, beta subunit  60.61 
 
 		 101 aa  121  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3310  urease subunit beta  59.41 
 
 		 101 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2185  urease, beta subunit  62.38 
 
 		 101 aa  121  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.108548 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2994  urease subunit beta  56.19 
 
 		 105 aa  121  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1862  urease, beta subunit  61.39 
 
 		 101 aa  120  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.779138  normal  0.418463 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1559  urease, beta subunit  55.88 
 
 		 142 aa  120  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3465  urease subunit beta  52.83 
 
 		 106 aa  120  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00430973  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1817  urease, beta subunit  48.67 
 
 		 122 aa  120  8e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2256  urease subunit beta  58.25 
 
 		 106 aa  120  9e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03310  urease, beta subunit  55.88 
 
 		 105 aa  119  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2313  urease subunit beta  52.25 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2356  urease subunit beta  52.25 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2012  urease, beta subunit  57.84 
 
 		 104 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1240  urease, beta subunit  53.92 
 
 		 113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2306  urease subunit beta  56.07 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0334  urease subunit beta  54.46 
 
 		 101 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2442  urease, beta subunit  56.44 
 
 		 101 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.549938  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2270  urease, beta subunit  58.82 
 
 		 113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2806  urease, beta subunit  60.95 
 
 		 105 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0478999  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2850  urease, beta subunit  60.95 
 
 		 105 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2833  urease, beta subunit  60.95 
 
 		 105 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0693  urease subunit beta  60.4 
 
 		 101 aa  118  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0190  urease, beta subunit  57.41 
 
 		 127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.32893  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3528  urease, beta subunit  56.19 
 
 		 116 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.603861  normal  0.242695 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3103  urease, beta subunit  58.65 
 
 		 112 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0986  urease subunit beta  60.4 
 
 		 101 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0582515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0955  urease, beta subunit  53.33 
 
 		 105 aa  117  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3075  urease subunit beta  59.41 
 
 		 101 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0269  urease subunit beta  55.45 
 
 		 101 aa  116  9e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1747  urease, beta subunit  58.42 
 
 		 101 aa  116  9e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.641327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0960  urease subunit beta  57.43 
 
 		 101 aa  116  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.657667  normal  0.124248 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0283  urease subunit beta  55.45 
 
 		 101 aa  116  9e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.209152  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2183  urease subunit beta  58.42 
 
 		 101 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09890  urease subunit beta  60.4 
 
 		 101 aa  115  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.807213  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0724  urease subunit beta  58.42 
 
 		 101 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2558  urease subunit beta  58.42 
 
 		 101 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3111  urease subunit beta  58.42 
 
 		 101 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2056  urease subunit beta  58.42 
 
 		 101 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1183  urease, beta subunit  56.44 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0391  urease, beta subunit  59.8 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3620  urease subunit beta  56.31 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0386  urease, beta subunit  57.43 
 
 		 101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1870  urease subunit beta  47.32 
 
 		 133 aa  115  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.646669  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0994  urease subunit beta  54.46 
 
 		 101 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03430  urease, beta subunit  58.82 
 
 		 144 aa  114  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0747  urease subunit beta  55.91 
 
 		 102 aa  114  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1428  urease, beta subunit  57.43 
 
 		 101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.767872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0308  urease subunit beta  57.43 
 
 		 101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.441813  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1953  urease subunit beta  57.43 
 
 		 101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3134  urease, beta/gamma subunit  58.42 
 
 		 132 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1313  urease subunit beta  56.67 
 
 		 164 aa  113  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1357  urease subunit beta  56.67 
 
 		 159 aa  113  8.999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.4189  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6190  bifunctional urease subunit gamma/beta  57.58 
 
 		 231 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0272769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4242  urease, beta subunit  55.45 
 
 		 101 aa  113  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08921  urease subunit beta  52.43 
 
 		 106 aa  113  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4894  urease, beta subunit  55.88 
 
 		 102 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1054  urease subunit beta  52.69 
 
 		 106 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1351  urease subunit beta  57.14 
 
 		 112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.568363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2683  urease, beta subunit  56.44 
 
 		 101 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171584  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19251  urease subunit beta  52.69 
 
 		 106 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1077  urease subunit beta  57.43 
 
 		 101 aa  112  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2772  urease subunit beta  53.92 
 
 		 111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1135  bifunctional urease subunit gamma/beta  56.44 
 
 		 231 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.380732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00888  probable urease (beta subunit) protein  52.48 
 
 		 102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3083  urease, beta subunit  56.73 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08941  urease subunit beta  51.46 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.349786  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2845  urease subunit beta  55.88 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2844  urease subunit beta  55.88 
 
 		 105 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29801  urease subunit beta  54.9 
 
 		 105 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0242  urease, beta subunit  58.93 
 
 		 115 aa  110  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>